Q6A162  K1C40_HUMAN

Gene name: KRT40   Description: Keratin, type I cytoskeletal 40

Length: 431    GTS: 2.652e-06   GTS percentile: 0.842     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 273      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTSDCSSTHCSPESCGTASGCAPASSCSVETACLPGTCATSRCQTPSFLSRSRGLTGCLLPCYFTGSCNSPCLVGNCAWCEDGVFTSNEKETMQFLNDRL 100
BenignSAV:                                         A                                               S               
gnomAD_SAV:        FFP  W     DM  SFSRV GY M I#R# SA   CGYR LG PP  HR SVG   R     G NS FA YY     EES RSGN M R R   P
Conservation:  9262122002344410122121136243121223722112323254253333113225206433233420322352336347627375974799799699
SS_PSIPRED:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASYLEKVRSLEETNAELESRIQEQCEQDIPMVCPDYQRYFNTIEDLQQKILCTKAENSRLAVQLDNCKLATDDFKSKYESELSLRQLLEADISSLHGILE 200
BenignSAV:      N                                                  M                                               
gnomAD_SAV:    TG   NAH  G# KT  Q   R    H NSV  #   H    T    RE  RM T   TFVIEV S# V  GG R T K   C #H  V EVNR   F  
Conservation:  9399759619930944994594573302241267777379347947947999497755954774994677447955795399772733627233744791
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD DD                                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                CEQDIPMVCPD                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELTLCKSDLEAHVESLKEDLLCLKKNHEEEVNLLREQLGDRLSVELDTAPTLDLNRVLDEMRCQCETVLANNRREAEEWLAVQTEELNQQQLSSAEQLQG 300
BenignSAV:                                       H                             Y                    D              
gnomAD_SAV:        G    K   V   K   S ET #  V#S FCK I NC #  PNA  A    K  YK#H*HYAM    #C   K    I   KV    PPRV   L 
Conservation:  4644753447643736425745743292467229327797595775332933964259477937792455377755747733747794677156447445
SS_PSIPRED:    HHH     HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                            QLGDRLSVELDTAPTL                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CQMEILELKRTASALEIELQAQQSLTESLECTVAETEAQYSSQLAQIQCLIDNLENQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEINTYWGLLDSEDSRL 400
BenignSAV:       T                                                                                                 
gnomAD_SAV:      I    PN#RD VP   FRE   PI P  # A   K E N *  *V R MNI   KR # C*NMD#  RGH A PEL TQP     M *     *E   
Conservation:  7917439767244595777499327257779724997479535666494997377069729646799976773499956759929926955997279274
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30 
AA:            SCSPCSTTCTSSNTCEPCSAYVICTVENCCL 431
BenignSAV:          L                         
gnomAD_SAV:    FR  RL    #   RD R V   R I  Y  
Conservation:  2242432011212233311223275322311
SS_PSIPRED:                         EEEE      
SS_SPIDER3:                                 EE
SS_PSSPRED:                         EEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A: