Q86WJ1  CHD1L_HUMAN

Gene name: CHD1L   Description: Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like

Length: 897    GTS: 2.596e-06   GTS percentile: 0.828     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 501      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MERAGATSRGGQAPGFLLRLHTEGRAEAARVQEQDLRQWGLTGIHLRSYQLEGVNWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLAGRLNDEGPFLI 100
BenignSAV:     L                       P                                                                           
gnomAD_SAV:    T      I  C#S  Y        P  E      V G      F  C ** DEE RFT C R         K   W A H T  LV W   *    QL  
Conservation:  4222222222222222301000100011001020330125515628629942862963343104278796887888866667565342130311233666
SS_PSIPRED:                  HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE     HHHHHHH     EE        HHHHHHHHHHHHHH       EEE
SS_SPIDER3:                   HHHHHH   HHHHHHH HHHHHH    EEEEEEEE    HEEHHEEE    EEE  H    HHHHHHHHHHHHH        EEE
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH    EEE  EEHHHHHHHHHHH      EE       HHHHHHHHHHHHHHH      EEE
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBBBB    DD                                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                                                                                              
NP_BIND:                                                                             DEMGLGKT                      
MODRES_M:              R                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LCPLSVLSNWKEEMQRFAPGLSCVTYAGDKEERACLQQDLKQESRFHVLLTTYEICLKDASFLKSFPWSVLVVDEAHRLKNQSSLLHKTLSEFSVVFSLL 200
gnomAD_SAV:    I S              PS   YE HV N  GKT P PN     H  L   AC F F  T     C #II  LE   KV K      R     A L G  
Conservation:  6566454147326424548372331818483282147114000014136776885556752443141913968999699962264953393353218358
SS_PSIPRED:    EEEHHHHH HHHHHHHH    EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH   EEEEE HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEHHH   HHHHHHH      EEEEE  HHHHHHHHHHHH    HHHEHHHHHHHH  HHHHH    EEEEE HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                  DEAH                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTGTPIQNSLQELYSLLSFVEPDLFSKEEVGDFIQRYQDIEKESESASELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSALQKKYYKAILMKDLDA 300
gnomAD_SAV:    *IR      F  PCF      L P FR G E V HC  Y   K   V K R  S* S R QMN        NNS IM H   P     H#    V G  T
Conservation:  8788655747276466726546139102233182017105212123616951574969988583563156928275446876635973397649477233
SS_PSIPRED:    HH    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_SPIDER3:    HH     HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:    H    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FENETAKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEVGDHLTEASGKLHLLDKLLAFLYSGGHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGE 400
BenignSAV:                                                      Q                                                  
gnomAD_SAV:    YGS M Q    R V    #   VY   C C# R    IENY P    RFQ  G   VC  P  RW       #    M  GC# FG   C##  R    G
Conservation:  5122022321535553354466388888186996883592655459795169534513520326658668865247645666344475577669696997
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      H
SS_SPIDER3:      HHHHHH HHHHHHHHHHHH               EE   HHHH   HHHHHHHHHHHH     EEEHHHHHHHHHHHHHHHHH   E EEE   E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE       H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERHLAIKNFGQQPIFVFLLSTRAGGVGMNLTAADTVIFVDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIGRDTVEEIVYRKAASKLQLTNMIIEGGHFT 500
gnomAD_SAV:         V     RT  IVHP    DRA I   V G     GG   SRSG HG    YHV R#      W   Q I   T H IV F  R I T T #VR  
Conservation:  7947776494223382946745579675775459976937596796776763575777992548658676666979946435936992875354638654
SS_PSIPRED:    HHEEEEEE     EEEEEEE              EEEEE      HHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE    HHHHHHHHHHHH   EEEEEE  EEE
SS_SPIDER3:     EEEEE       EEEEEEE     EEEE  E EEEEEE     HHHHHHHHHHHH H     EEEEEEEE   HHHHHHHHHHH    E EEEE  EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      EEEEEE         EEE  EEEEE       HHHHHHHHHHHH       EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGAQKPAADADLQLSEILKFGLDKLLASEGSTMDEIDLESILGETKDGQWVSDALPAAEGGSRDQEEGKNHMYLFEGKDYSKEPSKEDRKSFEQLVNLQK 600
