Q8N1N4  K2C78_HUMAN

Gene name: KRT78   Description: Keratin, type II cytoskeletal 78

Length: 520    GTS: 2.771e-06   GTS percentile: 0.865     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 339      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLSPCRAQRGFSARSACSARSRGRSRGGFSSRGGFSSRSLNSFGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWSGGPGLSLCPPGGIQEVTINQNLLTPLKIEI 100
BenignSAV:           Q                 H                                                                  P        
gnomAD_SAV:    TFVC  QVK  I TH   FVCP CH#K C  N  S   GR K  ERW  V H#  *A ES P  Q ED R RS F   SL#S  K I    PP#      
Conservation:  9513311224766347642302311222222331267577424334333321242553226142224121353432365377943743503994655455
SS_PSIPRED:                    EE                                                                    EE  HH        
SS_SPIDER3:                 E E                                                                  EEEEE  HH         
SS_PSSPRED:                  EEE                                                                   EEEE         EEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_IUPRED2A:                     D    DD   DDDDD                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQGLSGSQQGLEPVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSK 200
BenignSAV:             M                                                                                           
gnomAD_SAV:    NT  R LWMH I Q G   K  V  T R W   H  #A GM CR   *KE NSR E PK G  VR E  K    K   **    T   # Q *D  C F 
Conservation:  7676636456774397399769979999966999997694999077755313133326332792332594137735533632646974255197676735
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                D                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:             D                                                                                      DDD
REGION:                                                      QQQGLSGSQQGLEPVFEAC                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YEEEAHRRATLENDFVVLKKDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLSMDNNRYLDFSSIITEVRARYEEIARSSKAEA 300
BenignSAV:                            A             T                                                              
gnomAD_SAV:     # KDR #  H  N L     M VI   #T   S  KT K H C  RY    D D #    RYAPM P VGK S  H  IS PKFCTW KALSWN    V
Conservation:  5429423344567774679965934535655734343273332297556537632644453363797777796626953359447453963753397566
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHH EEEEEHH  HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH    EEEEE HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH  EEEEEE   HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDD                                                                                                
REGION:                                                                  TQASDTSVVLSMDNNRYLDFSSI                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQISQLHQEIQRLQSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNLARLLCEYQELT 400
BenignSAV:                                                                   H                                     
gnomAD_SAV:      * RS DKQ LMP   Q   T* M#  T#  YR L   RNH   P N# S  *TS  EVV H K D   VE ELG## T  S   *#P Q   KFRV R
Conservation:  4347647937962675157425323615544933243275494335517731672443347749426447953952367369715764494494399994
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                          D          DDDDD                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSVGGSAVMSGGVGGGLGSTCGLGSGKGSPGSCCTSIVTGGSNIILGSGKDPVLDSCSVSGSSAGS 500
gnomAD_SAV:    IM I     T I #G    GV  IT DSP  L #YL ES T    V   #   IW  #   D  RF *INT  R     QS  E #L Y RPA  P TVF
Conservation:  6399599699779557993763736846345644412464101356323233315453333512532666364576111237513302453755547347
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHH   HHHH       EEEEEE                                        EEE                    
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHH  H HH        EEEEEE                                  E    E EE                    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE                                       EEE                     
DO_DISOPRED3:                    D                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20
AA:            SCHTILKKTVESSLKTSITY 520
gnomAD_SAV:    T  N  N AA LIM   VI*
Conservation:  45479756957965657445
SS_PSIPRED:       EEEEEE           
SS_SPIDER3:        EEEEE       E E 
SS_PSSPRED:       EEEEEE           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: