Q8IX21  SLF2_HUMAN

Gene name: SLF2   Description: SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2

Length: 1173    GTS: 7.121e-07   GTS percentile: 0.108     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 525      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTRRCMPARPGFPSSPAPGSSPPRCHLRPGSTAHAAAGKRTESPGDRKQSIIDFFKPASKQDRHMLDSPQKSNIKYGGSRLSITGTEQFERKLSSPKESK 100
gnomAD_SAV:      GC T# W A A  L LRL# #  PM S G DRTP  N   NS      #TN L  P  #       L     R        N AK      C   K Q
Conservation:  2221211111211122130111112001100002001121010011343172245332232551182633222132330413212222344314423104
SS_PSIPRED:                                     HHH              HHHHH                              HHHHHH         
SS_SPIDER3:                                      H      E         HH                                  HH           
SS_PSSPRED:                                     HHHH             HHH                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKRVPPEKSPIIEAFMKGVKEHHEDHGIHESRRPCLSLASKYLAKGTNIYVPSSYHLPKEMKSLKKKHRSPERRKSLFIHENNEKNDRDRGKTNADSKKQ 200
BenignSAV:                                                 R    C                                                  
gnomAD_SAV:       LL   I  T G V V  GY     T K HQ R   VFRCF RA DTC  PL*D  E   LP R RG S       VD      E H V  D A    
Conservation:  1242521365424471432522333112331211112112024214333322221131330300233321211242130143242020212113331212
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHH                     HHH                HHHHHH      HHHHH                         
SS_SPIDER3:              HHHHHH                              EE E        HHH                                       
SS_PSSPRED:              HHHHHHH                                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                             SLASKYLAKGTNI                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TTVAEADIFNNSSRSLSSRSSLSRHHPEESPLGAKFQLSLASYCRERELKRLRKEQMEQRINSENSFSEASSLSLKSSIERKYKPRQEQRKQNDIIPGKN 300
gnomAD_SAV:     A   VYV S #FGRPTRWN Q S# Q  CL R    W        #           R    K     VC P     L#  # ST     R  M    S
Conservation:  1212324115012232312421434311213224234346343254443753413222542233324423213122100122011113010121211221
SS_PSIPRED:      HHHHHHHH                       HHHHH HHHH  HHHHHHHHHHHHHH           HH     HHHH     HH            
SS_SPIDER3:      HHHHHHH                              HHHH H HHHHHHHHHHHHH                                         
SS_PSSPRED:       HHH                             HHHHHHHH HHHHHHHHHHHH                      HHH                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLSNVENGHLSRKRSSSDSWEPTSAGSKQNKFPEKRKRNSVDSDLKSTRESMIPKARESFLEKRPDGPHQKEKFIKHIALKTPGDVLRLEDISKEPSDET 400
gnomAD_SAV:    S             P   L        E    SG #E  F   V R I  F TT    YLPQ H  RRYR   CV  T   A  EM C  ET   L    
Conservation:  2011022210430421212100122155212344766413221112221211031223313212111112311555322452334674535121111320
SS_PSIPRED:       HH                                                  HH              HHHHHHHHH        HHHH        
SS_SPIDER3:                                    HHHH                      HH          HHHH HH           HH          
SS_PSSPRED:                                                                           HHHHHHHH         HHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGSSAGLAPSNSGNSGHHSTRNSDQIQVAGTKETKMQKPHLPLSQEKSAIKKASNLQKNKTASSTTKEKETKLPLLSRVPSAGSSLVPLNAKNCALPVSK 500
gnomAD_SAV:    VD FS  #S TP SF RR  K       SDI K    R  I  CE  T  *  GK   S PTGFMAE E  EPL  AH AN   AV #S   KW      
Conservation:  3122113122211132021012332122223742123122202123231023321221232313112113334325311112114110112101111111
SS_PSIPRED:                                   HHHH        HHHHH                     EE                             
SS_SPIDER3:                                     H            H                                                     
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                      S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KDKERSSSKECSGHSTESTKHKEHKAKTNKADSNVSSGKISGGPLRSEYGTPTKSPPAALEVVPCIPSPAAPSDKAPSEGESSGNSNAGSSALKRKLRGD 600
BenignSAV:                                             Y                                                           
gnomAD_SAV:     # KC    #RP Y A  A N  L T A  #HF   L   Y #SSP   VPL #AHLT    L  V IRG   N  # K G # D S  NN P G V S 
Conservation:  1011011001021110211201211221020221013121222221321112212213222112101211111230020101121101011132342311
SS_PSIPRED:                                                                                              HHHHHH    
SS_SPIDER3:                           H                                                                  HHHHHH    
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FDSDEESLGYNLDSDEEEETLKSLEEIMALNFNQTPAATGKPPALSKGLRSQSSDYTGHVHPGTYTNTLERLVKEMEDTQRLDELQKQLQEDIRQGRGIK 700
gnomAD_SAV:         D * *S      G*   P   V    VSE    IRML #F R  KFHAL CI    S ICI   QS    #K SP     R  Q  E#   #   
Conservation:  4456252223375443755172584446122021021222112112001121331010011133719485364694432234365442844223310211
SS_PSIPRED:        HHHH       HHHHHHHHHHHHHHH                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:        HHH       HHHH H   HHHHHH                                       HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:                           HHHHHHH                                      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD
MODRES_P:        S   S      S                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPIRIGEEDSTDDEDGLLEEHKEFLKKFSVTIDAIPDHHPGEEIFNFLNSGKIFNQYTLDLRDSGFIGQSAVEKLILKSGKTDQIFLTTQGFLTSAYHYV 800
gnomAD_SAV:     LV T  D       S  KK    V    I V  L# N                #RF    K  S  AHNT    V  LE  H* I       MTP RFF
Conservation:  2203113233211233625977463476652134987159995683320482485425855433152436236246423312563253327362246111
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHHH   HHH                          HHH       HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                      HHHHHHHHH    HHH         EE                 H       HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHH                                          HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QCPVPVLKWLFRMMSVHTDCIVSVQILSTLMEITIRNDTFSDSPVWPWIPSLSDVAAVFFNMGIDFRSLFPLENLQPDFNEDYLVSETQTTSRGKESEDS 900
gnomAD_SAV:    R   T     LW#I    G  A   F  S K  AV  VA  NLR C CVS V      Y S   N         H  EL K C  F    S    K  G 
Conservation:  2871243466755555933214714441383264243211221103384965265437537695081288851247808450352312311210111211
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH                         HHH           
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH                                       
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHH                                      
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                            DD  DDDD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SYKPIFSTLPETNILNVVKFLGLCTSIHPEGYQDREIMLLILMLFKMSLEKQLKQIPLVDFQSLLINLMKNIRDWNTKVPELCLGINELSSHPHNLLWLV 1000
gnomAD_SAV:     H*   PA    S    I C   YATV   #   G     M   L IIM  H  R    GLE         L N  P M  V P  S  C Y     *  
Conservation:  1002362154415516647562693442342727274258435547559852652253386549313760343262356348723463772569756454
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHH     HHHHHHHHHHHH    HHH HHHHHH         HHHHHHH
SS_PSSPRED:               H HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLVPNWTSRGRQLRQCLSLVIISKLLDEKHEDVPNASNLQVSVLHRYLVQMKPSDLLKKMVLKKKAEQPDGIIDDSLHLELEKQAYYLTYILLHLVGEVS 1100
gnomAD_SAV:            H      Y   LL *Q   A #K  SH TH  G L #HC G          #     P   G   N           S Q#       S I 
Conservation:  8459433169674745787337554833211146111526523923352178872554441112101312200231102345354889253874854574
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH            HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:                                                                    DDDDDDDDDDDDDD                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70   
AA:            CSHSFSSGQRKHFVLLCGALEKHVKCDIREDARLFYRTKVKDLVARIHGKWQEIIQNCRPTQGQLHDFWVPDS 1173
gnomAD_SAV:      Y    E W  V PFF T    #       S R       V  TTV#        DRW     R    I   
Conservation:  2221124156325435632667453648555453455658345496533698337425552864574541512
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHH        HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:                                                                          D
DO_SPOTD:                                                                             DD
DO_IUPRED2A: