Q86XT4  TRI50_HUMAN

Gene name: TRIM50   Description: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50

Length: 487    GTS: 3.881e-06   GTS percentile: 0.973     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 299      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAWQVSLLELEDWLQCPICLEVFKEPLMLQCGHSYCKGCLVSLSCHLDAELRCPVCRQAVDGSSSLPNVSLARVIEALRLPGDPEPKVCVHHRNPLSLFC 100
BenignSAV:            P                                                                                            
gnomAD_SAV:        A         # STYM#G      VKFA   YND      Y    K P  L L VM S  F  #F    #MK     E#L #R RLRYQ S   C 
Conservation:  9945322229432959959976747745947999793199147317352465976954166363645344673775494271324623712423777777
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH      HH    EE     EEHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHHH          HH     EEEE
SS_SPIDER3:           HHHHHH    HHHHH    EEE    HHHHHHHHHHHH     EE      E         HHHHHHHHHH         E       EEEEE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHH  HHHHHH           HHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ZN_FING:                      CPICLEVFKEPLMLQCGHSYCKGCLVSLSCHLDAELRCPVCR                          PEPKVCVHHRNPLSLFC

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKDQELICGLCGLLGSHQHHPVTPVSTVYSRMKEELAALISELKQEQKKVDELIAKLVNNRTRIVNESDVFSWVIRREFQELHHLVDEEKARCLEGIGGH 200
gnomAD_SAV:    K  #    V  SQR FRKY L K LC ICNH RK F#  F Q    RR   GVVT P K#Q##TI KL IC   MHH    VR PMNDA  H   # EVY
Conservation:  7274436747767973753925764557367567474342735545422447545794797997277677949977399977747755969597264234
SS_PSIPRED:         EE HH           EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEE            EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHH  HHH      EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                           D                                                                           
ZN_FING:       EKDQELICGLCGLLGSHQHHPVTPV                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRGLVASLDMQLEQAQGTRERLAQAECVLEQFGNEDHHKFIRKFHSMASRAEMPQARPLEGAFSPISFKPGLHQADIKLTVWKRLFRKVLPAPEPLKLDP 300
gnomAD_SAV:    SH      N K D   RA# Q V  KRM  ELS  NNQR  Q  YYVD G D LH#W *  V  L #V  # Q V   P MC  FLW      D  R   
Conservation:  4699557532672753633577164113647552322359754744254713223245256293449969577597595557666434646447394999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH              HH           HHHHHHHHHHH       EE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH                 E    EE    HHHHHHHHH      EEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                       DDDD                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                  D                                   D  D                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATAHPLLELSKGNTVVQCGLLAQRRASQPERFDYSTCVLASRGFSCGRHYWEVVVGSKSDWRLGVIKGTASRKGKLNRSPEHGVWLIGLKEGRVYEAFAC 400
gnomAD_SAV:                 M G  E    #QV  A C N G *L   LS  W C  *Q  M # NN C #IV   T H  N   # K  M   S  KDW  K  P 
Conservation:  7579997576775779475653462345755977759795249997549777739939747779477574774555175955939949599753999737
SS_PSIPRED:          EEE     EEEE                  EEEE       EEEEEEE      EEEEEE             HHH EEEEEEE   EEEE   
SS_SPIDER3:          EEEE    EEEE                  EEEEE   E  EEEEEEEE     EEEEEE         E       EEEEEEE   EEEE   
SS_PSSPRED:          EEEE    EEEE          HHH     EEEE        EEEEEE      EEEEEEE  HHH           EEEEEEE   EEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                                              K                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80       
AA:            PRVPLPVAGHPHRIGLYLHYEQGELTFFDADRPDDLRPLYTFQADFQGKLYPILDTCWHERGSNSLPMVLPPPSGPGPLSPEQPTKL 487
gnomAD_SAV:     WIT R# RQ  H # H Q  H *   IY    N  QLF     N  V R       #N* S  L   M        L  #K R   
Conservation:  755377517597779499777577959579954549724977777979995997937977554547779973534431401047371
SS_PSIPRED:                EEEEEEE    EEEEEE         EEEE       EE  EE            EEE                 
SS_SPIDER3:       E        EEEEEEE    EEEEEE         EEE        EEEEEEEE     EE    EEE                
SS_PSSPRED:                EEEEEEEE   EEE              E                                              
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD