Q8IY18  SMC5_HUMAN

Gene name: SMC5   Description: Structural maintenance of chromosomes protein 5

Length: 1101    GTS: 1.339e-06   GTS percentile: 0.374     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 492      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATPSKKTSTPSPQPSKRALPRDPSSEVPSKRKNSAPQLPLLQSSGPFVEGSIVRISMENFLTYDICEVSPGPHLNMIVGANGTGKSSIVCAICLGLAGK 100
gnomAD_SAV:     ES#R  M #   H A  V S  HA #A#     WVS# Q#W L EHL   CV    V   Q F VY I R TQ  TVI   A   L  A    V   R 
Conservation:  2222222222211000110001000000000000002222200000023333312202112377504571886489666969967776769997959695
SS_PSIPRED:                                                       EEEEEEEE       EEE      EEEE      HHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                                                       EEEEEEEEE      EEE      EEEE      HHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                                                       EEEEEEEEEEE   EEEE     EEEEE      HHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      D                      
NP_BIND:                                                                                      GANGTGKS             
MODRES_P:                              S         S                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAFMGRADKVGFFVKRGCSRGMVEIELFRASGNLVITREIDVAKNQSFWFINKKSTTQKIVEEKVAALNIQVGNLCQFLPQDKVGEFAKLSKIELLEATE 200
gnomAD_SAV:         *T  I   M T RCG    V  S    S L  GQT MTRS    L S  P  * T  D  SG     R V E      I  ST       VK  K
Conservation:  5435694796547883851570465653601196472987232383729157231354718763532728552867589887797676777546777976
SS_PSIPRED:    HHH      HHHHHH    EEEEEEEEE     EEEEEEEEE     EEEE      HHHHHHHHHH         EE  HHHHHHHHH  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHH    EEEEEEEEE     EEEEEEEEE    EEEEE  EEE HHHHHHHHHH         EEE HHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHH     EEEEEEEE     EEEEEEEE      EEEE      HHHHHHHHHHH             HHHHHHHH   HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSIGPPEMHKYHCELKNLREKEKQLETSCKEKTEYLQKMVQRNERYKQDVERFYERKRHLDLIEMLEAKRPWVEYENVRQEYEEVKLVRDRVKEEVRKLK 300
gnomAD_SAV:    R VC  QRYRC    E V      FK   N TS    E A  SGICE      C Q Q   F               I R       I##QL   #   T
Conservation:  7777675562596499444255736632434522256632542784537636655345848273595464755687236234435620752263262156
SS_PSIPRED:    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                D                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGQIPVTCRIEEMENERHNLEARIKEKATDIKEASQKCKQKQDVIERKDKHIEELQQALIVKQNEELDRQRRIGNTRKMIEDLQNELKTTENCENLQPQI 400
BenignSAV:          I R                                                                                            
gnomAD_SAV:    D    IRR#  VR   C    VQ  G   #T    RI    E  T           R  #  #S  FG#  KVV  C R K     V  A  YKD    #
Conservation:  4141821134321511221350244133126432525493577167153437555362435941550556566034423834541681212213444644
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                D     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:           DDD       DDDDDDDDD   DDD     D   DD                          DDDDDD DDDDD DD  DD DD DDD DD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DAITNDLRRIQDEKALCEGEIIDKRRERETLEKEKKSVDDHIVRFDNLMNQKEDKLRQRFRDTYDAVLWLRNNRDKFKQRVCEPIMLTINMKDNKNAKYI 500
gnomAD_SAV:      VAD#  Q       F  K T NQ  K  I   #   E#  IC  S  S   HQ     CG  NV     S GG SR   S     M ST E  T   V
Conservation:  5263036614425631363411631253122027011401251245645228742960552976195299827523813045695793655752157795
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH HHH        HHHEEEE  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH HHH        EEEEE    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHEE    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DD                      DDDDDDD                                                               D D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENHIPSNDLRAFVFESQEDMEVFLKEVRDNKKLRVNAVIAPKSSYADKAPSRSLNELKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCCQYHIHEVPVGTEKTRERI 600
gnomAD_SAV:     T T   N K      K  #    R  H HE      G#  #N    RV  K    VTK     * K  L TS    R#   RC   V  I   T G  N
Conservation:  9477513966798852329751971848923387995725801427121833463372279645889967889138967881683755685964595137
SS_PSIPRED:    HHH       EEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEE              HHHHHH    EEEEEHH   HHHHHHHHHH    EEEE  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH    HH  EEEE  HHHHHHHHHHHHHH     EEEE              HHHHHH    EEEEEEEE  HHHHHHHHH     EEEE  HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH       EEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EEE              HHHHHHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDDDD                                        DDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERVIQETRLKQIYTAEEKYVVKTSFYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEIHRKLQAVDSGLIALRETSKHLEHKDNELRQKKKELLER 700
BenignSAV:                                                                                      R                  
gnomAD_SAV:     Q M V Q  RV  V       S   AKE V   I I   RC    M  G  TP G R   V G   T G      C  N Y    GS #     K F  
Conservation:  3267273256348934878238280963113538316316568413773446236423121300131125024023132120752379486249815463
SS_PSIPRED:    HHHHH     EEEE    EEEEEE      EEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    EEEE    EEEEEE     EEEE     HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   EEEE    EEEEE       EE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   DDD                           DDDDDDDDDDDDDDDD                                             DD      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDDDDDDDDDDDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIKEINVQKAKLVTELTNLIKICTSLHIQKVDLILQNTTVISEKNKLESDYMAASSQLRLTEQ 800
BenignSAV:                                     Q                                                                   
gnomAD_SAV:    T#  I  Q       RGS  #    #  K   Q TGI    RS   VE I K  # V L    #V E   L  TAA TF N       V T    HF Q 
Conservation:  4357578968723814765467321367124323511553145048424634320244043163217415364231214452654343222222441253
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                 D                                                   DD                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTLPQEYQTQVPTIPNGHNSSLPMVFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPTIVQEYTKREEEI 900
gnomAD_SAV:     L       K  * I T  T    P     VK        #  # L D  KFLF        D  NVT T   D      Y M    SV PKC  KAK  
Conservation:  0301651261082126325733741393523320581352122222222222222246125636556564283875386577557522873661542276
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH    HHHHH              HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH               HHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                         DDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                               
DO_IUPRED2A:                                        DDDDDDDDDD  D  DD  D           DD                         D   D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EQLTEELKGKKVELDQYRENISQVKERWLNPLKELVEKINEKFSNFFSSMQCAGEVDLHTENEEDYDKYGIRIRVKFRSSTQLHELTPHHQSGGERSVST 1000
gnomAD_SAV:     #  G         H       EI  S        L       G#S  #L##    N   GT   N   AMG   * *NR P  *  LYN     S    
Conservation:  2144136315203922764485558728546771654467268415834836798668516446777797759797952452649953467999977969
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE      HHHEEEEEEE                  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE     HHHEEEEEEE                   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE          EEEEEEE                  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                                                   D                         DDDDDDDDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLYLMALQELNRCPFRVVDEINQGMDPINERRVFEMVVNTACKENTSQYFFITPKLLQNLPYSEKMTVLFVYNGPHMLEPNTWNLKAFQRRRRRITFTQP 1100
gnomAD_SAV:    V H     K S   C I          # *WKM   F             #V      #      VA  S CSCLY    K  DF S L WWHCVA  HL
Conservation:  5999777967759997779999977753767667555626973437977777799973681823375585646741442302731236043123320100
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE    HH        EEEEE             HHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE              EEEEE             HHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE              EEEEE            HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                 D                                                            DD  DDDD
DO_SPOTD:                                                                                                    DDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                     DD

                
AA:            S 1101
Conservation:  1
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:  D
DO_SPOTD:      D
DO_IUPRED2A: