Q659C4  LAR1B_HUMAN

Gene name: LARP1B   Description: La-related protein 1B

Length: 914    GTS: 1.296e-06   GTS percentile: 0.353     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 443      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MENWPTPSELVNTGFQSVLSQGNKKPQNRKEKEEKVEKRSNSDSKENRETKLNGPGENVSEDEAQSSNQRKRANKHKWVPLHLDVVRSESQERPGSRNSS 100
gnomAD_SAV:    T S    R  MK  LH I    T   RK          I     R  W RQ  RLS  ITDE   LG EL  VD  R    RF  I  D *  L  GK  
Conservation:  3238988595632113231111143110013434405221225355513221312220024231303115754363565682543131212322225013
SS_PSIPRED:          HHHHHHH    HHH        HHHHHH                          HHH                   HH                
SS_SPIDER3:           HHHHH                 H  H                             HHH    H H          H                 
SS_PSSPRED:                                   HHH                                                                  
DO_DISOPRED3:  D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                 S                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RCQPEANKPTHNNRRNDTRSWKRDREKRDDQDDVSSVRSEGGNIRGSFRGRGRGRGRGRGRGRGNPRLNFDYSYGYQEHGERTDQPFQTELNTSMMYYYD 200
gnomAD_SAV:    K          D  I  I#N E*      GH  ITN GNQ  #T#R   V*#  Q QR R*     Q  SY   D   Y  S  KA LR V   IIC C#
Conservation:  4201111111122311313252161212430472354485332254115764554656646333111132732232211101020001112121437553
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGTGVQVYPVEEALLKEYIKRQIEYYFSVENLERDFFLRGKMDEQGFLPISLIAGFQRVQALTTNLNLILEALKDSTEVEIVDEKMRKKIEPEKWPIPGP 300
gnomAD_SAV:     D   PM  M  V F QCM HR D   RAQ  GQ C  WR  #      VTPM   RH  SVA     V K   H  #  # N NVS Q#     LV  S
Conservation:  3223133524631585485556868888238868886885587018685537574746555655420552266439246643414583524833867423
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH    HHHH       EEHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHH                          
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH     HHHH      E HHHHH  HHHH H   HHHHHHHHH      E   HE              
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:   D                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                             DDDDDDD   DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                     DD     DDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPRSVPPTDFSQLIDCPEFVPGQAFCSHTESAPNSPRIGSPLSPKKNSETSILQAMSRGLSTSLPDLDSEPWIEVKKRHQPAPVKLRESVSVPEGSLNQL 400
gnomAD_SAV:    L HT   IH F    R Q    RD  L K  VA  S#     CS   R   S   V ## F      GLDS*R             K L  LT V  Y#P
Conservation:  1112122697466658789697401111222213442021401000012021211125426222534634175354356312323131111110000012
SS_PSIPRED:             HHH                                      HHHHHHH              HHHH                    HH   
SS_SPIDER3:               H                                      HHHHHH                E                           
SS_PSSPRED:                                                      HHHHH                                             
DO_DISOPRED3:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD               DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD    DDDDDD
MODRES_P:                                S T     S    S  S                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CSSEEPEQEELDFLFDEEIEQIGRKNTFTDWSDNDSDYEIDDQDLNKILIVTQTPPYVKKHPGGDRTGTHMSRAKITSELAKVINDGLYYYEQDLWMEED 500
BenignSAV:                                                                  R                                      
gnomAD_SAV:    R L GA H   G     GF   E* H   GLT KGL       N K        T      H   Q DI VYQ#  A      TSV  C      R AD 
Conservation:  0101224466648578895623126324226473565384462966667884657734745238424434234445724345485788464546881200
SS_PSIPRED:           HHHH HH HHHHHHH                   HHHH EEEEEE                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                   HHHHHHH                 E      EEEEEE                         HHHHHHHHH HHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                   HHHHHH                    HHH  EEEEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                DDDDDDDDDDDDDDD DD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD   D  DDDDDDD       DDDDDDDDDDDDD D      D         DDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                      D
MODRES_P:                                T    S   S                 T                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENKHTAIKQEVENFKKLNLISKEQFENLTPELPFEPNQEVPVAPSQSRQGGVQGVLHIPKKDLTDELAQKLFDVSEITSAAMVHSLPTAVPESPRIHPTR 600
gnomAD_SAV:     DRYA    GDK     H M E P GK     S #    F I  L*    SL* M   T N  S     T         V#VI L T   R    #RRIK
Conservation:  2100101313353656443453435224455111222364420320111111111111111121224202211112011302414354264255011022
SS_PSIPRED:      HH    HHHH     EEE HHHHH                                      HHHHHHHH  HHH  HHHHH                
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHH       HHHHH                                      HHHHHH         HH                   
SS_PSSPRED:                         HHHHHH                                     HHHHHH          HHH                 
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD DDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        D             DDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPKTPRTPRLQDPNKTPRFYPVVKEPKAIDVKSPRKRKTRHSTNPPLECHVGWVMDSRDRGPGTSSVSTSNASPSEGAPLAGSYGCTPHSFPKFQHPSHE 700
BenignSAV:                                                                H                                        
gnomAD_SAV:    I RA GASM  G  E    H A E A #TE     E   KNNASH             YCAL IF I A  D     TS   I  GA     RS  LF# 
Conservation:  4446454644344235687766475221451234887985552398383869966656584644443144232634323114314446257636365643
SS_PSIPRED:                                                        EEE                                          HHH
SS_SPIDER3:                       E                           EEEEEEEE                                          HHH
SS_PSSPRED:                                                                                                      HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD     D DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLKENGFTQQVYHKYRRRCLSERKRLGIGQSQEMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFRQLAWEDAKENYRYGLECLFRFYSYGLEKKFRREIFQDFQEET 800
gnomAD_SAV:      R  ACA H   # C*   R   HV NVR     P  G   L   HYVS  I      R     EK  GC   R      ** K    *KV  H #   
Conservation:  5666488655364464425626653485745544455256755676666664666686514545535344433469347355743456514673677566
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  H  H   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKDYESGQLYGLEKFWAYLKYSQSKTQSIDPKLQEYLCSFKRLEDFRVDPPISDEFGRKRHSSTSGEESNRHRLPPNSSTKPPNAAKPTSTSELQVPINS 900
gnomAD_SAV:    ER#CK  L #   N G     F* E RPV    *   R  QK    CDGS   NASR     #     NSC  V R YCA S S T LAT C  * L  F
Conservation:  2284426534886666875996413131542364148137435587354452132122331011122110224113021111001100011101011000
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH   HHHH                                                      
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH    HHH                                                       
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH                                                            
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10    
AA:            PRRNISPESSDNSH 914
gnomAD_SAV:    SI S  LG  G  R
Conservation:  00000011001111
SS_PSIPRED:                  
SS_SPIDER3:                  
SS_PSSPRED:                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD