Q5VIR6  VPS53_HUMAN

Gene name: VPS53   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog

Length: 699    GTS: 2.366e-06   GTS percentile: 0.771     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 332      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMEEEELEFVEELEAVLQLTPEVQLAIEQVFPSQDPLDRADFNAVEYINTLFPTEQSLANIDEVVNKIRLKIRRLDDNIRTVVRGQTNVGQDGRQALEEA 100
gnomAD_SAV:    VVQ  V     K  T  L MS    V# H#LS *    #  CS     S V  AG*  V V   MS V    K VN   #S L  HMDM R  W V  K 
Conservation:  4211121112121101201020011121199947447422477776777477777467546667757644476597746947975476977795379799
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH             HHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH        HHHHHHHHHH             HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBDDDDDD                  DDD  DDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                        D   DDDDDDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKAIQQLFGKIKDIKDKAEKSEQMVKEITRDIKQLDHAKRHLTTSITTLNHLHMLAGGVDSLEAMTRRRQYGEVANLLQGVMNVLEHFHKYMGIPQIRQL 200
gnomAD_SAV:          FS RF G  E V    E#M    #  M   Q  HR A  VN   Y       INA K    Q  CR A  F    V IM    EF#  L  W  
Conservation:  9499599959979999997777579977979999999997799967999999999779967977799799966677967995799999479697699999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                         DD DDDD                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            DD D D                                                                     
MODRES_A:               K                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SERVKAAQTELGQQILADFEEAFPSQGTKRPGGPSNVLRDACLVANILDPRIKQEIIKKFIKQHLSEYLVLFQENQDVAWLDKIDRRYAWIKRQLVDYEE 300
PathogenicSAV:                               L                                                                     
gnomAD_SAV:       M S    F     V    G        L E  S  *GV   T      S  K  #  V  L            E S  #    H  *  H   YCG 
Conservation:  9999766939994999799795996976963676757757776664697466767667775566757766767676677777779796797977449756
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                            DD DDDDD                                                                  
DO_SPOTD:                                DDDDDD                                                                    
DO_IUPRED2A:                            DDDDDD                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KYGRMFPREWCMAERIAVEFCHVTRAELAKIMRTRAKEIEVKLLLFAIQRTTNFEGFLAKRFSGCTLTDGTLKKLESPPPSTNPFLEDEPTPEMEELATE 400
BenignSAV:                                I                                              R       S                 
gnomAD_SAV:      SCL  C  SV    V KC  A   QI    HI T      F     H  I  D   P C PS A INA V  P #S QC S#L K     KL Q  M 
Conservation:  6655577069345767653977566379576965997999999999779797776777695969399353225625144123688676622251352113
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH H   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                              HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                           DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                  S             T         
MODRES_A:                                                                 K                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGDLDQPKKPKAPDNPFHGIVSKCFEPHLYVYIESQDKNLGELIDRFVADFKAQGPPKPNTDEGGAVLPSCADLFVYYKKCMVQCSQLSTGEPMIALTTI 500
gnomAD_SAV:     R       S # #SQ YS  AN  Q    M V##EEE FR  #NQ A #   R S N S#N ED M    T F  C  NS#L   #  SRG  FSVSIT
Conservation:  4232344563737579997569777767767976777799677769953677479696432676777799999999999797999979999999777666
SS_PSIPRED:    H                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD                                  DDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                      DDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD                                        DDDDDDDDDDD                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQKYLREYAWKILSGNLPKTTTSSGGLTISSLLKEKEGSEVAKFTLEELCLICNILSTAEYCLATTQQLEEKLKEKVDVSLIERINLTGEMDTFSTVISS 600
BenignSAV:                                                             N                                           
gnomAD_SAV:      N FQA #*Q  # S   IASN  E S NN      DP      V D Y V    NMTG   # S     NFRQ    #   *V# #    M  I V  
Conservation:  9996979994769797999565465797967996976546566772799695967999999979997997699779961394677695474697626766
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH               HHHH H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH              HHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                                     S                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SIQLLVQDLDAACDPALTAMSKMQWQNVEHVGDQSPYVTSVILHIKQNVPIIRDNLASTRKYFTQFCVKFANSFIPKFITHLFKCKPISMVGAEQVRWT 699
PathogenicSAV:                                                                                               R    
BenignSAV:                                                                                            V           
gnomAD_SAV:         L    TT E     #  V    M#      SCI#  V Y    I   H S P     V    I     CV T      NG# S T      *RM
Conservation:  777777796936979794777766997999999999997977476776776666577769777977766746776769746565777777777994966
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHH   HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHH H  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                         
DO_IUPRED2A: