Q86VQ0  LCA5_HUMAN

Gene name: LCA5   Description: Lebercilin

Length: 697    GTS: 1.062e-06   GTS percentile: 0.251     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 377      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGERAGSPGTDQERKAGKHHYSYLSDFETPQSSGRSSLVSSSPASVRRKNPKRQTSDGQVHHQAPRKPSPKGLPNRKGVRVGFRSQSLNREPLRKDTDLV 100
BenignSAV:                            S A                                       Q                                  
gnomAD_SAV:    VE KS G DA RGGR     D  S#A  S   FR# L G    G #G QS E  I     P#HGRQ S  RS S  T  *A IPPR  S  L W  #E I
Conservation:  5212110221222102212212265422211191145201212100120011111413211212113103411212320315046234333331662334
SS_PSIPRED:                                                                                                    HHHH
SS_SPIDER3:                                                                                                    H HH
SS_PSSPRED:                                                                                                     HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
MODRES_P:            S                                     S                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TKRILSARLLKINELQNEVSELQVKLAELLKENKSLKRLQYRQEKALNKFEDAENEISQLIFRHNNEITALKERLRKSQEKERATEKRVKDTESELFRTK 200
gnomAD_SAV:    ARQS  T    MS   S I  P           TY  S         SN  E K  #   TLHR SK ATF  C  R     Q# K   E RG     P 
Conservation:  7554864665684474634363524313333875375346277868935526664555375249448434856577655644522644353443472312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                               D    D  DDDDDDDDD  D  DDD                               DDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FSLQKLKEISEARHLPERDDLAKKLVSAELKLDDTERRIKELSKNLELSTNSFQRQLLAERKRAYEAHDENKVLQKEVQRLYHKLKEKERELDIKNIYSN 300
PathogenicSAV:                     V                                                                               
gnomAD_SAV:            #  P Y  A# EVPE    SQ T    K      LQ V  T  G  *  PSDT   *Q    S#  RRK *Q C    K  I R    #F  
Conservation:  0231555353424283374384446202314224233543765642674236559561346672114343332542542272178656665653596864
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                     D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                D                                              D       DD                         DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLPKSSPNKEKELALRKNAACQSDFADLCTKGVQTMEDFKPEEYPLTPETIMCYENKWEEPGHLTLDLQSQKQDRHGEAGILNPIMEREEKFVTDEELHV 400
PathogenicSAV:                   T                                                                                 
BenignSAV:           A                                                                                             
gnomAD_SAV:    H   A AK G   T      Y #H V     E  A  GSR    RS   I T  K  C     #IS#V     E     RT #AVR    TIFR# K   
Conservation:  7425121443030025312124322101155566714111114231143111012000121112221110111102111101110232232000122001
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH HH             HHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHH HH HHHHHH                                                        HHHHHHHHH   HHHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHH           HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDD        D   D        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VKQEVEKLEDEWEREELDKKQKEKASLLEREEKPEWETGRYQLGMYPIQNMDKLQGEEEERLKREMLLAKLNEIDRELQDSRNLKYPVLPLLPDFESKLH 500
gnomAD_SAV:    IQ* F    N C I    RR# KTPY R  K      SEK  RV#CLV H G  PR         R   E SA Y  PR  * V C   L   VL P PR
Conservation:  1313012212323321033012110111122220002121110111104010122222431245326432524461413100112012111111002211
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH                    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH                
DO_DISOPRED3:  D  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DD    DDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD     DDDDD   DDDDDDDDDDDDDD DD DDD     D                      DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPERSPKTYRFSESSERLFNGHHLQDISFSTPKGEGQNSGNVRSPASPNEFAFGSYVPSFAKTSERSNPFSQKSSFLDFQRNSMEKLSKDGVDLITRKEK 600
BenignSAV:                               V                  P                                                      
gnomAD_SAV:    FA  I  ICTLC#   I L       MC   RERK H   H  NS #SIQL#   SM LLG              V     IGV *   G#I   I#E I
Conservation:  2221202100232112110221101211102220112321111211211443683648765313242222243244111221002100210121002456
SS_PSIPRED:                                                                                HHHHH HHHHH      HHHHHHH
SS_SPIDER3:                          E                                E                   HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                  HHH                                                           HHHHHH             HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDD DDDD DD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              DD  D  DDDDDD    D      DDDDDDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KANLMEQLFGASGSSTISSKSSDPNSVASSKGDIDPLNFLPGNKGSRDQEHDEDEGFFLSEGRSFNPNRHRLKHADDKPAVKAADSVEDEIEEVALR 697
BenignSAV:                   G                                        D                                         
gnomAD_SAV:        K   L  # RGI #F N   H      RN E ITS    E   V  RG NDDI  T   G    MYQ    YN     PP C  A   KLTP 
Conservation:  9437644879121121112110210131022220231312412522212111224114123222112232233222243243342325566854144
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH                                                                       HHH   HHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH                                                               E      EEEEE  HHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                                                                             HHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD