Q6UWM7  LCTL_HUMAN

Gene name: LCTL   Description: Lactase-like protein

Length: 567    GTS: 2.242e-06   GTS percentile: 0.735     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 290      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSPEEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQTEGAWDQDGKGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILL 100
gnomAD_SAV:      S CFTSI    V    Q TTW*R    VCCCC N        M T D  M  T NK R  LGMREI RY RM   F   MT I  N#S*QI *     
Conservation:  1011000110013210011001000100001011213212504422322343344731455525459253412221400213741554781322293025
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                               
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EEE   HHHHHH           HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHH HHHHHH                    EE    H EE E           HHHHH H              HE    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E         EEE   HHHHH                                EE     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                     N                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RELHVNHYRFSLSWPRLLPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNVSMANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFS 200
gnomAD_SAV:      M I   Q   P# GVPH  NQ # M R*  K   N  G   R#    #MI QQ* P K      D      T  #L G*  R   V   LLR   #  
Conservation:  4252322627947976557260111148017414721344031101312243442345630441113571300342162254245412434363264543
SS_PSIPRED:    HH    EEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE   
SS_SPIDER3:    HH    EEEEEEEH  E    EE   E HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE   HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   E HEEH  
SS_PSSPRED:    HHH   EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                            N                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPRAMAEKGYETGHHAPGLKLRGTGLYKAAHHIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYAGDYP 300
BenignSAV:                M                           T                                                            
gnomAD_SAV:      QST G   KMR  VL P #HCIV  E ER # *  T T   * NM HGR  D L M  K N# ##M   KL N K TK  R   M GS DL * D  S
Conservation:  2712130055402014542010503271537646556414872731056015151556452227264032131051254041307025252156715495
SS_PSIPRED:      HHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     EEEEE           HHHHHHHHHHHHHH HHH   HHH    
SS_SPIDER3:     HHHHHHH HH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH    EEEEEEEEEE E     HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH      
SS_PSSPRED:     HHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                  N                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQT 400
gnomAD_SAV:     I RH   KE E   VK#LK      * E    D  N   FA  PA#  RGG    C R R   GP    P  Q    V        S    #    T  
Conservation:  1146106002211131002355174115311315629754545655334100100000102201514310117514311130351336054532414322
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH     EEEE  HHHHH             HHHHH  EEE            HHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH            HHHHHH      EEEEE  EEEEEE                 EEEEE                HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH     EE   HHHHH                      E             EEE  HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                         D D  D                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QYGDPPIYVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIA 500
gnomAD_SAV:     HS     AT   E     S     GR       H H I    TYVT  N#H      G SQR   *  S    HI#  NG   HFS V    H ET N 
Conservation:  2734514356479333000111427006114421442532400153333235224424634652044103576434231221237144062016213500
SS_PSIPRED:    HH    EEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEHHHHH  HHHH        EEEE            HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH    EEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE   E   E H    H  EEEEE            HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H     EEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE               EEEEEEEE            HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60       
AA:            NGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS 567
gnomAD_SAV:    KA#AS G   #               F  KT    T*I M* MI  A   RA TIG          N
Conservation:  4311100001111111111111111111112110112121211014011133222101111111111
STMI:                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:         HHH               HHHH     HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:         HHH HHHHHHH       HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    H          HHH             HHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                 DDDDDDDDDDDDDD                  D DDDDDDDDDDDDD  DDD
DO_SPOTD:                                                                     DDDD
DO_IUPRED2A: