Q75T13  PGAP1_HUMAN

Gene name: PGAP1   Description: GPI inositol-deacylase

Length: 922    GTS: 1.405e-06   GTS percentile: 0.404     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 380      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFLHSVNLWNLAFYVFMVFLATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQ 100
BenignSAV:                                                                   T                                     
gnomAD_SAV:      F  L    #  CI IIL VA   * AL  VAKK   V HL  H#D  EM   E  T C  TC F  H K YC  G   I  M    FY  R #  CE 
Conservation:  2221201101122120111121221011010111020100000011110662854533327636586867661664424171538487468676567456
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                    
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEE   EEEE             EEEEEEE     HHH         EEEE      HHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       E  EEEEE EEEEE     E      EEEEEEEE    H           EEEE      HHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHH   EEEEEE      HHH        EEEE       HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRSIGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKHDLINLLITQ 200
BenignSAV:        V                                                                                                
gnomAD_SAV:     #FV CL   EE  TN EN  # L    D    T CS N   *   LYK #    R # V A T ENMT V   LS         M    D  M#  T  
Conservation:  7895796997886333233967587766689988789879269626754757479369533226925966778889967999945642933156457698
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH       EEEEEEE      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEE HHHHHHHHHHH      HHHEEEEEE 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH       E EEEE E   HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEE   HHHHHHHHHH      H HEEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH         EEEE     HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEE  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                                                               S                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATPHVAPVMPLDRFITDFYTTVNNYWILNARHINLTTLSVAGGFRDYQVRSGLTFLPKLSHHTSALSVVSSAVPKTWVSTDHLSIVWCKQLQLTTVRAFF 300
gnomAD_SAV:         V      H      # I KC    #QRV         R Q   IC   PSV    R IR        A   *       V#          G   
Conservation:  8789258963391463699137722921251258564796799569789898953752611312554663537834655458668779778595558665
SS_PSIPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE                        EEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHHHHHHH H      EEEEE                        EEEEE           HHHHHH HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE                         EEEEE       E      EHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLIDADTKQITQNSKKKLSVLYHHFIRHPSKHFEENPAIISDLTGTSMWVLVKVSKWTYVAYNESEKIYFTFPLENHRKIYTHVYCQSTMLDTNSWIFAC 400
gnomAD_SAV:              #R   #  T         #  Y K      P      IC            FD  K M     #       SPLC    L          
Conservation:  8865225386614223734873789546735133411112324242316327534553622344312357254933372236636845426432496578
SS_PSIPRED:    HHH          HHHHHHHHHHHHHH            EE       EEEEEE EEEEEEE     EEEEEE      EEEEEEEE        EEEEE
SS_SPIDER3:    HHH          HHHHHHHHHHHHHH            E       EEEEEEEEEEEEEE      EEEEEE     EEEEEEEEE        EEEEE
SS_PSSPRED:    HHH          HHHHHHHHHHHHHH                    EEEEEEEEEEEEEE      EEEEE         EEEEEE        EEEEE
DO_DISOPRED3:                                         DD                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INSTSMCLQGVDLSWKAELLPTIKYLTLRLQDYPSLSHLVVYVPSVRGSKFVVDCEFFKKEKRYIQLPVTHLFSFGLSSRKVVLNTNGLYYNLELLNFGQ 500
gnomAD_SAV:    M    K   R    * T       C #     C   F     #   H I LAIG      G  HL*F #          G       D H S G P  E 
Conservation:  1223528123289612486853283325361452247734514532341553648855223331324475446758353434155558737263534825
SS_PSIPRED:    E      EE        EE     EEEEEHHH   EEEEEEEE       EEEEEEE     EEEEE   HHHH   EEEEEE     EEEEEEE     
SS_SPIDER3:    E                E      EEE  HHH    EEEEEEE      EEEEEEEEE   E EEEE   HHHH    EEEEE    EEEEEEEE     
SS_PSSPRED:    E               HHH     EEEE        EEEEEEE       EEEEEEE      EEE             EEEE     EEEEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:       N                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IYQAFKINVVSKCSAVKEEITSIYRLHIPWSYEDSLTIAQAPSSTEISLKLHIAQPENNTHVALFKMYTSSDCRYEVTVKTSFSQILGQVVRFHGGALPA 600
BenignSAV:                                                                                         E               
gnomAD_SAV:    KHP L VSM  E    R  V I    R    S     T  TAP  A     RV *A S     V  I MT YRQHK  #     E       YYV V  S
Conservation:  5897846261529210344325575427795398342243265245544598244426332141826665439385746458535689944855521595
SS_PSIPRED:     EEEEEEEEEE           EEEEE         EE       EEEEEEE         EEEEEEEE    EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:     EEEEEEEEEEE       E  EEEEEE       EEEE      EEEEEE          EEEEEEEE     EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEEEEEEEEE      HHH  EEEEE                  EEEEE            EEEEEEE     EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                               N                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVVSNILLAYRGQLYSLFSTGCCLEYATMLDKEAKPYKVDPFVIIIKFLLGYKWFKELWDVLLLPELDAVILTCQSMCFPLISLILFLFGTCTAYWSGLL 700
BenignSAV:                              H                                                                          
gnomAD_SAV:    * I DT    K   *      G   H  V YE   LHT     # #  PF#        GI     SETI  I    *   V *    L MFA CC    
Conservation:  7344336853439413511152433310241234467663524332236443257321721628813823111203141345653754596457684425
STMI:                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH        HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHH      HHHH H HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSASVRLLSSLWLALKRPSELPKDIKMISPDLPFLTIVLIIVSWTTCGALAILLSYLYYVFKVVHLQASLTTFKNSQPVNPKHSRRSEKKSNHHKDSSIH 800
gnomAD_SAV:     FT   #    * V  G A F E NRTMLR  S   S   V     W  P M      C   I     NV A     A  S  C      FSL    L# 
Conservation:  4222532383333251552232121321311223222261344424977554232443733775252222222120121121011212031101121102
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH       H H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H                 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDD                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDD       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HLRLSANDAEDSLRMHSTVINLLTWIVLLSMPSLIYWLKNLRYYFKLNPDPCKPLAFILIPTMAILGNTYTVSIKSSKLLKTTSQFPLPLAVGVIAFGSA 900
BenignSAV:                                                                                       A                 
gnomAD_SAV:    Y #  TSN    FC Y  L   P S          H      N  I YR S    V #  L VV       # VT     RSA   LF   IAM V    
Conservation:  1423111341447269134227334443622765457236546213939984422243532322464432311423734522421344534524335333
STMI:                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMM
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHEHEE    E        HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                     DDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20  
AA:            HLYRLPCFVFIPLLLHALCNFM 922
gnomAD_SAV:     S* FL  A  S IFPT G  V
Conservation:  4454321432224245224321
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                        
DO_SPOTD:                           D
DO_IUPRED2A: