Q86TB9  PATL1_HUMAN

Gene name: PATL1   Description: Protein PAT1 homolog 1

Length: 770    GTS: 1.082e-06   GTS percentile: 0.260     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 280      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFRYESLEDCPLDEDEDAFQGLGEEDEEIDQFNDDTFGSGAVDDDWQEAHERLAELEEKLPVAVNEQTGNGERDEMDLLGDHEENLAERLSKMVIENELE 100
gnomAD_SAV:       D   VY R     V       D  K  E  N     D      P    C        S#           V        GD      N  LT     
Conservation:  2222213455345556654235364656776565584525653798666946954664444221011210201312515212233864564255244662
SS_PSIPRED:                              HHHH HHH           HHHHHHHHHHHHH                 HHHH   HHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:                               HHH               HHHHHHHHHHHH                    H    HHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:                                                 HHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDD  D   
MOTIF:                                                                                              LAERLSKMVI     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPAIMRAVQTRPVLQPQPGSLNSSIWDGSEVLRRIRGPLLAQEMPTVSVLEYALPQRPPQGPEDDRDLSERALPRRSTSPIIGSPPVRAVPIGTPPKQMA 200
gnomAD_SAV:     S  T VM       T        T N     KQ Q SVF P            L TSRH     G    #   KL         S            T 
Conservation:  8866525031103022322245566843322643421235122342394473656244411115326486566966548968869757549778898621
SS_PSIPRED:     HHHHH                         HH      HH      HHH                 HHH                              
SS_SPIDER3:     HHHHHH               HHHH   HHHHHH              HHH                                                
SS_PSSPRED:                                          HHH      HHHHH                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
MODRES_P:                                                                                  STS    S         T      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPSFTQQILCPKPVHVRPPMPPRYPAPYGERMSPNQLCSVPNSSLLGHPFPPSVPPVLSPLQRAQLLGGAQLQPGRMSPSQFARVPGFVGSPLAAMNPKL 300
BenignSAV:                                                                                                 F       
gnomAD_SAV:    LLTIP   M L SFR #SSV #C   SC   I LK# Y IS    V         AL  HRR  H  R T     Q C     Q       AF V   R 
Conservation:  1413568346836777864232564357377479637633433353245842332567547799656573622255363538482554455554274679
SS_PSIPRED:       HHH                           HHH                       HHHHH                             HH    H
SS_SPIDER3:       H H                             H                       HHHH HH                           HH   HH
SS_PSSPRED:       HHHH                                                    HHHHHHHH                               HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD     DDD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                   S                      
MODRES_M:                      R     R                                       R                    R                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQGRVGQMLPPAPGFRAFFSAPPSATPPPQQHPPGPGPHLQNLRSQAPMFRPDTTHLHPQHRRLLHQRQQQNRSQHRNLNGAGDRGSHRSSHQDHLRKDP 400
BenignSAV:                                                     V                                                   
gnomAD_SAV:       Q     S  S  H    V  PT      Q#A         K  #SI  L  I      H*        I  RRW  S S      Q  D VN QR  
Conservation:  6975455352333598557533243266341141253233321423222444345464947674934475967477744993736213511126201796
SS_PSIPRED:    H                                      HHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    H                                                         HHHHHHHHH    HH                    HH     
SS_PSSPRED:    H                                                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                                                                                          R               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YANLMLQREKDWVSKIQMMQLQSTDPYLDDFYYQNYFEKLEKLSAAEEIQGDGPKKERTKLITPQVAKLEHAYKPVQFEGSLGKLTVSSVNNPRKMIDAV 500
gnomAD_SAV:    C S VW Q         LI   N  A  G     H       P V  A# SE   R C   TA       Q# E#        R SI   S    I   L
Conservation:  9779544577496455755679977766997977665567671243451126245533466766746634426545674449666676777799977753
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HHHHH                         EEEEEEE
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH       H         EEE      EE E      EEEEEE
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHH                            E   
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         D
DO_SPOTD:      DD            DDD  D         DDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:   DDDD          DDD                          D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTSRSEDDETKEKQVRDKRRKTLVIIEKTYSLLLDVEDYERRYLLSLEEERPALMDDRKHKICSMYDNLRGKLPGQERPSDDHFVQIMCIRKGKRMVARI 600
gnomAD_SAV:     A WN N D     A         T   IH         Q C  P  G GQRV  GG   N   I      R  RK  L   Q    LS Q    I  H 
Conservation:  3435435564344333654435543654469668566658746253264461343335512302552352331226763474353456548988664564
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEHEEEHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEEEE   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEEE  HH HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDDDDDDDDDDD                                               
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD                                                         DD                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPFLSTEQAADILMTTARNLPFLIKKDAQDEVLPCLLSPFSLLLYHLPSVSITSLLRQLMNLPQSAATPALSNPHLTAVLQNKFGLSLLLILLSRGEDLQ 700
gnomAD_SAV:         A EV   FVAIV       NN V HK      N   V  CR   LT   F Q V       P     STY#NVMV         F    H  V  
Conservation:  4566312552355545565842848982887683593253513523544145435564624463632222114244014446444445532585345333
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH         HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH               HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H H  HHHHHHHHHHHHH HHHH          HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH                HHEHE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHH HHHH         HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70
AA:            SSDPATESTQNNQWTEVMFMATRELLRIPQAALAKPISIPTNLVSLFSRYVDRQKLNLLETKLQLVQGIR 770
gnomAD_SAV:      A   *   S R M    TP *   W   TD   A   SA         F Q            A   *
Conservation:  3330113212223522352253444614532352251115224133444544342613533653512102
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH          HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH        HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                        
DO_SPOTD:                                                                        DDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDD