Q5TC82  RC3H1_HUMAN

Gene name: RC3H1   Description: Roquin-1

Length: 1133    GTS: 7.343e-07   GTS percentile: 0.115     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 438      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPVQAPQWTDFLSCPICTQTFDETIRKPISLGCGHTVCKMCLNKLHRKACPFDQTTINTDIELLPVNSALLQLVGAQVPEQQPITLCSGVEDTKHYEEAK 100
gnomAD_SAV:      IE    M      V     HG VQNAM  C    I  T  K    E          A   H  M    M  M  RIAG H F    RI V#  C  T 
Conservation:  9567749975775745533554221357679777765633683566965666666363477627967477759554344312242621332522595234
SS_PSIPRED:             EEE  HHH            EE   HHHHHHHHHHH               HHH  HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HHHHH  H H           EEE   HHHHHHHHHH                HHH  HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              EE                 E    HHHHHHHHHHHHH             HHH  HHHHHHHHHH                HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                                 
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                      C  C               C H  C           C  D                                               
ZN_FING:                    CPICTQTFDETIRKPISLGCGHTVCKMCLNKLHRKACPFDQ                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KCVEELALYLKPLSSARGVGLNSTTQSVLSRPMQRKLVTLVHCQLVEEEGRIRAMRAARSLGERTVTELILQHQNPQQLSSNLWAAVRARGCQFLGPAMQ 200
gnomAD_SAV:           F   LF    RAS K  I  IP C V*        S PA     FH L  V   C * D     H  S     P                   
Conservation:  1957577668655532452424122262667969775747537666949993974996999999779999969996799979999799999977776467
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH       HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH H                 HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH       HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHH
DO_DISOPRED3:                   DDDDDDDDDDD                                                 DDDDD                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEALKLVLLALEDGSALSRKVLVLFVVQRLEPRFPQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVTKRDEDSSLMQLKEEFRTYEALRREHDSQIVQIAMEAGLRIAP 300
gnomAD_SAV:                N                   W    T   T                 #              SC   W# L   T R  T #   V  
Conservation:  9676799999999966767999999799797599799999979999999999699666776667965655556435656576755666476565956767
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH  EEEE      HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH       HHHEEEEHHH            HHHHHHHHHHHH  EEE      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH      H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQWSSLLYGDQSHKSHMQSIIDKLQTPASFAQSVQELTIALQRTGDPANLNRLRPHLELLANIDPSPDAPPPTWEQLENGLVAVRTVVHGLVDYIQNHSK 400
gnomAD_SAV:      R            PV   V     T                     D  *   Q K#     S  G   SA          AHS  R  IH  R  GR
Conservation:  5766566597636779777977766664765666666975666657967762793376577367656643353834941333685258369677567676
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                  D                                                                  D
DO_SPOTD:                                                                       DDDDDDDD D                      DDD
DO_IUPRED2A:                    DDD                     D  DD D   D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGADQQQPPQHSKYKTYMCRDMKQRGGCPRGASCTFAHSQEELEKFRKMNKRLVPRRPLSASLGQLNEVGLPSAAILPDEGAVDLPSRKPPALPNGIVST 500
gnomAD_SAV:    T   EHPLL L   R ##   T   R   # GT    Y        #NII H  L K     F       V  TGVRR  S M     R TT     IT 
Conservation:  6537335335556955437676644657765346565555555365855777221712453313232121121222322121111011301201121211
SS_PSIPRED:                   HH  HHHHH               HHHHHHHHHH           HHH                                     
SS_SPIDER3:                 HH HHHHHHHH               HHHHHHHHHH                                                   
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                 D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D    DDDDDD   DDDD  DDDDDDDD DD DDDDDDDDDD   DDD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
ZN_FING:                   KYKTYMCRDMKQRGGCPRGASCTFAHSQE                                                           
MODRES_P:                                                                   S                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GNTVTQLIPRGTDPSYDSSLKPGKIDHLSSSAPGSPPDLLESVPKSISALPVNPHSIPPRGPADLPPMPVTKPLQMVPRGSQLYPAQQTDVYYQDPRGAA 600
gnomAD_SAV:     T  K   L*EI H   TI    RTGY  N   VF      C SR N   R   # VT   R   L VT IN   # LQ F  HA KRM   C VRQ V 
Conservation:  1211226448423221210042151101313133331211010204221142420111212124210110233121326344263222131443423122
SS_PSIPRED:                                        HHHH                                                            
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
SITE:                   R                                                                    R                     
MODRES_P:                                    S   S                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPFEPAPYQQGMYYTPPPQCVSRFVRPPPSAPEPAPPYLDHYPPYLQERVVNSQYGTQPQQYPPIYPSHYDGRRVYPAPSYTREEIFRESPIPIEIPPAA 700
gnomAD_SAV:    ALC R  #RK V   LSS R PL  Q L P S    LCVG  LSS RKC  D  N  E   H    T Y # C*LCS SC       Q G V      T 
Conservation:  2256232533323812222313251732212142226315242221243112311112212111133335534423123272443123044242542332
SS_PSIPRED:                                                                                      HHH               
SS_SPIDER3:                                                                                        HH              
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD      DD  DDDDDD DDDDDDDDDDD DDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDD DDD     DDD  DD    DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPSYVPESRERYQQIESYYPVAPHPTQIRPSYLREPPYSRLPPPPQPHPSLDELHRRRKEIMAQLEERKVISPPPFAPSPTLPPTFHPEEFLDEDLKVAG 800
BenignSAV:          S      E                                                                                       
gnomAD_SAV:         S      EKMK  H  S  L    TL  T TLCRW LT   TY   G  YH# E  # L     IV  L      A L    LA* S       #
Conservation:  2116221264431325243222342211732105111211111111151446453557174424242243433363346522312401432132201000
SS_PSIPRED:                                                      HHHHHHH HHHHHHH                                EEE
SS_SPIDER3:                                                      HHHHHHHHHHHHHHHH                      H H       EE
SS_PSSPRED:                                                       HHHHHH HHHHHHHHH                                E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DDDDDD      DDDDDDD    DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KYKGNDYSQYSPWSCDTIGSYIGTKDAKPKDVVAAGSVEMMNVESKGMRDQRLDLQRRAAETSDDDLIPFGDRPTVSRFGAISRTSKTIYQGAGPMQAMA 900
gnomAD_SAV:        SG  H       I S   R   TN  G GV       DM   EVMHLQ   R    #    E           Q    A*I   M  VV  V PVT
Conservation:  1121131145776444324534433623231111210121121420212120261395111257796999643967967855683463265222435121
SS_PSIPRED:    EE                                   EEE        HH   HHHHH                       EE                 
SS_SPIDER3:    EEE                             E    EEEE         HHHHHHHHH                HH    E                  
SS_PSSPRED:                                         EEE         HHHHHHHHHH                                         
DO_DISOPRED3:  DD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                  DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D                  D    DD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DD DD    D  DDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                    S                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PQGAPTKSINISDYSPYGTHGGWGASPYSPHQNIPSQGHFSERERISMSEVASHGKPLPSAEREQLRLELQQLNHQISQQTQLRGLEAVSNRLVLQREAN 1000
gnomAD_SAV:    SE  HAT V V   NL V  S         R   A RR  #  DKM V  A N#           R*   ERW    C     HVR G T   G E    
Conservation:  1310233322125631211223832113223211343326156433012310211111121124322252237618816511111111121122143311
SS_PSIPRED:              HHH                            HHHEEEHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HH                                   HHHHH          HHHHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                    HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDD     DD   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLAGQSQPPPPPPPKWPGMISSEQLSLELHQVEREIGKRTRELSMENQCSLDMKSKLNTSKQAENGQPEPQNKVPAEDLTLTFSDVPNGSALTQENISLL 1100
gnomAD_SAV:    N  #   L RS R E      #Q       RL    R   Q  NL      GV   P ANR     ER  *K  LG     S RE          SLG  
Conservation:  1121522332211146320133466648932742521311211131211113120111110001122011110111322112513233131111112341
SS_PSIPRED:    HHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH                 HHH EEE           HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH                   HHHHHHHHHHHHHHH HH                                    HHH  E E        HHHH   H 
SS_PSSPRED:    HHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH       HHHH                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D   DD D D D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30   
AA:            SNKTSSLNLSEDPEGGGDNNDSQRSGVTPSSAP 1133
gnomAD_SAV:        G#P    NA E       *G*  IR  V 
Conservation:  114223203232111011102113221111111
SS_PSIPRED:    HHH HH                           
SS_SPIDER3:                                     
SS_PSSPRED:                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:               S