Q6PKG0  LARP1_HUMAN

Gene name: LARP1   Description: La-related protein 1

Length: 1096    GTS: 8.867e-07   GTS percentile: 0.175     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 390      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATQVEPLLPGGATLLQAEEHGGLVRKKPPPAPEGKGEPGPNDVRGGEPDGSARRPRPPCAKPHKEGTGQQERESPRPLQLPGAEGPAISDGEEGGGEPG 100
gnomAD_SAV:                          V                      E      S  L                                     K      
Conservation:  1111111111111111111111120010111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                  HHHHHHH                                                                               
SS_SPIDER3:                   HHHHH                                                                                
SS_PSSPRED:                    HHHHH                                                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                S              S          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGGGAAGAAGAGRRDFVEAPPPKVNPWTKNALPPVLTTVNGQSPPEHSAPAKVVRAAVPKQRKGSKVGDFGDAINWPTPGEIAHKSVQPQSHKPQPTRKL 200
gnomAD_SAV:         V     E        Q                     P Q Q  S       LL PL    I       S  K  KT    LLL A  L L C  
Conservation:  1111111111111110011110000001111111001111111111011324354521341462263445274238988595633113111111111430
SS_PSIPRED:                                                      HH                          HHHH                  
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                S                     S                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPKKDMKEQEKGEGSDSKESPKTKSDESGEEKNGDEDCQRGGQKKKGNKHKWVPLQIDMKPEVPREKLASRPTRPPEPRHIPANRGEIKGSESATYVPVA 300
BenignSAV:                                                                                                       M 
gnomAD_SAV:     A R L      KEN         T  L   R                     L  T V #  L  NR  #L H LDS# VL SGR VREFA  ICM MV
Conservation:  0134313445221225355514321312230124433131312576436366568254313231232222501422121111223231311111111111
SS_PSIPRED:         HHHH                          HH                                                               
SS_SPIDER3:          H H                                                                                           
SS_PSSPRED:          HHH                                                                                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                    S    S  T S  S                                                                        
MODRES_M:                                             R                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPTPAWQPEIKPEPAWHDQDETSSVKSDGAGGARASFRGRGRGRGRGRGRGRGGTRTHFDYQFGYRKFDGVEGPRTPKYMNNITYYFDNVSSTELYSVDQ 400
gnomAD_SAV:    TH S #E V  A ASRD    KW   C   SVVW  S  HAQ # HV#VCCQ  IG P   # S Q Y  M E #MA  VYD IC    I       MN 
Conservation:  1111252152626222231472364585314225411576455475664634131113273223221110112000222221437553332314462463
SS_PSIPRED:                                                                                                       H
SS_SPIDER3:                                                                                                       H
SS_PSSPRED:                                                                                                       H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDD        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            
MODRES_P:                             S  S                                                T                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLKDYIKRQIEYYFSVDNLERDFFLRRKMDADGFLPITLIASFHRVQALTTDISLIFAALKDSKVVEIVDEKVRRREEPEKWPLPPIVDYSQTDFSQLL 500
gnomAD_SAV:         H  C       #          S    Y               #       V   I   N   #IN  AH   K D     LV            
Conservation:  2585485656868888238868886886587128685537574746555665421552266439357644414584524833877321121326974666
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHH      EEHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHHH     EE   EEEE                    HHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   HHHH   H HHH E     EEHHHHH HHHHHHH   HHHHHHHHHH   EEE   EEE                         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH       EEHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH          EE                         
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                               DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                          D            D               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NCPEFVPRQHYQKETESAPGSPRAVTPVPTKTEEVSNLKTLPKGLSASLPDLDSENWIEVKKRPRPSPARPKKSEESRFSHLTSLPQQLPSQQLMSKDQD 600
gnomAD_SAV:    S      H     V  L     CSI  GAS S  D H  I  N       E       KL    # FAPQ   P   #            Y HPT   K 
Conservation:  5878969740112222222344202140100112021221125426232534634275355356323324142121111111000011013011111122
SS_PSIPRED:                                                HH                                            HHH     HH
SS_SPIDER3:                                                                                              HHHH    HH
SS_PSSPRED:                                                                                              HHH    HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                      S   S    T                     S                                          S         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EQEELDFLFDEEMEQMDGRKNTFTAWSDEESDYEIDDRDVNKILIVTQTPHYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWAEKFEPEYS 700
gnomAD_SAV:         YLV E  L  I  W  S     V  CHD        #        Y VH   A N       C    T     V                   HF
Conservation:  4466648578895624212632433747356648447296666788565773475533842443423444572435548578846564688120131101
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH HHHHH                      HHHHHEEEEEE                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHH      HHHHH                     HHHHHHEEEEEE                        HHHHHHHHHHHH  HHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHH     HHH                       HHH  EEEEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDD     DDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DD  
MODRES_P:                                S   S                 T                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVDPNQEVPPGPPRFQQVPTDALANKLFGAPEPSTIARSLPTTVPESPNYRNTRTPRTPRTPQLKDSSQTSRF 800
gnomAD_SAV:    H          LSV  WK        #R            W     M    D   VTS* #S TC   #A S   K C S ISH#SW    RGLN     
Conservation:  0142435365654445343523455512222246443032011142122420222211213124244542652551111224456454645354235687
SS_PSIPRED:      HHHHH         HHHHH                          HHHH         HH                                    EE
SS_SPIDER3:        HHHH        HHHHH                          HHHHHH                                              E
SS_PSSPRED:                    HHHH                                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_IUPRED2A:    DD  DD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                             T                                         S  TT   S  Y    T  T  T        T   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YPVVKEGRTLDAKMPRKRKTRHSSNPPLESHVGWVMDSREHRPRTASISSSPSEGTPTVGSYGCTPQSLPKFQHPSHELLKENGFTQHVYHKYRRRCLNE 900
gnomAD_SAV:       M  R#       L       L             FH    #     F S   M A S#F R      R H       Q K L   I Y  H      
Conservation:  7664762214512348879855523983838699666565846444532326343231243144463576363656435666488655364464435626
SS_PSIPRED:    E  EE                       HH  EEEE                                       HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE E                           EEEEE                                        HHHHHH     H HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                     EEE                                        HHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_SPOTD:               DDDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDD                       
MODRES_P:                             S                    T S   S S       S   T  S                                
MODRES_A:                                                                                                 K        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKRLGIGQSQEMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFKQLALEDAKEGYRYGLECLFRYYSYGLEKKFRLDIFKDFQEETVKDYEAGQLYGLEKFWAFLKYS 1000
gnomAD_SAV:    Q C #V            #      R  E IC       P        C        CI            R     M   H #     P          
Conservation:  6534857455444552567556766666646666865245455453454334693473557444566146736875662284436534887777876996
SS_PSIPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH H      HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KAKNLDIDPKLQEYLGKFRRLEDFRVDPPMGEEGNHKRHSVVAGGGGGEGRKRCPSQSSSRPAAMISQPPTPPTGQPVREDAKWTSQHSNTQTLGK 1096
gnomAD_SAV:    #   V TE    D  S CQ#    Q     S K    QYPM  R  SSA   Q #          FRH   LH SH FQ G #R R RW   I AE
Conservation:  414131542364148137435587454552132123331011112322512241131121110110011101021121000100001001021111
SS_PSIPRED:            HHHHHHHH    HHHH                                      HHH                               
SS_SPIDER3:            HHHHHHHH    HHH                                       HHH               HH              
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHH                                                                              
DO_DISOPRED3:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                             S                 S                              S       
MODRES_A:                      K