Q8N139  ABCA6_HUMAN

Gene name: ABCA6   Description: ATP-binding cassette sub-family A member 6

Length: 1617    GTS: 2.024e-06   GTS percentile: 0.662     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 835      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNMKQKSVYQQTKALLCKNFLKKWRMKRESLLEWGLSILLGLCIALFSSSMRNVQFPGMAPQNLGRVDKFNSSSLMVVYTPISNLTQQIMNKTALAPLLK 100
gnomAD_SAV:    I T    M*L   #  R D  Q R RR#DRS #C  *VFPR   P  PNF  SF*   I S*   SL   I    IA #ITV D I K  D     L   
Conservation:  7014113315651465245351347262332295212333231312110001100111150017824524312011417452511432652432123141
STMI:                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH            EEEE    HHHHHHHHHHHH HH  
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H            HHH  HHHH     EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DD                     D DDDDDDDDDDDD D                                                      
DO_SPOTD:      DDDD                            D                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                         N                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTSVIGAPNKTHMDEILLENLPYAMGIIFNETFSYKLIFFQGYNSPLWKEDFSAHCWDGYGEFSCTLTKYWNRGFVALQTAINTAIIEITTNHPVMEELM 200
gnomAD_SAV:    R     T H  Y  KV             S#PY  R   S R IRS *             Q    S     S   V RR   I ## T   NSL# Q I
Conservation:  4203130132203111000000124253914135915340010014001112131600001000801204611574347435555456224544533252
SS_PSIPRED:      EEEE   HHHHHHHHHHH    EEEEE      EEE          HH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEE   HHHHHHHHHH    EEEEEE     EEEEE                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEE   HHHHHHHHHHH   EEEEEE     EEE                              HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:              N                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVTAITMKTLPFITKNLLHNEMFILFFLLHFSPLVYFISLNVTKERKKSKNLMKMMGLQDSAFWLSWGLIYAGFIFIISIFVTIIITFTQIIVMTGFMVI 300
BenignSAV:                                                                                      I                  
gnomAD_SAV:       TV T   R #A SVPQDDL#    VFR F FA  #T D  E#  RC S V  V# *Y  VR F      V T VF  LLI  VILA  T T V I  
Conservation:  6425215331132110110111333223337332363352253386411413722657432677677453722342425225513220003101133224
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMM
SS_PSIPRED:       EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:       EEEE        HHHH  HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
SS_PSSPRED:       EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                       D  D DDDDDDDDD      D D                             DDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FILFFLYGLSLVALVFLMSVLLKKAVLTNLVVFLLTLFWGCLGFTVFYEQLPSSLEWILNICSPFAFTTGMIQIIKLDYNLNGVIFPDPSGDSYTMIATF 400
gnomAD_SAV:      PS       IVV   I      #L  SFI    SI S    V#E      AT *     F  S   A    S        A   S SP   C T  A 
Conservation:  3134347844343526543354532144323244313247245313312036023243533356545236433332242220210232222132122122
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     MMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH HHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHH   H  HHHHH    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     E         HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SMLLLDGLIYLLLALYFDKILPYGDERHYSPLFFLNSSSCFQHQRTNAKVIEKEIDAEHPSDDYFEPVAPEFQGKEAIRIRNVKKEYKGKSGKVEALKGL 500
gnomAD_SAV:             H I   H  R *LF  GC#    S   LL F             G#E  LLPG  I S        #     I       RFR     ES 
Conservation:  2362562336426537643442132512246286453335131210011111020212111331293443551665478524525161120122335264
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHH                 HHH     EEEE EEEEEE     EEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            H     HH         HHHHH                H     EEEEE EEEEEE     EEE   E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                        EEEEE EEEEE      EEEE   
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                                      DD                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFDIYEGQITAILGHSGAGKSSLLNILNGLSVPTEGSVTIYNKNLSEMQDLEEIRKITGVCPQFNVQFDILTVKENLSLFAKIKGIHLKEVEQEVQRILL 600
gnomAD_SAV:     Y MH A VM#MQVRI   R   I   # S LS     ANC    #QVK   D     DIY *#S  LN   M K  N   EV#  QP A    L Q   
Conservation:  1546665757556643559874764453632144174434432134320224131214759891534642895669814672678511224315633521
SS_PSIPRED:    EEEEE   EEEEE      HHHHHHHH       EEEEEE          HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE  EEEEEE      HHHHHHHH        EEEEE  EE      HHHHHHHH E        H   HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEE   EEEEEE      HHHHHHHHH        EEEEE      HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                          D                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                    GHSGAGKS                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELDMQNIQDNLAKHLSEGQKRKLTFGITILGDPQILLLDEPTTGLDPFSRDQVWSLLRERRADHVILFSTQSMDEADILADRKVIMSNGRLKCAGSSMFL 700
BenignSAV:              Y                                                                                       I  
gnomAD_SAV:      GV DS  KVT    AR#  R  V N V        S  AISE H#   VKE  #M #CK GRLSP  S  TG SH# # GRLVI K K #  RT I S
Conservation:  1635122551141175345475975766389483756886764568533642482363524124335435333475522454334441615332545267
SS_PSIPRED:    H   HHH    HH   HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH  EEEEEE  EEEE   HHHH
SS_SPIDER3:    H    HHHHHHH H    HHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHH   EEEEE  EEEEE   HHH
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHH      HHHHHHHHEE    EEEE          HHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH  EEEEE   EEEEE   HHH
DO_DISOPRED3:             D   DD D                                                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KRRWGLGYHLSLHRNEICNPEQITSFITHHIPDAKLKTENKEKLVYTLPLERTNTFPDLFSDLDKCSDQGVTGYDISMSTLNEVFMKLEGQSTIEQDFEQ 800
gnomAD_SAV:    E S*    Y  * GS  FK Q   T   R V#N EF A D  #   A          ##L E HN  EREMI     I   S I K  KERLIVK  LK 
Conservation:  8455344534643243142141343343257624243232223616288343422854751356112124523747435573675335642211210112
SS_PSIPRED:    HHH    EEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEEE    EEEEEE HHH   HHHHHHHHHH         EEEHHHHHHHHHHHH        HHH
SS_SPIDER3:    HHHH   EEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEE HHH  HHHHHHHHHHH  H    EEEEE   HHHHHHHH       HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH   EEEEEEE     HHHHHHHHHHH    EEE     EEEEEE        HHHHHHHHH        EEEE  HHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                    DDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEMIRDSESLNEMELAHSSFSEMQTAVSDMGLWRMQVFAMARLRFLKLKRQTKVLLTLLLVFGIAIFPLIVENIMYAMLNEKIDWEFKNELYFLSPGQLP 900
BenignSAV:                                                                               I                         
gnomAD_SAV:    M I    K RS    V  F   #EA M  TV SKT   ST W HS   RCH E    P      T  S LF  VIHVK   M Y K   K N PFAR  S
Conservation:  1110110211031210122312111112221684373254334545464231603223543232222403210200020000003343411983333211
STMI:                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          
SS_PSIPRED:    HHHHH      HHHHH    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HHH      HHHHHHH     H       HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_PSSPRED:               HHHH      HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              DDD D DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEPRTSLLIINNTESNIEDFIKSLKHQNILLEVDDFENRNGTDGLSYNGAIIVSGKQKDYRFSVVCNTKRLHCFPILMNIISNGLLQMFNHTQHIRIESS 1000
gnomAD_SAV:      LL   F  #IP TD          *TM F  GN  SG  IE FL#YR     V   VC#     D    #    VV TF   P    S P  T* KA 
Conservation:  1011518862727421432441253073614452142132312220538752431112232543354242245663634557633522322312544121
SS_PSIPRED:          HHHHH   HHHHHHHHHHH    EEEHHHHHH          EEEEEEEE   EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE
SS_SPIDER3:          HHHHH   H HHHHHHHH    HHHHHHHHHH          EEEEEEEE   EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE 
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHH    HHHHH           EEEEEEEEE    EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE 
DO_DISOPRED3:  DD                            DD                                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                             N                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PFPLSHIGLWTGLPDGSFFLFLVLCSISPYITMGSISDYKKNAKSQLWISGLYTSAYWCGQALVDVSFFILILLLMYLIFYIENMQYLLITSQIVFALVI 1100
gnomAD_SAV:      HR Q R   W LH   CSL   YN  RF     V H   DT F    L VCA V* Y      IT      F IC T  V  I   F K        M
Conservation:  2210000000001000112222222323734543421834134226853555245578395555733531244223122012100001010000232232
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMM
SS_PSIPRED:            HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH HHHHH  HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                            BB                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTPGYAASLVFFIYMISFIFRKRRKNSGLWSFYFFFASTIMFSITLINHFDLSILITTMVLVPSYTLLGFKTFLEVRDQEHYREFPEANFELSATDFLVC 1200
gnomAD_SAV:     A#  EG# L   C      H WGE#RD  *   S    F  A I*V    RRL  A I     HAV        L   DN    R ET   T AA V  
Conservation:  1227432735443644552432343221253414333211210110000000000211124271133122111001111000000000000000003221
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FIPYFQTLLFVFVLRCMELKCGKKRMRKDPVFRISPQSRDAKPNPEEPIDEDEDIQTERIRTATALTTSILDEKPVIIASCLHKEYAGQKKSCFSKRKKK 1300
gnomAD_SAV:     TH  #    I    #V    #    Q YT  *   R  AV    K  TN  DNT    V     MN    YK SI    R Q  C    # #   WRN 
Conservation:  4253452224334533751223112321773584223200112423131332346226613311222111024233534335375611322133232324
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                                                                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH                           HHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEEEE             E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E                    HHHHHHHHHHHHH          EEEEE EEEEE             E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEE                   HHHHHHHHHHHHHH         EEEEE  EEE             HH
DO_DISOPRED3:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAARNISFCVQEGEILGLLGPNGAGKSSSIRMISGITKPTAGEVELKGCSSVLGHLGYCPQENVLWPMLTLREHLEVYAAVKGLRKADARLAIARLVSAF 1400
BenignSAV:                          S                                                                              
gnomAD_SAV:      TI V L   Q K   VRRHSD   T PV   C     SS   #  D     VL A R#  #  RLLV FW  V M T I  F  G G  T TK     
Conservation:  3535448636348464775654886766343453712134583613120121010463756232674064325583345545831323301240443126
SS_PSIPRED:    EEEEEEEE      EEEEE      HHHHHHHHH        EEEE      HHH EE            HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    EEE  EEEEEE   EEEEE      HHHHHHHH         EEEE    HHHHH  E            HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HEHE EEE      EE         HHHHHHHHH        EEEE  H HHHHHH              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                D                                                                      
NP_BIND:                          GPNGAGKS                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLHEQLNVPVQKLTAGITRKLCFVLSLLGNSPVLLLDEPSTGIDPTGQQQMWQAIQAVVKNTERGVLLTTHNLAEAEALCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHL 1500
gnomAD_SAV:      QD   # EHT A  VK  S L     R    F P##TPM #EA RP* #  T ET I   VK      #    V D   H T V  R   WV T   M
Conservation:  2722242123217326136576434544424144466543233531242236334423321231445738424273343754454434716645753436
SS_PSIPRED:      HHH    HHH  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH  EEEEEE  EEEE   HHHH
SS_SPIDER3:       HH   EHHH   HHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHH    EEEEEE  EEEEE  HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH          HHHHHHHHHHH    EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH  EEEEE   EEEEE  HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KNKLGKDYILELKVKETSQVTLVHTEILKLFPQAAGQERYSSLLTYKLPVADVYPLSQTFHKLEAVKHNFNLEEYSLSQCTLEKVFLELSKEQEVGNFDE 1600
gnomAD_SAV:    *#    EN     G  MFEL V  A T   S * V R T  FF      M NL LP   L  F #  NK H    #F   I   I   FP  *      K
Conservation:  6345523829545322222111661352238516324352122334453212425543561266134222244454552236234324432423121123
SS_PSIPRED:    HHH    EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH      EE HHHHHHHHHHHH  HH      
SS_SPIDER3:    HHH     EEEEEE  H  HHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEE H     HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE   HHHHHHHHH   H      
SS_PSSPRED:    HHH    EEEEEEE     HHHHHHHHHHH HHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                    DDD                                              DD DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                   DDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10       
AA:            EIDTTMRWKLLPHSDEP 1617
gnomAD_SAV:      N  T  R P     R
Conservation:  21213123323111211
SS_PSIPRED:           HH        
SS_SPIDER3:                     
SS_PSSPRED:      HHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: