Q6UN15  FIP1_HUMAN

Gene name: FIP1L1   Description: Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1

Length: 594    GTS: 3.865e-07   GTS percentile: 0.021     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 178      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDLAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETAENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTI 100
gnomAD_SAV:        KF     #  C  R   A A        M   NH T  V    A S KK  P    A         H     E P IKAE     N V    R   
Conservation:  3301010100310101010001112213333333333333333232412224531232222221242233323121112335256686656665673568
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHH        HHHHH           HHHH          HHHH                                         EEEE
SS_SPIDER3:      H HHHHHHHH        HHHHHH                         HHH                                          EEEE
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHH        HHH                                                                        EEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                          S S S           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDIKTGAPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLE 200
gnomAD_SAV:      V   VQP A   I T  V V    KACR AV   R     V A#V   LP  A      #T  H    Y         #  I  T S     LGI   
Conservation:  6567894666438744669977855462443442527969664364568464465647569799999998889888888988678959968868666987
SS_PSIPRED:    E                                                EE     HHH            HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EE                                      E     E  EE EH  HHHH            HH       HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                                        EEE                 HHH      HHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             DDDDDD                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD DDDDDD DDDDD     DD       DDDDDDDDDDDD D DD  DDD   DDDD DD                                   D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYG 300
gnomAD_SAV:         C AD  R K  I    S         S V   H       E A       V   L C     # L    P     S      T   I     P* 
Conservation:  3233343478843333333333333333333333396787545268732333294783553443855243233333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:        HHHH                                                                                            
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDD DD       DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAESPDLRRLPGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAP 400
gnomAD_SAV:      K   V         V      T*    Q T     M AP    TA G  S    LL     T LA     A          V      L  LT   V 
Conservation:  3333333562384979984444848868875345475666544443343422438464538665483428886845555454325745968454885245
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                           E                                                            
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:         S                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVAFPHLPGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNS 500
gnomAD_SAV:    S  V              CTVC#    S     F     L   F           G   # E G E    Q   Q     C       HE  LALG    
Conservation:  6835454446644436335344364643345753344333832246343465443986458475458584949797954694855555965484332633
SS_PSIPRED:                                                       HH HH                   HHH HHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:                                                      HHHH                            HHHHHH            
SS_PSSPRED:                                                      H HHHHHH                  HHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                               Y                                                                 S T S   S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90    
AA:            DEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGSEPAPEQESTEATPAE 594
gnomAD_SAV:        H  K    G C H  G   EKD   K LQ   K     Y  RI   C  N G #              G  AV   A     R KSI S 
Conservation:  5548684546344344554275444545557563443335554547676646646665465587666577658554453613443543322122
SS_PSIPRED:     HHHH HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH          HHHHHH                            
SS_SPIDER3:      HHHHHHHH  H                                                 H                               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                           S