Q8N6Y0  USBP1_HUMAN

Gene name: USHBP1   Description: Usher syndrome type-1C protein-binding protein 1

Length: 703    GTS: 1.168e-06   GTS percentile: 0.297     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 446      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSARATRPRSRRGRHAPPGELDPVAESSEEVEAASGSSKPSFAPPPVSSGLEQLGPMEEVSGQGLGSRTDKKMDGGSGRELASAPEVPHKPAVEAHQAPE 100
gnomAD_SAV:    V  QTMWTG PQ  L#LL    TMPDN  # KTT E   #N V #L NPR     S  K R    R   VT #ER ADG P   HK    H   #     
Conservation:  7211203311122122111004112321232432122012151021130111450223312023221220120221111121012111003111111111
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHH           HHH       HHHH                               HHHH   HH
SS_SPIDER3:                               HHHHHHH                      HHHH                               HHH   HHH
SS_PSSPRED:                               HHHHHHH                                                                HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AALQYKETVPPGNGAPDVFQTLQHTLSSLEAAAAAWRHQPPSHSGPMEFEGTSEGGAGSLGKQEGAGSCQREAARLAERNAWLRLALSSREDELVRTQAS 200
gnomAD_SAV:    G  *  K     S D      VL  P F   V    C  LRG C LTD Q  TKR  V  ENEK  RR RQ   HM KT   #Q  PN L NK  HM V 
Conservation:  2110020111021112445117524644892461236112120211011211122021311123433212142303051513532252144466022213
SS_PSIPRED:    HHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEAIRAEKETLQKEVQELQDSLLRLEPCPHLSHNQAGGSGSGSSSSEADREPWETQDSFSLAHPLLRRLRSHSSTQILGSLPNQPLSPEMHIMEAQMEQL 300
gnomAD_SAV:    V  L*  EQ# R Q K         K  ARH Y   V    DP      G H   *N  F G    QC C    S    #FS    R GLYMT       
Conservation:  5021436531642431473224120201243021132322221213220325203323241335322343222413121334102023212127152346
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHH         HHH  HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                        HHHHHH                  HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD DDDD DD   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGSIEKLKCFNRLLSAVLQGYKGRCEGLSMQLGQREAEATALHLALQYSEHCEEAYRVLLALREADSGAGDEAPMSDLQAAEKEAWRLLAQEEAAMDAGA 400
gnomAD_SAV:    Q   G F    H   S    C S#* S  T  # #G  TI #       VR  AV GF  V QDSNP    KTSK## K  QN      T   DTT T# 
Conservation:  4514438643934734583327334824741734476216674698445525356433962602510212202002132121122131211212112312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDD                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                               DD  D                                 D DDDDDDDDDD               DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QQNPQPSPEGSSVDKPTPQEVAFQLRSYVQRLQERRSLMKILSEPGPTLAPMPTVPRAEAMVQAILGTQAGPALPRLEKTQIQQDLVAAREALADLMLRL 500
BenignSAV:                                           V                                                             
gnomAD_SAV:    R  LH   #D RA#N#AR    C  G H R#F VCCF V    ATC    S L MLC   T  P  RI#DSL ILQ          LV#K # V    Q 
Conservation:  1101011221151321211424118322622952326462312123111211111334724343335245431215257236544723377253641326
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD                      D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  D D DDDDDDDDDD  D               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLVRREKRGLELREAALRALGPAHVLLLEQLRWERAELQAGGANSSGGHSSGGGSSGDEEEWYQGLPAVPGGTSGIDGGQVGRAWDPEKLAQELAASLTR 600
BenignSAV:                             M                                                                           
gnomAD_SAV:    * AQC RW  # W   PQGPRA #LR  G# Q  WVK    R  R VR  NRS  RRYK#D         DA G   D   A     QN     V L  T
Conservation:  4724564637731234443343521442325225123112011011221221213111273225618722311221232213512122022255214417
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH                        HHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:              D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_IUPRED2A:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDD   D        DD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLDLQEQLQSLRRELEQVAQKGRARRSQSAELNRDLCKAHSALVLAFRGAHRKQEEQRRKLEQQMALMEAQQAEEVAVLEATARALGKPRPPLPPPQLGD 700
BenignSAV:                                                                                 V                       
gnomAD_SAV:         K*Q   CK R *A L  *  PY N QP    R G  T   D *R  Q R K HG  *    PTG KPDK MV  #TI   P    L FLL  RRE
Conservation:  1116415321511253112114332222223312343246535323232334221251144423322311141131123120111320221111332455
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                          D                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DD DD DDDDD   D  DD         D  D  DDD DD DDD  D      DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:               D DDDDDDDDDDDDDDDDDDD              DDD   DDDDDDDDDDDDDD    D      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                  
AA:            TFL 703
gnomAD_SAV:    A  
Conservation:  926
SS_PSIPRED:       
SS_SPIDER3:       
SS_PSSPRED:       
DO_DISOPRED3:  DDD
DO_SPOTD:      DDD
DO_IUPRED2A:   DDD