Q6DD88  ATLA3_HUMAN

Gene name: ATL3   Description: Atlastin-3

Length: 541    GTS: 1.745e-06   GTS percentile: 0.557     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 234      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLSPQRVAAAASRGADDAMESSKPGPVQVVLVQKDQHSFELDEKALASILLQDHIRDLDVVVVSVAGAFRKGKSFILDFMLRYLYSQKESGHSNWLGDPE 100
BenignSAV:               S                                                                                         
gnomAD_SAV:    I  SR L   SLK  G # * #   AGH  M *        N   F G  FR   *NF  M  * V S *   P V G   #C    *G    D# #  K
Conservation:  2222222222222212220001132545551323323151842147224751314443246565758584668554665456422010002220958102
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH               EEEEEEE    EEEE HHHHHHHH         EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH HH            
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH      H        EEEEEEE    EEEE HHHHHHHH         EEEEEEE      HHHHHHHHHHH  H  H           
SS_PSSPRED:        HHHHHH                EEEEEEE    EEEE HHHHHHHHH        EEEEEEE       HHHHHHHHHHHH H             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDDD    DD                                                                   DDD   
NP_BIND:                                                                         GAFRKGKS                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EPLTGFSWRGGSDPETTGIQIWSEVFTVEKPGGKKVAVVLMDTQGAFDSQSTVKDCATIFALSTMTSSVQIYNLSQNIQEDDLQQLQLFTEYGRLAMDEI 200
PathogenicSAV:                                                                                            C        
BenignSAV:                             I                                                                           
gnomAD_SAV:     L  R F            H    ILA DR    T S  P   E T  G     VS  T  V IV    H HS       H V  #   S  SC   V  
Conservation:  3772883887656568485446435523151341455548345664863454575656476676445846565564545557643553333755333432
SS_PSIPRED:                     EEEEEEEEEEEE     EEEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHH HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    EEEEEEEEEEEEE      EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      EEEEEEEEEEE     EEEEEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        DDDDD                                                                                          
NP_BIND:                    PET                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQKPFQTLMFLVRDWSFPYEYSYGLQGGMAFLDKRLQVKEHQHEEIQNVRNHIHSCFSDVTCFLLPHPGLQVATSPDFDGKLKDIAGEFKEQLQALIPYV 300
gnomAD_SAV:       S RIV I       S  D         #F  C RA  R*    H  Q    LR    N#Y I  LA         EA    T#       *   L  
Conservation:  1155543647555765468540752286006725454530155454535626533672141768784885376755052635147206941281075515
SS_PSIPRED:    H  HH   EEEEE              HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH     EEE       HHH       HHH  HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          EEEEEEEE    E    EEE HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHH             HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHEEEE      EE      HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     EEE                      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                   RD                                                         VATS                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNPSKLMEKEINGSKVTCRGLLEYFKAYIKIYQGEDLPHPKSMLQATAEANNLAAAASAKDIYYNNMEEVCGGEKPYLSPDILEEKHCEFKQLALDHFKK 400
PathogenicSAV:                                      R                                                              
BenignSAV:                       W                                          V                                      
gnomAD_SAV:      TF* T    S LN   QAI#  C   F   *R      R   L  G  S    T#  ENV C SI GF # D #   S F    QYKLR V#M   R 
Conservation:  8142182597847336684496568869568778638957668849766877757562654172416513379439745712931260121105501623
SS_PSIPRED:    H HHH   EEE  EEEEHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HH EEEEE  EEE HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H       EE   EEE HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                            DD                                                         
MODRES_A:                                                                                                K         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TKKMGGKDFSFRYQQELEEEIKELYENFCKHNGSKNVFSTFRTPAVLFTGIVALYIASGLTGFIGLEVVAQLFNCMVGLLLIALLTWGYIRYSGQYRELG 500
gnomAD_SAV:       I  E   LC     # KT   H  L   S  NDII   *AL A  M    S LV   IS V F    H LSYVA I    P  C  V      CV  
Conservation:  4999982365139415841551325136186925886725577884863443247426444334741135133622453353353294647768443237
STMI:                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40 
AA:            GAIDFGAAYVLEQASSHIGNSTQATVRDAVVGRPSMDKKAQ 541
BenignSAV:     R                V                  N    
gnomAD_SAV:    RD    STSM    PA VD  IE      A   TP#N  S 
Conservation:  13880263245551102100110022000022220200200
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                 DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                            
MODRES_P:                                        S