Q86UP8  GTD2A_HUMAN

Gene name: GTF2IRD2   Description: General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2A

Length: 949    GTS: 1.873e-06   GTS percentile: 0.608     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 279      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQVAVSTLPVEEESSSETRMVVTFLVSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGCAFVNARTDFQKDFAKYCVAEGLCEVKPPCPVNGMQVH 100
gnomAD_SAV:              A               M   K            A      Q  M     K                   Y T # S   T  S     IR
Conservation:  7755524347131333653776656739677677447354446566473554334434723534531361636356512702221040434130031220
SS_PSIPRED:      EEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE  EEEEEE     EE   HHHHHHHHHHHHHH             EEE 
SS_SPIDER3:        EE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE EEEEEE    EEEEE    HHHHHHHHHHH           E   EE 
SS_PSSPRED:      EEEEE            EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEE   EEEEE   HHHHHHHHHHHHH             EEE 
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGETEILRKAVEDYFCFCYGKALGTTVMVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFQHPENYDLATLKWILENKAGISFIINRPFLGPESQLGGPGMVTDAE 200
gnomAD_SAV:      KM      A G   YYHDNV              PQ  L  IA*  L           Y SI         V           A           VG 
Conservation:  3562515639934373276566774332464966443242263063777472355372262624734666364567724474611402336111113342
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHEEHHH      EEEEE  HHHH     EEEEE               HHHHHHHHH    EEEEE       HHH           
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHH HHHEH  H   EEEEE  HHHH     EEEEE     EEE       EHHHEHHE      EEEEE                    
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  EEEEE  HHHHHHH  EEEE                HHHHHHHHHH   EEEEEE                    
DO_DISOPRED3:                                                                                                    BB
DO_SPOTD:                                                                                             DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                           DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSIVSPSESCGPINVKTEPMEDSGISLKAEAVSVKKESEDPNYYQYNMQGSHPSSTSNEVIEMELPMEDSTPLVPSEEPNEDPEAEVKIEGNTNSSSVTN 300
gnomAD_SAV:     YVA                   S       I       E           R                                      R     N   
Conservation:  4210442172232166379354262222203236627355226102114330022110401121342354333233232143333357376110421121
SS_PSIPRED:                              EEEEEEEE                         EEEEE                     EEEEE          
SS_SPIDER3:                  EE        EEEEEEEEEEE        EE              EEEEE                      EEEE          
SS_PSSPRED:                               EEEEEEE                      HHHHHHEE                     EEEEE          
DO_DISOPRED3:  BB  BBBBBBBBBBBBBB                      DD   BBBBBBBBB                BDBBBBBBBDDBBDDBBBBB          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DD         DDDDDDDDDD           DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SAAGVEDLNIVQVTVPDNEKERLSSIEKIKQLREQVNDLFSRKFGEAIGVDFPVKVPYRKITFNPGCVVIDGMPPGVVFKAPGYLEISSMRRILEAAEFI 400
gnomAD_SAV:              I                                                         M           DA                  
Conservation:  7646645726547346636533363279676677976277667797747469998699977669779967597969969999679746955799779549
SS_PSIPRED:          EEEEEEEE    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EE    EEEE    EEE       EEE   EEEHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:          EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EE  E  E      EEE      EEEE   E  HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:           EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E   EEEEE   EEEE      EEEE   EEEHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:   DD      DDDD           DDDDD                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KFTVIRPLPGLELSNVGKRKIDQEGRVFQEKWERAYFFVEVQNIPTCLICKQSMSVSKEYNLRRHYQTNHSKHYDQYMERMRDEKLHELKKGLRKYLLGS 500
gnomAD_SAV:      I               P  V         R     ##KG   S Y  R     L  #H   C    # INR H# TGI HYK F K R    N R   
Conservation:  9997588688665543566646373716744793575733435363776763455937777677794727433443423116315424670381235232
SS_PSIPRED:    EEEEE              EE       HHHHHHEEEEEEE    EEEEE       HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EEEEE      EE       E     EEHHHHHEEEEEEEE    EEEEE   EEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHE                     HHHHHHHHHHEEEEEE    EEEEE       HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                   D                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                           DDD DD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDTECPEQKQVFANPSPTQKSPVQPVEDLAGNLWEKLREKIRSFVAYSIAIDEITDINNTTQLAIFIRGVDENFDVSEELLDTVPMTGTKSGNEIFSRVE 600
BenignSAV:                  H                                                                                      
gnomAD_SAV:    *  K  K N*M        EF M  A         N C  M C     L V  VM          C H  N   G TQ #  M A#MA   SK   LH# 
Conservation:  2210223211132212300021225245242141135458343637795955656755453765677777722534397683546456234723361244
SS_PSIPRED:         HHH                 HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EE      EEEEEEE         HHHHH         HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHH E              HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEE E       HHHHH           HHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHEEHHH         HHHHH           HHHHHHH
DO_DISOPRED3:        BBB BBBBBDBDDDBBB                                                                             
DO_SPOTD:                   DDDDDDD                                                                                
DO_IUPRED2A:          DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSLKNFCIDWSKLVSVASTGTPAMVDANNGLVTKLKSRVATFCKGAELKSICCIIHPESLCAQKLKMDHVMDVVVKSVNWICSRGLNHSEFTTLLYELDS 700
gnomAD_SAV:    #    S  EL T  RM  S I VVM# S RFI   *   VK F VE    V Y   L    T  V     T M A F SCV  WR      K     P  
Conservation:  3361331438345454655849482401387634444542103241243524876745378131845367823642384375578485318254838463
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHH EEHH      EEE    HHHHHHHHHHHH   HH   EEEEE HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HHHHEEE       EE     HHHHHHHHHHHH     HEEEEEEE  HHHH HH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHHHE     EEEE    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QYGSLLYYTEIKWLSRGLVLKRFFESLEEIDSFMSSRGKPLPQLSSIDWIRDLAFLVDMTMHLNALNISLQGHSQIVTQMYDLIRAFLAKLCLWETHLTR 800
gnomAD_SAV:         RC M   C TCRF       F      Y            C    QE  Y   VM       L  *E  R DP  CE  QV  TT FVC  R M 
Conservation:  4665646253459867836935665545663184344624343634034326556545351566262226653234743444132582366166655531
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHH H  EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NNLAHFPTLKLASRNESDGLNYIPKIAELQTEFQKRLSDFKLYESELTLFSSPFSTKIDSVHEELQMEVIDLQCNTVLKTKYDKVGIPEFYKYLWGSYPK 900
gnomAD_SAV:    DS T   AV    K  #H  S LSQMS            L  ** KV VL  L  MNT  G     V           R   H  VT     C C G*S 
Conservation:  2462586445233001232315243421912561165245311513504743884215423231453854586332033233432633381327423472
SS_PSIPRED:      HH   HH              HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHH         HH   HHHHHHHHH  HH
SS_SPIDER3:            EEE          HHHHHHHHHHHHHHH    E     EEE       EHHHHHHHHHHHHE  E   EEE         HHHHHH    HH
SS_PSSPRED:          HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH    EEE         HHHHHHHHH  HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        5
AA:            YKHHCAKILSMFGSTYICEQLFSIMKLSKTKYCSQLKDSQWDSVLHIAT 949
gnomAD_SAV:    * R  T          FY   S                          M
Conservation:  4304355374496795486468446645433225131201311142121
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHH        EEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   H HHHH       EEEEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH        EEE  
DO_DISOPRED3:                                       BBBBBBB    B
DO_SPOTD:                                                       
DO_IUPRED2A: