Q86VZ5  SMS1_HUMAN

Gene name: SGMS1   Description: Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1

Length: 413    GTS: 7.461e-07   GTS percentile: 0.119     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 125      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSI 100
gnomAD_SAV:                E # P   L Q S A    ##  M S     SR SA  GI   KR  F # T    ID      N V  S   S  I   I VS    
Conservation:  7211111111210001000110021222000011010022111111021222234122211111010101000112222111111111111111111001
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHH   HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH                       
SS_SPIDER3:      E     HHHHHHHHHH   HHHHHHHH    HHH E  HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHH  HHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:  D                                                                                      DDDDDDDDDD DD
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                  D                         DDD       DDDD             
MODRES_P:             S                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIKPNGMPNGYRKEMIKIPMPELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLI 200
gnomAD_SAV:     F RKR       G V  L     # R  V RD             IF     L I  *  S  M    R                            S 
Conservation:  1000021141101323371321021104819818833442682336437644754788999363026899949872448427883669549549324823
STMI:                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:               HHH       HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHH
SS_PSSPRED:                        HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS 300
gnomAD_SAV:           R V          M      V     #     V     L   #N #   Q M   MV  #  V    SL       D           VE   
Conservation:  6522556689439966564757979755777597999962752977771432245229444654979865855817999797999864666346843864
STMI:          MMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHH            HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHH        E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE                 HHHHHHHHHHHHHHH            EEEEE HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                                                                          H               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHL 400
gnomAD_SAV:    RQQ           NI#        R     EM       M           H             K                L   T        L Y 
Conservation:  5422535322642442163355546658965875567444553644754455131330031252523477312616672651215622403522231110
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                            
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH H         E      HHH 
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                 H   D                                                                    

                       10   
AA:            SRQVKYSRLVNDT 413
gnomAD_SAV:     S   H W    A
Conservation:  1110262241111
SS_PSIPRED:    H            
SS_SPIDER3:                 
SS_PSSPRED:    HHH          
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: