Q8IWA5  CTL2_HUMAN

Gene name: SLC44A2   Description: Choline transporter-like protein 2

Length: 706    GTS: 1.638e-06   GTS percentile: 0.509     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 372      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLV 100
gnomAD_SAV:     W          R# L   S#  A   K D #G#M   I F     CA  C TG I   S*  T   E Q K  A     KKK  C    T MT T S I
Conservation:  1110011111112010011202122201212442333242131321321332246236654343353451614661143041132144534331621222
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              
SS_PSIPRED:                                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  EE                        HHH    HH
SS_SPIDER3:                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH                       E      HHH   HH
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE     EE                             HHH     
DO_DISOPRED3:  BBBBBBDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                   T                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLQDGDCPAVLIPSKPLARRCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKN 200
BenignSAV:                                                          R                                              
gnomAD_SAV:      D  # IL M L  #S HHFM    C  LN  ##NLL I   Q   A  KGF*  E         LF W  C TL V Q I      M C  AR  WN 
Conservation:  2313164525476229610212300000100002221392112000002023301227613224423324564611000110305130202012021012
SS_PSIPRED:    H         EE        EE   HH    HHHH             HHHHH       EE            HHHH   EEEE               
SS_SPIDER3:    HH        EEEEE      EEEH      HHH HHH          HHHHHH      EEEE     EE    EE    EEEE    E        E 
SS_PSSPRED:              EE      HHHHHHHHHHHHHHHH EE           HHHHH       EEE            HHHH                     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                            N            N

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLG 300
gnomAD_SAV:      E  * #    R  KV#  TTCV  GH F   C  # RA    I    VM  C V  V# R # V   PM   R     V   * H  VS      A S
Conservation:  3133104311310133141423552574314404642452354337325536674251344423323451325463238304500510112302240334
STMI:                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        E    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSP 400
gnomAD_SAV:      K  Q#C # QR      M PN V    V    L Q  #  #T   EA # TM  #V F         S     T# T       AFSKVA N    R 
Conservation:  5324323632245573233424222622434343354144123415437456553342254368328626524642743235348677504373411101
STMI:                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE     
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE    
SS_PSSPRED:     EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CPFTAKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRY 500
gnomAD_SAV:    RACIV I K  I  P    H Y S # L    S   V YG      VLSG V  SM   M V    M  #D S    S C     LT SV FVIDW P  
Conservation:  9001202916101101110017102081711832140342231177325343669439833665555668695579961185145612651265134335
STMI:                                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    
SS_PSIPRED:                               EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                               EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                              EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                      N                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDF 600
gnomAD_SAV:     IA P   V M V  *  H        QV V   R  Q PV  R S # G QNL RL  K  H    V S Y YNL G  #       V  TI   AIE 
Conservation:  6364356445565134224333454214231114012454116324535344225334423334447458245514422530723343357344735523
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               M
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH    EEEEEEE     HHHHHHHHHHHH  HHEEHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTN 700
gnomAD_SAV:           VMI # W   CL    H G M#   #         PMA I       #  NICS    M          KI SLDK  CY#  I *RFS    
Conservation:  4524564563523733554566233101100210775364944511345334425434452355344456432454243861143433210521330011
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH            HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH H H            HHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                     
AA:            KKAAES 706
gnomAD_SAV:       V  
Conservation:  111111
SS_PSIPRED:    HHHH  
SS_SPIDER3:          
SS_PSSPRED:    HHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDD
DO_IUPRED2A: