Q8IXW5  RPAP2_HUMAN

Gene name: RPAP2   Description: Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2

Length: 612    GTS: 1.17e-06   GTS percentile: 0.298     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 267      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MADFAGPSSAGRKAGAPRCSRKAAGTKQTSTLKQEDASKRKAELEAAVRKKIEFERKALHIVEQLLEENITEEFLMECGRFITPAHYSDVVDERSIVKLC 100
gnomAD_SAV:    T NS  #TP #PE #VS         EEA IV   V   T PD        V   K   P  K     S A DLR    #I  #V  G  MN HAV    
Conservation:  4111111111111111000000015110001100231224332342135251428457413553776235233372354227432583945586363438
SS_PSIPRED:                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH H  H HHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:     D D DD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
METAL:                                                                                                            C
ZN_FING:                                                                                   ECGRFITPAHYSDVVDERSIVKLC
MODRES_P:              S                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYPLCQKKLGIVPKQKYKISTKTNKVYDITERKSFCSNFCYQASKFFEAQIPKTPVWVREEERHPDFQLLKEEQSGHSGEEVQLCSKAIKTSDIDNPSHF 200
gnomAD_SAV:      A          E    M P    LC  N  N         TF         A IC Q  K    L# V GKR   F  * H*R EV ERPA NYRG  
Conservation:  7993924473264364545564465777566672565446759881433565246573322431524295425237159376160031431266523001
SS_PSIPRED:                    EEEE    EEEEHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH                              HHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:                    EEEE    EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E         EE            HHHHHHH   HH     H H
SS_PSSPRED:                    EEEE     EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                HHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                           D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                            D        DDDDDDDD      DDD            DDDDD
METAL:             C                              C   C                                                            
ZN_FING:       GYPLCQKKLGIVPKQKYKISTKTNKVYDITERKSFCSNFCYQASKFFEAQIPKTPVWVRE                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKQYESSSSSTHSDSSSDNEQDFVSSILPGNRPNSTNIRPQLHQKSIMKKKAGHKANSKHKDKEQTVVDVTEQLGDCKLDSQEKDATCELPLQKVNTQSS 300
gnomAD_SAV:    G RC     GIPGG  #  G*  I  M LR   D K       R RM#  #V#R T P        G A S  S N        ND RKF      S GY
Conservation:  0010110101203211361544758544322202211011221211101310001001100112003124234410414111321010111110002012
SS_PSIPRED:    HHH                 HHHHHH                                           HHHHHH     HH                  
SS_SPIDER3:    HHH                     H                                             HH                            
SS_PSSPRED:                                                                          HHH        HHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D D      DDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                     S                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SNSTLPERLKASENSESEYSRSEITLVGISKKSAEHFKRKFAKSNQVSRSVSSSVQVCPEVGKRNLLKVLKETLIEWKTEETLRFLYGQNYASVCLKPEA 400
gnomAD_SAV:      C    K* V K    V  GT    ID   #      T   T*     L     H    IENG   T  T S T    K  V#  CSRK GC     # 
Conservation:  2011001010222101110003155244565364326512522200001101121111201330255208217714927468435936212110110010
SS_PSIPRED:           HHH              EE    HHHHHHHHHHHH                   HH  HHHHHHHHHHHH  HHHHHHH     HH       
SS_SPIDER3:          HHH               EEE   HHHHHHHHHHH                   H    HHHHHHHHHH    HHHHHHHH H HHHH      
SS_PSSPRED:                            EEE     HHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLVKEELDEDDIISDPDSHFPAWRESQNSLDESLPFRGSGTAIKPLPSYENLKKETEKLNLRIREFYRGRYVLGEETTKSQDSEEHDSTFPLIDSSSQNQ 500
gnomAD_SAV:    F LR    D  V LY  T  R *  PP   E    L DA # M  P N#K   RVI  SSR        Q  V    S       Q TIL P H G   R
Conservation:  0002445766631111101112011112232011111111221233755315334421425673786481344263000111001012269866516822
SS_PSIPRED:       HHHH HHH         HHHHHHH                     HHHHHHHHHHH  HHHHHH   EEE                     HHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHH          H HHHHHHH H                    HHHHHHHHHH    EEHEE  EEE                      HHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHH              HHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE                       HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                           DDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  DDDDDDDDDDDD             
DO_IUPRED2A:         DDD        DD   DDD         D           DD                            DDDDDDDDDDDDDDDD        
MODRES_P:                                      S                                              S                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRKRIVLEKLSKVLPGLLVPLQITLGDIYTQLKNLVRTFRLTNRNIIHKPAEWTLIAMVLLSLLTPILGIQKHSQEGMVFTRFLDTLLEELHLKNEDLES 600
gnomAD_SAV:       GVIF N R  F EF   FR I   TD  F   FQ        S   SV      VM     N    M E  P D   S#  V I  K*Y   *  QG
Conservation:  7653845568123742444483432354224542874975566378384236854544455234201121110211111222432244235131024312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH E    E   HHHHHHHHHHHHHH      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10  
AA:            LTIIFRTSCLPE 612
gnomAD_SAV:       V    S   
Conservation:  420150000111
SS_PSIPRED:    HHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHH       
DO_DISOPRED3:             D
DO_SPOTD:                  
DO_IUPRED2A: