Q6P9F5  TRI40_HUMAN

Gene name: TRIM40   Description: Tripartite motif-containing protein 40

Length: 258    GTS: 2.258e-06   GTS percentile: 0.739     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 141      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MIPLQKDNQEEGVCPICQESLKEAVSTNCGHLFCRVCLTQHVEKASASGVFCCPLCRKPCSEEVLGTGYICPNHQKRVCRFCEESRLLLCVECLVSPEHM 100
BenignSAV:     I                                                                                                   
gnomAD_SAV:    I   *E  * AA S   R N  D MNS *RLFC P F       V  PRD     YQ H  K E  R  V LH      S RKD S P   KF   LK I
Conservation:  4142022012232865955165445342746377305722421123023211563762435414671442700554561055812235440262025471
SS_PSIPRED:       HHHHHH       HHHH    EE     HHHHHHHHHH HH                          HHH     EEEE     EEEHHH   HHHH
SS_SPIDER3:                   HHH      EE     HHHHHHHHHH HH       E      EE HHH     E  HH  EEHHHE     EEEEE    HHH 
SS_PSSPRED:       HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH                             HHH  HHHHHHHHH HHHHHHH   HHH 
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  
ZN_FING:                    CPICQESLKEAVSTNCGHLFCRVCLTQHVEKASASGVFCCPLC         GTGYICPNHQKRVCRFCEESRLLLCVECLVSPEHM

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SHHELTIENALSHYKERLNRRSRKLRKDIAELQRLKAQQEKKLQALQFQVDHGNHRLEAGPESQHQTREQLGALPQQWLGQLEHMPAEAARILDISRAVT 200
BenignSAV:                                              Q                                                          
gnomAD_SAV:      D   T  VFNQCE Q SCQG#  T  FT   Q # *  T    P    NYR   P  RL      K*E S  SK*  D   LVL  VV TF NFGTL 
Conservation:  1503633315335545461420342522201211421453214312343241302442444225152222423133223432220333123220342320
SS_PSIPRED:      EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        DD                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
ZN_FING:       SHHELTI                                                                                             

                       10        20        30        40        50        
AA:            QLRSLVIDLERTAKELDTNTLKNAGDLLNRSAPQKLEVIYPQLEKGVSELLLQPPQKL 258
BenignSAV:                   K                            K              
gnomAD_SAV:    RP#RPI YV  MTE    S V    N P TN     K#     KQR NK   PH   F
Conservation:  2421553257343636433387231347031120030002002011000100111100
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH               E  H H         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDDDDDBBB
DO_SPOTD:                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  D DDDDDDDDDDD