Q6ZW05  PTHD4_HUMAN

Gene name: PTCHD4   Description: Patched domain-containing protein 4

Length: 846    GTS: 2.219e-06   GTS percentile: 0.728     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 470      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MCFLRRPGAPASWIWWRMLRQVLRRGLQSFCHRLGLCVSRHPVFFLTVPAVLTITFGLSALNRFQPEGDLERLVAPSHSLAKIERSLASSLFPLDQSKSQ 100
gnomAD_SAV:     R   ##R  E   #        GK   W  R   F#L LR    F LATD   A #  V  S *TK #  #V  LR    T   N   RI  V#RY   
Conservation:  6222222222222222223222111431111112402222264232213111221222212121202111303124102221111121012001111000
STMI:                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH HHHH       HHH       HHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:               HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH HH   E     HHHE      HHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH      HHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDD                                DDDDD DDD DD                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYSDLHTPGRYGRVILLSPTGDNILLQAEGILQTHRAVLEMKDGRNSFIGHQLGGVVEVPNSKDQRVKSARAIQITYYLQTYGSATQDLIGEKWENEFCK 200
gnomAD_SAV:        IY#S KC  M   F I ES  F S EN  ADGT  D   E  T   R QRRILDM# G HR# N DTG        I V      TR R G G F 
Conservation:  1020100110011211101020012000000104621512427640365999888622222243326636355435455301212135133228501941
SS_PSIPRED:    HH         EEEEEE      HHH      HH   HH                EE         EEEEEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE      E EEEEE      EEE     EEEEEEEEEEE         E   EE         EEEEEEEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:               EEEEEE      HHHHHH HHHHHHHHHH                         HHHHHHHEHEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIRKLQEEHQELQLYSLASFSLWRDFHKTSILARSKVLVSLVLILTTATLSSSMKDCLRSKPFLGLLGVLTVCISIITAAGIFFITDGKYNSTLLGIPFF 300
gnomAD_SAV:    F  N  D # GF        G  TE  TA   # G F  G M   ASD   G V   WHN     FV L        I# E #S# #E#F FI   VL  
Conservation:  3311521021241333356359125643540452246436525422353334364665838978949665353462587696545534475745465562
STMI:                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH   EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH  HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH H   EEEEEEEHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH   HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AMGHGTKGVFELLSGWRRTKENLPFKDRIADAYSDVMVTYTMTSSLYFITFGMGASPFTNIEAVKVFCQNMCVSILLNYFYIFSFFGSCLVFAGQLEQNR 400
gnomAD_SAV:    T         Q   RRLK  DS   NGKT      MI IC IIG    T  VTR  # A #AP  F          M S CVL   D #   G#KR  SH
Conservation:  3279873949969779966593767978382565847546735735734679577997994767749832446573569493559756699579669446
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    E    H   HHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HH      EEHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YHSIFCCKIPSAEYLDRKPVWFQTVMSDGHQQTSHHETNPYQHHFIQHFLREHYNEWITNIYVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQISDGANIINLLASDSP 500
gnomAD_SAV:    C  V  SQ L  K   C #  L IA# Y    M R KM AD*   V Q#FG Y #GC  #M    LAI  C T      #   K T RVS  S V #  #
Conservation:  6965696779636262167297624725431223204103342766336563684597897989996776997959967996896236354545754372
STMI:                                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:         EEE   HHHH    HHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH     H
SS_SPIDER3:       EEE E   HHH      EHEEEE                  HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH     H
SS_PSSPRED:       EEE     HHH       EEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH    
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_SPOTD:                                   DDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVSYAMVQQKYFSNYSPVIGFYVYEPLEYWNSSVQDDLRRLCSGFTAVSWVEQYYQFLKVSNVSANNKSDFISVLQSSFLKKPEFQHFRNDIIFSKAGDE 600
gnomAD_SAV:     I C K #E             I # I  L N IRGE G  SR   # F#  R    PN R  ND   NY TG  RNA F    Y R QDET    TVN 
Conservation:  7437513866598699989999799753999058936542532892339946375179310926223523951293229851457358269895442323
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE        HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH       HHH  HH HHHHH    HHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH      EEEEEE        HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH       H  HH H   HH     HHHHH   E       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH     EEEEE        HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH            HHHHHH       HHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SNIIASRLYLVARTSRDKQKEITEVLEKLRPLSLSKSIRFIVFNPSFVFMDHYSLSVTVPVLIAGFGVLLVLILTFFLVIHPLGNFWLILSVTSIELGVL 700
gnomAD_SAV:     SV V S H MSW  KNM        K  KT  F    Q VM   P #LV#RC SCAAL AV S  D  P   RN    TYS R       I   G VIV
Conservation:  1456898577797834435353215966995886335778669997977595634653495257336454583672464536654396365549657965
STMI:                                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:      EEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH     EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     EEEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHH     EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLMTLWNVDMDCISILCLIYTLNFAIDHCAPLLFTFVLATEHTRTQCIKSSLQDHGTAILQNVTSFLIGLVPLLFVPSNLTFTLFKCLLLTGGCTLLHCF 800
gnomAD_SAV:     V S  Y H  Y  T * TFA  LTV Y P    I  STAK NQK       R RE DV  T  CY#  F #F    L#   A  R      C II    
Conservation:  9758983726766858897354766584649564594663617993774159618945359322673456396248698982769796284325737966
STMI:          MMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH      HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                   N                                      

                       10        20        30        40      
AA:            VILPVFLTFFPPSKKHHKKKKRAKRKEREEIECIEIQENPDHVTTV 846
gnomAD_SAV:    L   M   L#     Y  E  #TE#  G  T  #     R PI  A
Conservation:  5799549685886633321331112224454664852555666934
STMI:          MMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH  EE       EE  
SS_SPIDER3:     HHHHHHHH         HH HHHHHHH               E  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH            EEE 
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDBBBBBDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                      DDDD