Q6A163  K1C39_HUMAN

Gene name: KRT39   Description: Keratin, type I cytoskeletal 39

Length: 491    GTS: 2.041e-06   GTS percentile: 0.668     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 272      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDTKGCTTTNSPSTPCQNCSRITNVSTISSNNGCHPGGLTVNNCQPAGHVLRIPWDQGCQPTPRFCRKPIYLMNNFNARFSLDDCSWYGEGINSNEKETM 100
gnomAD_SAV:      P C# A  P    S  S   A A I C   SY  #  #L  RE    L    * RD  H  H SH  FC  DD KVH P A  NR   #   KK  ST
Conservation:  7440311211143230333342432020141215201112233331231123102022302133321171441121110111111021146462377547
SS_PSIPRED:                              EEE                                                                  HHHHH
SS_SPIDER3:                             EE                      E E                                           HHHHH
SS_PSSPRED:                              EEE                                                                  HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                           D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:    DDDD                                                                                             D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QILNERLANYLQKVRMLERENAELESKIQEESNKELPVLCPDYLSYYTTIEELQQKILCTKAENSRLVSQIDNTKLTADDLRAKYEAEVSLRQLVESDAN 200
gnomAD_SAV:    KT  KC      QM*  **  V P*Y   D G RDF  VR  N      TAK  L*FF   PK Y V *H# S N     MK#  K KL Q#    * VS
Conservation:  4199079647645950963693199046521214114326747267723672975799799999997967979677769937676347393654465745
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD  D                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                        DDDDDDD                                                                        
REGION:                                       SNKELPVLCPD                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLKQILNVLTLGKADLEAQVQSLKEELLCLKNNHKEEINSLQCQLGERLDIEVTAAPSADLNQVLQEMRCQYEPIMETNRKDVEQWFNTQIEELNQQVVT 300
gnomAD_SAV:    S Q*    P M   N   K      KP     K  QK  YF*R #     V G          I L R Y    MT # HR  KP   MK QK#S H   
Conservation:  5744695294924777737339756966177247247414973979474397744466597634953597499653969357375994393629567524
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                   QLGERLDIEVTAAPSA                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSQQQQCCQKEIIELRRSVNTLEVELQAQHRMRDSQECILTETEARYTALLTQIQSLIDNLEAQLAEIRCALERQNQEYEILLDVKSRLECEITTYRSLL 400
BenignSAV:                                             M                                         M                 
gnomAD_SAV:    GPH#      K T   HN    K K   R Q#  F KY  M   DHFM#   * H  TN M #     Q#  Q *    GT M I  QM SDVI  CN P
Conservation:  3337773373732696431449647759674373776236296564953773939197334927746663376677567459964763995993593499
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                             D                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            ESSDGKRPCYPRATKCEPSPWTSCKSGAIESTAPACTSSSPCSLKEHCSACGPLSRILVKICTITKEIKDGKVISSYEHVQPCFIIRPAKV 491
BenignSAV:                                                            Q                                   
gnomAD_SAV:    Q LG NP    CT E    ARIF MPR RG MTS W F YAR F   S D R  FQ   ES   IR#T   RD Y  * MH   TF TDR 
Conservation:  6326243432373221233221212223153133201322200013121132074277467275937439977769477979676362332
SS_PSIPRED:    H                                                        EEEEEEEEEEEE  EEEE   EEEE EEE     
SS_SPIDER3:                                                             EEEEEEEEEEEE  EEEE E EEEEEEEE     
SS_PSSPRED:    H                                                       EEEEEEEEEEEE    EEEEEE  EEEEEE     
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDDDDD DDDD
DO_SPOTD:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     
DO_IUPRED2A: