Q8N0S2  SYCE1_HUMAN

Gene name: SYCE1   Description: Synaptonemal complex central element protein 1

Length: 351    GTS: 1.006e-06   GTS percentile: 0.226     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 167      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGRSLTSKAEPTAGAVDRAEKAGGQDTSSQKIEDLMEMVQKLQKVGSLEPRVEVLINRINEVQQAKKKANKDLGEARTICEALQKELDSLHGEKVHLKE 100
gnomAD_SAV:    ISV A IL  VS   P#     TR E MT *      GVM R       * *GV P  W DV  K   R   VV   WN Y V K    L       PR 
Conservation:  9010011003010101111111111111121213144233113124624374442652444445475426238626321224262357635217334644
SS_PSIPRED:                   HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H   HHH
SS_PSSPRED:                       HHH       HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                                         
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             DDDDD                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILSKKQETLRILRLHCQEKESEAHRKHTMLQECKERISALNLQIEEEKNKQRQLRLAFEEQLEDLMGQHKDLWDFHMPERLAKEICALDSSKEQLLKEEK 200
BenignSAV:             R                      D                                                  R                 
gnomAD_SAV:    M  E  Q RMT Q   R   G   K  N   GYE   #V    T#K       P  T            RVF   Y   #  R S T H N    #TA  
Conservation:  4334455452444152423313125431234232343213224422540565457322133542342446134545123252144026212243640533
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                        D  DDDDD                                       D                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVKATLEDVKHQLCSLCGAEGPSTLDEGLFLRSQEAAATVQLFQEEHRKAEELLAAAAQRHQQLQQKCQQQQQKRQRLKEELEKHGMQVPAQAQSTQEEE 300
BenignSAV:                                         S                                                               
gnomAD_SAV:      NV P NMRR# #A     VSFI NKR LVHN   SS A   E Q #ET D       C  P    R    PRW K        E   SVEDRN   A 
Conservation:  3322432142124122101121111154156353573353376469422613272364211012344323223220333132200201121110101111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH        HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH           HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                    D      DDDD                                                            DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDDD                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                              DDDD         DDD       DDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50 
AA:            AGPGDVASPKPLKGERPGAAHQAGPDVLIGQEDTLHPDLSPRGFQEIKELF 351
BenignSAV:                     A                                  
gnomAD_SAV:      LR            A   R      FR    #HYAN     L K   IL
Conservation:  200121121111110111000002011111011111111111111111111
SS_PSIPRED:                       HH                      HHHHHHH 
SS_SPIDER3:                                               HHHH    
SS_PSSPRED:    H                                          HHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D