Q5VUJ6  LRCH2_HUMAN

Gene name: LRCH2   Description: Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2

Length: 765    GTS: 5.16e-07   GTS percentile: 0.049     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 139      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKL 100
gnomAD_SAV:                D      E      K    S RG E       SP         S           L     K      Y  V  V  T V  F     
Conservation:  1101111111111111111111111111111111111111111111111111111111111001001000000000011011011001001010100101
SS_PSIPRED:                                                                                   HHHHHHHHHH  EEE      
SS_SPIDER3:                                                                                EE HHHHHHHHHH   EE    E 
SS_PSSPRED:                               E                                                  HHHHHHHHHHH  EEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDFPGSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGK 200
gnomAD_SAV:    G    G               CY              I H                              I              I    V  V      
Conservation:  0101011110000000346555425351542232464254545585514844332634642533688573359336638986885566876245863544
SS_PSIPRED:                  EEE          HHHHH     EEE          HHHHH     EEE          HHHH     EEE          HHHHH
SS_SPIDER3:     E           EE E          HHHH      EEE    EEEE  HHHH      EEE          HHHH    EEEEE   E  E  HHHHH
SS_PSSPRED:                   E           HHHHH     EEE       H HHHHHHHH   HHH       H HHHHH     EEEE        HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        DD   DD DD   D                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKY 300
gnomAD_SAV:                       R                        EA   F     G    K         R      G        T M           
Conservation:  5316869657786644883546382596668466826236535431678435657786632773356371366152866886537657784884575688
SS_PSIPRED:         EEE          HHHHH     EEE          HHHH     EEE          HHHHH     EEE         HHHHHH    EEHHH
SS_SPIDER3:         EEE          HHHH      EEE      EE  HHHH    EEEE     E E  HHHH      EEEE         HHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    H     E          HHHHHH     HHH          HHH      EEE          HHHHH H  EEEEE         HHHHHH  EEEHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDDD DDDDDDD    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKD 400
gnomAD_SAV:                  T    A   Q     FA G                     Q Q  A  S       V P        PA   N   V         
Conservation:  9445464125823545484431351325324443443332233438686677496764643596878538654756533663216251212321132122
SS_PSIPRED:                        HHH          HHH                                                                
SS_SPIDER3:                        HHH                         EE     EEEE                                         
SS_PSSPRED:    H H                                                                                                 
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEVYDFVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNK 500
gnomAD_SAV:          A   I  L   D  ST F       M        FW    I    K QTG   P   E             V       Q     Y       E
Conservation:  3311213112132111113132212232242534311245333221501411212221111114233235146531643565342311141142311221
SS_PSIPRED:     HH       HH                HHH        HH         HHHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH   
SS_SPIDER3:       E                      HE             H  HH   HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH HH H              
SS_PSSPRED:                                                        HHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQDSDNANMSTQSPVSSEEYD 600
gnomAD_SAV:                  D        NRR        #N  L   F  VT H  K  WRT M# *      V            Y   D      A       
Conservation:  2322222222222332221111111111232111113001421132233265565234466332523121422211213011312210332311111221
SS_PSIPRED:        HH                     HH                HHH    HHH HHHHHHHHHHHH                                
SS_SPIDER3:                                                 HHHH   H   HHHHHHHHH                                   
SS_PSSPRED:         HHHH                                         HHHHH HHHHHHHHHH                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAV 700
gnomAD_SAV:    I      G           HL    C    T    K   K FQ  G   QR  I    T     S  V                V  C     LIS S  
Conservation:  1222113359986596471513243233379677688768755994744249634683696518646473596986688685955488583657666465
SS_PSIPRED:                        HH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH    HHHHHHHH       EE       
SS_SPIDER3:                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH   EEEEHHH    EEEEEEE      
SS_PSSPRED:                                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH    HHHHHHH       EEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD  DDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        D        

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            PKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA 765
gnomAD_SAV:            Q          E    P       Q VFK Q    I              G H Y  
Conservation:  44433448546666764466646444315454244432334235423333333311211113001
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHH   HHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:        HHHHHH HHHHHHHHHH    HHH   HHHHH     HHHHHHHHHHH            H
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: