Q8N8U3  RTL3_HUMAN

Gene name: RTL3   Description: Retrotransposon Gag-like protein 3

Length: 475    GTS: 8.201e-07   GTS percentile: 0.147     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 233      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVEDLAASYIVLKLENEIRQAQVQWLMEENAALQAQIPELQKSQAAKEYDLLRKSSEAKEPQKLPEHMNPPAAWEAQKTPEFKEPQKPPEPQDLLPWEPP 100
gnomAD_SAV:    LM     PC#I    SQ Q V   *   K  #  V*  VIE   S   C I *N L T   E   KPL##    KT       *    QK   F    L 
Conservation:  9111111111231222124212011201131130221122112211231111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH  HHHH                   HHH                          
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH   HHHH HH                   HH                           
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHH                                                
DO_DISOPRED3:  DDDD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAWELQEAPAAPESLAPPATRESQKPPMAHEIPTVLEGQGPANTQDATIAQEPKNSEPQDPPNIEKPQEAPEYQETAAQLEFLELPPPQEPLEPSNAQEF 200
BenignSAV:                     S                                                                                   
gnomAD_SAV:          G   V    VSS NW     L VN   I  #S R T  *NV V  K NT   HN  KT RLH  S*HH P            R T  T   E  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111112112111111111111111111111111110121421232112211111111111111
SS_PSIPRED:     HH                                                                         HHHH                HHHH
SS_SPIDER3:      H                                                                         HHHHH               HHHH
SS_PSSPRED:                                                                                HHHH                HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LELSAAQESLEGLIVVETSAASEFPQAPIGLEATDFPLQYTLTFSGDSQKLPEFLVQLYSYMRVRGHLYPTEAALVSFVGNCFSGRAGWWFQLLLDIQSP 300
gnomAD_SAV:       LE  GPM  PTF DS TV     #LVV A   I R  SSI C  F     L  R *G T DGRP  A  G  L   S *   K# *# HI      T
Conservation:  1111111111111221141121111111111221111320411112332122232234111310110120121123122111212111112123110412
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     H                            E   HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHEEE      HHHHHHHHHHHH  H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:   DDD                     D D                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLEQCESFIPVLQDTFDNPENMKDANQCIHQLCQGEGHVATHFHLIAQELNWDESTLWIQFQEGLASSIQDELSHTSPATNLSDLITQCISLEEKPDPNP 400
gnomAD_SAV:         AN    V  N     D  #  HYVLH   E   L    #FFV   KR  #N R       S  TH   F#I  GI   #     V M   L  ST
Conservation:  2112212241222215213121103210312514321224313315331423231030123122412131121201213233244523341312231312
SS_PSIPRED:    HHH HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHH        HHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH HHHHHHHH       HHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                      DDDD
DO_IUPRED2A:                             D                                            D                        DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70     
AA:            LGKSSSAEGDGPESPPAENQPMQAAINCPHISEAEWVRWHKGRLCLYCGYPGHFARDCPVKPHQALQAGNIQACQ 475
gnomAD_SAV:      E    KV   K SAP T S R VV  A V# T  #H*P  H #F YDH    SGGY G SDRT *V SFPT  
Conservation:  212112221231103322311221122111212332222121022233612322213332142210312311111
SS_PSIPRED:                                    HHHHHHHH   EEEE       HH       HH          
SS_SPIDER3:                                    HHHHHHH    EEEE       HHH        HH        
SS_PSSPRED:                                    HHHHHHHHH   EEE     EE                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD                             DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                  
ZN_FING:                                                 RLCLYCGYPGHFARDCPVKP