Q7Z494  NPHP3_HUMAN

Gene name: NPHP3   Description: Nephrocystin-3

Length: 1330    GTS: 2.257e-06   GTS percentile: 0.739     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 15      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 635      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGTASSLVSPAGGEVIEDTYGAGGGEACEIPVEVKPKARLLRNSFRRGAGAAAGAGPGSLPRGVGAGGLLGASFKSTGSSVPELEYAAAEYERLRKEYEI 100
PathogenicSAV: T                                                                                                   
gnomAD_SAV:    V S    LRS   #LMD#  RV S    Q        DL      L    VTV   LR  LHELV    M V LN  VLL QK  HGV   D  K   D 
Conservation:  7112232202331111120121312333211221232323431323322233333333333333335532333334452244436133421443443334
SS_PSIPRED:                                EE        HH  HHH                          HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHE
SS_SPIDER3:           E      EE         EE EE     HHHHHHHHHHH                       E  E        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                  EEE         EEEE  EE  HHHHHHHHHHH                        EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:      D              D       D                        DD  DDD                                          
LIPID:          G                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FRVSKNQELLSMGRREAKLDTENKRLRAELQALQKTYQKILREKESALEAKYQAMERAATFEHDRDKVKRQFKIFRETKENEIQDLLRAKRELESKLQRL 200
BenignSAV:                                                      V                                                  
gnomAD_SAV:      A   EA SF# C      A     W Q H   RM     * E     G C* V   P   DESET  T  #  G NNQ  F       K  DN R   
Conservation:  3732123432311232132413243434234456666764967454665456665565356739564656695697777777779999779799574967
SS_PSIPRED:    EEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H   H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:              D     D                         DDD  D                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:              DDDDDD   DD                                      D          D             D              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QAQGIQVFDPGESDSDDNCTDVTAAGTQCEYWTGGALGSEPSIGSMIQLQQSFRGPEFAHSSIDVEGPFANVNRDDWDIAVASLLQVTPLFSHSLWSNTV 300
PathogenicSAV:                                   R                                                                 
gnomAD_SAV:         H   SV  G   S A    T I #K #ACR# RR RY *    R     #LA   R M   AS    S      G  NS EAAA S R   N  L
Conservation:  5499734545266967742722462535465917457775594796469794479797969649779997975779973957677664745633777657
SS_PSIPRED:    HH   EE             EE      EEEE           HHHHHH HH                     HHHHHHHHHHHH       HHHH  EE
SS_SPIDER3:    HH   E              EEEE    EEEE            HHHHHHH                 H    H  HHHHHHHHH       HHH   EE
SS_PSSPRED:    HHH                 EEE     EEEE              HHH                           HHHHHHHHHHH           EE
DO_DISOPRED3:           D  DDDDD                           DDDDDDD D DD DDDDDDD                                    
DO_SPOTD:                 DDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:          D  DDDD DDDDDD                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RCYLIYTDETQPEMDLFLKDYSPKLKRMCETMGYFFHAVYFPIDVENQYLTVRKWEIEKSSLVILFIHLTLPSLLLEDCEEAFLKNPEGKPRLIFHRLED 400
PathogenicSAV:                              K                             T                         S          H   
gnomAD_SAV:          K      VA     H   F S RK   C     C  TE                C           GV *   VVGL  S #  R# NVRH G 
Conservation:  7663516167316522832163429322892384852241951302102013753767698535665343445142674785865634346445654032
SS_PSIPRED:    EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE         HHHHHHHHHH     EEEEEEE   
SS_SPIDER3:    EEEEE     HHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH HEEHHHHHHH      HHHHHHHHH      EEEEEE   
SS_PSSPRED:    EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH        HHHHHHHHH      EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKVSSDSVQQLIDQVSNLNKTSKAKIIDHSGDPAEGVYKTYICVEKIIKQDILGFENTDLETKDLGSEDSIPEEDDFGDVLWDIHDEQEQMETFQQASNS 500
gnomAD_SAV:     T I     K   EI      I     VQA    K*IH       N T  NMP    AE *  NF GKN   G GGL   P #MY K K LDS      *
Conservation:  1002312233544642023431838352608122484023302653466865741402314032010422112532259779728897993844836413
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHH   HH    EE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHH   H     EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHH       EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH                                 HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:         D DDDDDDDD                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_IUPRED2A:                            D                                    DDDDDDDDD          DD        DDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AHELGFEKYYQRLNDLVAAPAPIPPLLVSGGPGSGKSLLLSKWIQLQQKNSPNTLILSHFVGRPMSTSSESSLIIKRLTLKLMQHSWSVSALTLDPAKLL 600
gnomAD_SAV:    TR  A     HCF       G  L FFM        CF  *   K     #RKAP        SV SG  FA VM * #  V *     P  IP   N  
