Q8N196  SIX5_HUMAN

Gene name: SIX5   Description: Homeobox protein SIX5

Length: 739    GTS: 1.059e-06   GTS percentile: 0.250     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 409      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATLPAEPSAGPAAGGEAVAAAAATEEEEEEARQLLQTLQAAEGEAAAAAGAGAGAAAAGAEGPGSPGVPGSPPEAASEPPTGLRFSPEQVACVCEALLQ 100
BenignSAV:              T                                                                                          
gnomAD_SAV:    T   S  L    V WW SM     A DKK G   P H S    S     V                          V       #L     E        
Conservation:  1111111111111111111111111111231111111111111111111111111111111111111111111111111111113232235464553625
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH HH H                                        HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                     HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGHAGRLSRFLGALPPAERLRGSDPVLRARALVAFQRGEYAELYRLLESRPFPAAHHAFLQDLYLRARYHEAERARGRALGAVDKYRLRKKFPLPKTIWD 200
PathogenicSAV:                                                          T                                          
gnomAD_SAV:       G  F S     # TA   SGV#  S      L     TDF G  D CS SGT  T   NF V    L T  T   #  SAE    H R L LQ    
Conservation:  5413514316425272121323163346557443142215146714552205142352257452537751696246744682534556754597824684
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH            
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      H HHHHHHHHHH HHHHHHHH          EEE            
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH            
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                           DDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GEETVYCFKERSRAALKACYRGNRYPTPDEKRRLATLTGLSLTQVSNWFKNRRQRDRTGAGGGAPCKSESDGNPTTEDESSRSPEDLERGAAPVSAEAAA 300
PathogenicSAV:                                                                                                T    
BenignSAV:                                                                           N                             
gnomAD_SAV:    S GAI  L KCC    NVY G SP   QE  HC VA                  H   VTR  ER  R  NR LP  E C P S N V  V #  TKV  
Conservation:  8554447664354137331301232634243423422126323524363334345561111311113435333213241111221212111211112210
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHH HHH                                  HHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:        H  HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH     EE                                      HHHHH        HHH 
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH    EE       HHH                                              
DO_DISOPRED3:                                                           D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD       DD  DDDDDDD  DDDDDDDD   D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                DDDDD DD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DNA_BIND:      GEETVYCFKERSRAALKACYRGNRYPTPDEKRRLATLTGLSLTQVSNWFKNRRQRDRTGA                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGSIFLAGTGPPAPCPASSSILVNGSFLAASGSPAVLLNGGPVIINGLALGEASSLGPLLLTGGGGAPPPQPSPQGASETKTSLVLDPQTGEVRLEEAQS 400
PathogenicSAV:                                                                 R                                   
gnomAD_SAV:     C  #PT  SRA#HWS#FF    KR I   RS S M   # S  M   V     N  AM    VR T#TS   T E R P IF    L  #    K    
Conservation:  4311111111111111111111111333423235231313171111111643262451111112111141111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:       EE                                     EEE                                      EEE      EE HH   
SS_SPIDER3:                         EE                    E                                                 EHHHH  
SS_PSSPRED:                        EE                                                                              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD   DDDDD                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EAPETKGAQVAAPGPALGEEVLGPLAQVVPGPPTAATFPLPPGPVPAVAAPQVVPLSPPPGYPTGLSPTSPLLNLPQVVPTSQVVTLPQAVGPLQLLAAG 500
BenignSAV:                                                                                            S            
gnomAD_SAV:     V#QS  D MV L       A RT     T ALMSVP   SL  MS L  SE L#FC TL   S  N#    F   HI S LH    SHV  L     TR
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112332421251123211113112
SS_PSIPRED:                                                                                                 EEE    
SS_SPIDER3:                                       H                                                EE              
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PGSPVKVAAAAGPANVHLINSGVGVTALQLPSATAPGNFLLANPVSGSPIVTGVALQQGKIILTATFPTSMLVSQVLPPAPGLALPLKPETAISVPEGGL 600
PathogenicSAV:                                                    M                                                
BenignSAV:                                                            V                                      M     
gnomAD_SAV:     D           TSL  F PW  L TV   PV    K FM  # FDC  LK#  V  R VVVA# L  N VI *  L V S T   R  ST  MR  D 
Conservation:  1211111111121111111111111111111122111322142525144611111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                          EEE                   EEE                                     
SS_SPIDER3:                                          EEE         E E     EEEEE        E                            
SS_PSSPRED:                                          EE                    E                                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                         D                                               DDD D   DDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVAPSPALPEAHALGTLSAQQPPPAAATTSSTSLPFSPDSPGLLPNFPAPPPEGLMLSPAAVPVWSAGLELSAGTEGLLEAEKGLGTQAPHTVLRLPDPD 700
BenignSAV:                             T         S                                                         M       
gnomAD_SAV:    L    #D  K##G     T   SRTV II     L C  C #VRSS RSS S E L  RV#MSIL  R   NT  K#   VG #P  EVS##M    ERN
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                                                   HHH                  
SS_SPIDER3:                                                                               H HHHH                   
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D D            DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        4
AA:            PEGLLLGATAGGEVDEGLEAEAKVLTQLQSVPVEEPLEL 739
gnomAD_SAV:     D# F   #T DQ  K    KG   S FRLA  K A Q#
Conservation:  111111111111111833211111111111111111111
SS_PSIPRED:                   HHHH     HHH            
SS_SPIDER3:        E        H       HHHHHH E E        
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                       DDDDBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD