Q8IUA7  ABCA9_HUMAN

Gene name: ABCA9   Description: ATP-binding cassette sub-family A member 9

Length: 1624    GTS: 1.824e-06   GTS percentile: 0.589     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 779      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSKRRMSVGQQTWALLCKNCLKKWRMKRQTLLEWLFSFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQMSSMDLGRVDSFNDTNYVIAFAPESKTTQEIMNKVASAPFL 100
gnomAD_SAV:    I N C#RM#   *#  S   # T      N       IP  P  H    KFYH    L  Y V VEG   C      VE  SKY  #   TK AS  L  
Conservation:  7014123315651465245351347262332295212333231312111000110111115001782452431201142745251243265243212324
STMI:                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 
SS_PSIPRED:      HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            EEEE    HHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HH HHHH                             EEEEE    HHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          EEEEE    HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDD                         DDDDDDDDDDDDDDDD                                                      
DO_SPOTD:      DDDD                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGRTIMGWPDEKSMDELDLNYSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPMMKEHRDHSAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVAFQAAINAAIIEIATNHSVME 200
gnomAD_SAV:     *KRV RRTE  CV  MG D# VET T  Y    F D#R    LK  VT GY  DP      #G I   V  Y    #L  ETV T#VVV# TI    I 
Conservation:  1420313013220311100010012425391413591534001001400151012141600001000801204611574347435555456224544533
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHH    EEEEEE     EEEE           HH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:       EEE    HHHHHHHHHH    EEEEEE    EEEEE E                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
SS_PSSPRED:       EE     HHHHHHHHHH   EEEEEE      EEE                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                         N                                                                          N     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYYVSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGF 300
gnomAD_SAV:     P *   LP#QT    V  E   E  T C   Y  #   C LGD S*  *H M ST  I R#KLV C     I  SY    #  IT T  C#*  I PA 
Conservation:  2526425215331132110110111333223337342363352253386411413722657432677677453732342425225523220003112133
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          M
SS_PSIPRED:    HHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H
SS_SPIDER3:    HHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHH H
DO_DISOPRED3:                                                                            D DDDD DD                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEWTLCLLSPFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLII 400
BenignSAV:                                                         H                                               
gnomAD_SAV:        I    H  P V     IGL VNQA  M MIM P VI  E  R L    H SE    # R          L   TQ  C      R     KS*   
Conservation:  2243134357844343526543354532144333244313247245313312036023243533356555236433332242220210232222133122
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHH HHHHHHHH  HHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH      E        HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATLFMLVFDTLLYLVLTLYFDKILPAEYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEAIRIKNLKKEYAGKCERVEAL 500
gnomAD_SAV:        I D  NFM  L   #V   W TKC #*Y #     C  *   RK   M        # # #    #L       #  K   R    T  R TA T 
Conservation:  1222362562336426547643442142512246286453335131211011111020212111331293443551665478524525261120122335
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                 HHH     EEEE EEEEE      EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHE  HHH                               H     EEEEE EEEEE      EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             E                                         EEEEEE EEEE      EEEEE
DO_DISOPRED3:                                        DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:                                                         DDD      DD                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGSVTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQR 600
gnomAD_SAV:     D ML V  D  I  P#  R      F      A #       N  P  SV  T  #      G  #SM*        T     EL # V  K V   KQ
Conservation:  2641546665757556643559874764453632144274434432134320224131214759891634642895669814672678511224315733
SS_PSIPRED:    E  EEEEE   EEEEE      HHHHHHHH       EEEEEE       HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEE  EEEEEE      HHHHHHHHH      EEEEEE  EE   H HHHHHHHHH E      H     HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EEEE   EEEEEE      HHHHHHHHH        EEEEE      HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                       GHSGAGKT                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLLKEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSS 700
gnomAD_SAV:    L  #F  D  * F GEH IS      I  N VV E  A   N L   V    K * * I R R       VI H #HK  V VN    M   RP    FP
Conservation:  5211635122551141175445475975767489483756886764568533642482363524124335435333475522454334441625332545
SS_PSIPRED:    HHHH   HHH     HH    HHHHHHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHHHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHH  EEEEEE  EEEE    
SS_SPIDER3:    HHHH     H  HH  H        EEEEEEE     EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHH   EEEEE  EEEEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHE    EEEE         HHHHHHHHHHHHH    EEEEE    HHHHHH  EEEEEE  EEEEE  H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFLKKKWGIGYHLSLHLNERCDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVSITTLNEVFLKLEGKSTIDES 800
BenignSAV:                                                                                         S               
gnomAD_SAV:     LPR    V  L I   KD R LG#      P VFVG  A        *V    M    S    A  G  K  T  C  FR   S #        A G  
Conservation:  2678455344534643243142141343343257624243232223616288343422854751356112124523747436573675335642211211
SS_PSIPRED:    HHHHHH    EEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEEEE   EEEEEE HHH   HHHHHHHHHH        EEE HHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  EEEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEE HHHH HHHHHHHHHHH HH    EEEEE   HHHHHHHH       H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   EEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEE  HH HEHEEE      H HHHHHHHHH        EEE H HHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVALWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNT 900
gnomAD_SAV:     V  #   LA E   T #  KP  I     A      SMV G  LI  T   C P      RIP  T  F  T   R*    VSHK**    LGK T   
Conservation:  3012111011110110211031211122312111122221684373254344545464231603224543233222413210200020000003343411
STMI:                                                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                
SS_PSIPRED:                          HHH         HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:                      HH HHH H           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           E     
SS_PSSPRED:                                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 D                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIIVSGDEKDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNS 1000
gnomAD_SAV:       L R    H #IR    SNIR  TN L Y   *  M V   G    H   AL             G          G    LLV   V    FRV  L
Conservation:  9833332111011518862727521432541253173614452142232322220538752531112232543354242245663634557633522322
SS_PSIPRED:                  HHHH     HHHHHHHHHHHH   EEEEHHH            EEEEEEE     EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    E          HHHHHHHH      HHHHHHHHHH   EEEHHHHHH           EEEEEE    EEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHHHHHHH  HHHHH             EEEEEE      EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:      D D      DDD           DD       DDDDDDD                                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                      N                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEHIQTDRSTFFEEHMDYEYGYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFLILLLMQIMDYIFSPEEIIFI 1100
gnomAD_SAV:      Y#E E      KD # #C *Q K#  * LTG F  S V T#GV  D *NTYF  Q *V  S T     V  #   H FF      INH CR   FV L
Conservation:  3125441212210011100000000112222222323734543421834134226853565245578395555733531244223122022100001010
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:        EE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH
SS_SPIDER3:        E            HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWSFFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESE 1200
gnomAD_SAV:       V      G D      Y      L SHS   TR M* LL  N A      AE SVCRYI  L    S AS  MTD P S   VFS     * T K  
Conservation:  1001122321227432735443644552432343221253414313321121010000000000211124271133122111001000000000000000
STMI:                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                M
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HH       HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH H H       HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH HHH        HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVYLALLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEEDIQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCF 1300
gnomAD_SAV:    V *    TA  Y        *Y  I  #  P           #  TT      R R   Y *T II I   TP#QG  DI LVTT S WN       SS 
Conservation:  0132214253452224334533851223112321773585223200112423131332346226613311222111124233534335375611322133
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHH          EEEE EEEEE        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE                  HHHHHHHHHHHHHH         EEEEE EEEEE        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE                   HHHHHHHHHHHHHH         EEEEE  EEE         
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                   DDDDDDDDDDDDDDD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKRKKKIATRNVSFCVKKGEVIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAMIA 1400
BenignSAV:          T                                                 S                                            
gnomAD_SAV:      KE TT ISSI    T R LT     D S     V  #  NA  A E  T  VNS*E  QA P   L   V *AS   K   D *T MRSV * ET VT
Conservation:  2323243535448636348464775654886766343453712134583613120111101114637562327740653255843455458313233012
SS_PSIPRED:         EEEEEEEEEEE    EEEEE      HHHHHHHHH       EEEEE        HHEEEE            HHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE  EEEEEE   EEEEE      HHHHHHHH       E EEEE  EE   H  E EEE           HHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:         EEEE  EEE     EEEE        HHHHHHHHH        EEEEE                         HHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                     DDDDDD         DDD                                                
NP_BIND:                                GHNGAGKS                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLR 1500
gnomAD_SAV:     IQ  G# Q E * RSTM P      Q     P   V L     AQSW W  TKWR P **E Q     K SCT  II  V  P VM# QG      K  
Conservation:  4044312627222421232174262365764345444241444665432335312422363344233212314457384242733437544544347166
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHH     HH  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE   HHHHHHH  EEEEEE  EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHH  EHHH   HHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHH H  EEEEEE  EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH    EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH  EEEEE   EEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                DDDD     DD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVEDVRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKE 1600
gnomAD_SAV:    #L  L #     A      I   #PT IQLRR   RG I LP  * ML  M IC      MQ    P    VL  RN   KK  F     *     R R*
Conservation:  4575343664455238295453222221116613522385163243521223344532224255435612661342222444545522362343245324
SS_PSIPRED:    E   HHHHHHH    EEEEEEE  HHH HHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEE  HH    HHHHHHHHHHHHHH      EE    HHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EE  HHHHHHHH   EEEEEEE  H HHHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEE H     HHHHHHHHHHHHHH    E E   E HHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    EE  HHHHHHH    EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH  EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDDD                                      DD D DDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20    
AA:            QELGDLEEDFDPSVKWKLLLQEEP 1624
gnomAD_SAV:    KQ   P  G  LL N*ERFQH   
Conservation:  231211232121312332311211
SS_PSIPRED:    HH           HHHHHH     
SS_SPIDER3:                            
SS_PSSPRED:    H            HHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBB
DO_SPOTD:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: