Q6SPF0  SAMD1_HUMAN

Gene name: SAMD1   Description: Atherin

Length: 538    GTS: 6.377e-07   GTS percentile: 0.083     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 170      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGPPALPPPETAAAATTAAAASSSAASPHYQEWILDTIDSLRSRKARPDLERICRMVRRRHGPEPERTRAELEKLIQQRAVLRVSYKGSISYRNAARVQ 100
gnomAD_SAV:                     R  T#  AVTY    K                                                                   
Conservation:  1111111111111111111111521136133333563333453334446324535234455352242433144233222322333223531214243322
SS_PSIPRED:             HHHHHHH HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   EEEEE              
SS_SPIDER3:                 HH             HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   EEEEE E       H    
SS_PSSPRED:             HHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     DDDDDDDD                 DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DDDDDDDD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       D    DDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPRRGATPPAPPRAPRGAPAAAAAAAPPPTPAPPPPPAPVAAAAPARAPRAAAAAATAPPSPGPAQPGPRAQRAAPLAAPPPAPAAPPAVAPPAGPRRAP 200
gnomAD_SAV:      Q                                                                                                 
Conservation:  3223311311112311111113211212122111111121311112211121221111111110121022110111111000111112111111021111
SS_PSIPRED:                       HHHH                         HHHHHHHH            HHHH                            
SS_SPIDER3:                       HHHHH                    H H HHHHHH              H  HH                           
SS_PSSPRED:                       HHHH                   HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH                        
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:            T                                                     S                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPAVAAREPPLPPPPQPPAPPQQQQPPPPQPQPPPEGGAVRAGGAARPVSLREVVRYLGGSGGAGGRLTRGRVQGLLEEEAAARGRLERTRLGALALPRG 300
gnomAD_SAV:                                            W                                #      #     Q   G        R
Conservation:  1111111110001202241121022111121111232211111111111111111124331132211122221220213131114122312131223411
SS_PSIPRED:                                                    HHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                                                      HHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:                                                     HHHHHHHH                HHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                  S                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRPGRAPPAASARPSRSKRGGEERVLEKEEEEDDDEDEDEEDDVSEGSEVPESDRPAGAQHHQLNGERGPQSAKERVKEWTPCGPHQGQDEGRGPAPGSG 400
BenignSAV:                                            D                                                            
gnomAD_SAV:                      G E   IF E KQKEN DN NDKEN  KS  ML G CL D #Y K D  W L  V QM  V IR#RRY     R  LSL#T#
Conservation:  1111121221212021227511121211100113311111202212111112311111111120111111111333312111121000014210120212
SS_PSIPRED:                           HHH                                HHH                                       
SS_SPIDER3:                             H HH                                 H      HH HHHHHHH                     
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRQVFSMAAMNKEGGTASVATGPDSPSPVPLPPGKPALPGADGTPFGCPPGRKEKPSDPVEWTVMDVVEYFTEAGFPEQATAFQEQEIDGKSLLLMQRTD 500
gnomAD_SAV:    SS  LF V T RQ RIT#L#ARS  AF M   L     SA#HR S SYLS #R  S  LI        K    V          DE       V  # AG
Conservation:  0111111011312131231114444721134512111112201210211110210014532655457528633698467627722666765566554436
SS_PSIPRED:          HHH                                                 HHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      EEEE  HHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH                                                 H   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  E    EEEEE  H
SS_PSSPRED:          HHH                                                      HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH       EE  HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD           DD DDDDDDD DDDDD  D      

                       10        20        30        
AA:            VLTGLSIRLGPALKIYEHHIKVLQQGHFEDDDPDGFLG 538
gnomAD_SAV:      #S  V        # R V    K Q  N NSN I D
Conservation:  55566566976668766374636532483512121111
SS_PSIPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:     HH       HHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHH    EE HHHHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                 D  BBBB
DO_SPOTD:                                   DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          DD D   DDDDDDDD