Conservation:  2225575863329666766758689887784888866688688643694246436586998926374967448557964569587564494335792947
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHH        EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHH        EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEFPRWLEKLSARHQGSIIIVIDSIDQVQQVEKHMKWLIDPLPVNVRVIVSVNVETCPPAWRLWPTLHLDPLSPKDAKSIIIAECHSVDIKLSKEQEKKL 700
PathogenicSAV:                                        E                                                            
gnomAD_SAV:        C*    P H   GTM I   VY    I  QV   L T AM   I I  S  A  L  #  L  R HSI    # P V  VY      F E     V
Conservation:  9799799979646577576679997965554766859979999788965999897799479988885896885314332461244011321533586545
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE    HHHHHHH HHH       EEEEEEE       HHH   EEE     HHHHHHHHHHHH        HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH      EEEEE  H  HHHHHHHHHH        EEEEEEE  HH HHHHH    EEE    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE       HHHHHHHH       EEEEEEE     HHHHHH  EEE     HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERHCRSATTCNALYVTLFGKMIARAGRAGNLDKILHQCFQCQDTLSLYRLVLHSIRESMANDVDKELMKQILCLVNVSHNGVSESELMELYPEMSWTFLT 800
PathogenicSAV:                                                                                 D        P          
gnomAD_SAV:     *QYCF I YI  #  V S #TTC    D  GEMFR Y P      F  FA  FLWQ  V Y   K T K  YPL     DM    MIQPH K  R LS 
Conservation:  6355553335345656444634410100203502613532545534773428322214402404501554366451397895594953444643222154
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH H H   HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH      HHHHHH      HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLIHSLYKMCLLTYGCGLLRFQHLQAWETVRLEYLEGPTVTSSYRQKLINYFTLQLSQDRVTWRSADELPWLFQQQGSKQKLHDCLLNLFVSQNLYKRGH 900
gnomAD_SAV:    P   G  T    S     PK  #   G    WQ     SL   C       YI *     E  TN  GVS  SR ERI     N    ##        EQ
Conservation:  4344181242452339986395838836363355521100032474656068407841338899288995884464525139605868956786996999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHHH    HHH  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH    HHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FAELLSYWQFVGKDKSAMATEYFDSLKQYEKNCEGEDNMSCLADLYETLGRFLKDLGLLSQAIVPLQRSLEIRETALDPDHPRVAQSLHQLASVYVQWKK 1000
PathogenicSAV:                                                                         Q                           
gnomAD_SAV:        V C   I   R PV  KN N   P D HWK K# T  F  VC IW * V Y     E T L  #C Q Q    E N# K  RP     NE M REE
Conservation:  9639937974696973599379837991574135262331296597799749879799559766977779769766979799499479997956655679
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGNAEQLYKQALEISENAYGADHPYTARELEALATLYQKQNKYEQAEHFRKKSFKIHQKAIKKKGNLYGFALLRRRALQLEELTLGKDTPDNARTLNELG 1100
PathogenicSAV:                                                                                                P    
BenignSAV:                                                                              H                          
gnomAD_SAV:     SD      *V G   S HAV    A PKFK    S   H  D  # R K T      QTV      HR #  H QT R         I    QAFSDRD
Conservation:  6559977779979739695935911474796575376656466565526353433648623556834258459467575777696536647476677797
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DD               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLYYLQNNLETADQFLKRSLEMRERVLGPDHPDCAQSLNNLAALCNEKKQYDKAEELYERALDIRRRALAPDHPSLAYTVKHLAILYKKMGKLDKAVPLY 1200
PathogenicSAV:                                         P                                                           
gnomAD_SAV:     V#*V   VQ  ER   H   I  *    H  VS H    P   RD EE  N     H  P   W HTFP H S S H M   T  C# I     #IS C
Conservation:  7776999765574267269967956379149699799699799744944353296269746968764675557757676477974977426633463776
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                             D                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELAVEIRQKSFGPKHPSVATALVNLAVLYSQMKKHVEALPLYERALKIYEDSLGRMHPRVGETLKNLAVLSYEGGDFEKAAELYKRAMEIKEAETSLLGG 1300
PathogenicSAV:                     V                              R                                                
gnomAD_SAV:      VI T*  Y      R  IV     A      N I#G SS A        RMRQK H*  G Q HS    C   Y V  V      VAR KEV   VDR
Conservation:  6756599799994999979999999796476764407979996376777657653297977779766667467366775965797567666657445355
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DDDDD

                       10        20        30
AA:            KAPSRHSSSGDTFSLKTAHSPNVFLQQGQR 1330
BenignSAV:         C                         
gnomAD_SAV:    QTS C  L A M T   VYY   SRR    
Conservation:  672713773675143513104101311421
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH    
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH   HH H     
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH   
DO_DISOPRED3:                       DDDDDDBBB
DO_SPOTD:                           DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD   DDDDDD            DDDD