BenignSAV:                                     T                                                                   
gnomAD_SAV:     RDREA VN  F* R MFTLDF     F V II# T  G    #  GD*    V  TV#RE S E  VR L# V GD#NS N   E EK  S P I F T
Conservation:  4411112212234845575596756754346431334620659162250821400010011003022123969278969995236237322733632332
SS_PSIPRED:    E            HHHHHHHHHHHHHH       EE HHHHH        HHH           HH     EEEE          HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    E            HHHHHHHHHHHHH           HHHH  E     EH                   EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHH        HHHHHHHH             EEEE          HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                           BBBBBBBBBB                    D            
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:                                       DDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDD      
MODRES_P:                                             S                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLLEKASQEGRSLRNKGSVLIPGLVEGSTKRKRVLSPEELEDRQKKRQEAAAKRRRLIEEKKRQKEEAEHKKKMAWWESNNYQSFCLPSEESEPEDLENG 700
BenignSAV:                                                     A                                                   
gnomAD_SAV:         TG K Q* Q#      R      #ES#W        N *#T  A  GR KGFTG NNKR AKTVR R VVGC  #SCPFVS #  DRK     SR
Conservation:  2023111137738825323233220103145531352374515334334355684321351443334123358445833328361764214621321321
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HH      EE            E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        E              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH                      
DO_DISOPRED3:            D                        BBBDBBBBBBBBBBBBBDDBBBBBBBBBBBDDDDDD                    BBBBBBBBB
DO_SPOTD:                                 DDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DDDDD  DD DDDDD        D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD             DDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:            S          S         S       S                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EESSAELDYQDPDATSLKYVSGDVTHPQAGAEDALIVHCVDDSGHWGRGGLFTALEKRSAEPRKIYELAGKMKDLSLGGVLLFPVDDKESRNKGQDLLAL 800
BenignSAV:                                               C                                R                        
gnomAD_SAV:      IPTK G* Y  D   R IR   INTH # K VFV Y # YF R*D   VLR    LFT  G VN VSAI# E R  #  SL       GK      SS
Conservation:  2201112011414001618439886581411465456885653628947968556218634564265386184861882546646556247008381577
SS_PSIPRED:                    EEEEE            EEEEEEE          HHHHHHH     HHHHHHHHH        EEEEE   HHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:                     EEEE            EEEEEEE     E    HHHHHHH    HHHHHHH        EEEEEEEE    HH H  HHHHHH
SS_PSSPRED:                    EEEE             EEEEEEE         HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       EEEEE        HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBB                                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDD DDDD                                                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD         D                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVAQHRDRSNVLSGIKMAALEEGLKKIFLAAKKKKASVHLPRIGHATKGFNWYGTERLIRKHLAARGIPTYIYYFPRSKSAVLHSQSSSSSSRQLVP 897
BenignSAV:                                                                                         A            
gnomAD_SAV:    T T* CHC#SI YV N T VK  P  VC V#     TLRFAHTRY MES  CCV  * TW R V GSTRI #H  L G F  F  K    F#   MR
Conservation:  4688395134257563615753684742146531255455886945545859855655444223333333236453411101001010120211212
SS_PSIPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE               HHHHHHHHHHH    EEEEEE     EEEE             
SS_SPIDER3:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE             HHHHHHHHHHHH    EEEEEE     EEEE             
SS_PSSPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE                HHHHHHHHHHHH   EEEEEE     EEEE             
DO_DISOPRED3:                                                                                  BBBBBBBBBBBBBBBBB
DO_SPOTD:                                                                                           DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                        DD     DDDDD
MODRES_P:                                                                                                S