Q8NA29  NLS1_HUMAN

Gene name: MFSD2A   Description: Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1

Length: 543    GTS: 8.832e-07   GTS percentile: 0.173     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 212      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAKGEGAESGSAAGLLPTSILQSTERPAQVKKEPKKKKQQLSVCNKLCYALGGAPYQVTGCALGFFLQIYLLDVAQKDEEVVFCFSSFQVGPFSASIILF 100
gnomAD_SAV:           Q CF      P   P   L  P N GL    H VT#  R  HG W GS   M         LH   E    V     L  #    L      S
Conservation:  1000000000000000011111001000101111111112532224343424625243342323322221231321111111111111142432573443
STMI:                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                     HHHH              HH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHH         HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       H                      HHHHHEH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                      HHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:   D                         DDDDDDD                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGRAWDAITDPLVGLCISKSPWTCLGRLMPWIIFSTPLAVIAYFLIWFVPDFPHGQTYWYLLFYCLFETMVTCFHVPYSALTMFISTEQTERDSATAYRM 200
PathogenicSAV:                                                                        M      L                     
gnomAD_SAV:      * R T  E  M       S SFQ C    F     P I     # LMHN   S AC H       * T M      L F    G K   W CT TC  
Conservation:  2863254225824634433422311553245432536633347344845522001312743233424435123333643344324312313544322255
STMI:          M                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH  HHHHHH          HHHHHH   HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH HHHEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH        HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVEVLGTVLGTAIQGQIVGQADTPCFQDLNSSTVASQSANHTHGTTSHRETQKAYLLAAGVIVCIYIICAVILILGVREQREPYEAQQSEPIAYFRGLRL 300
BenignSAV:                           M                                                                             
gnomAD_SAV:    IM     L  #   R  M RV M      S CIA L  GSY R N   GKM   *     F#A# C T T     CMW *  L  # HCKTVT LQS W 
Conservation:  3364383527554473545122015100000101010002010010131131148245564532474353235139759324100011121237127413
STMI:                                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH   EEE             HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE             HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDD                                                   D          
DO_SPOTD:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D     DD                DDDD            
DO_IUPRED2A:                                          DDDDD                                                        
CARBOHYD:                                   N         N                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VMSHGPYIKLITGFLFTSLAFMLVEGNFVLFCTYTLGFRNEFQNLLLAIMLSATLTIPIWQWFLTRFGKKTAVYVGISSAVPFLILVALMESNLIITYAV 400
PathogenicSAV:                                                    L                                                
gnomAD_SAV:      N S  VR T A        V          I N D CS     P  #    A AT      SIQ    #     T         M V G S V# HV 
Conservation:  4226278237425786653545526565578624432542336346446645634469285447235994244528311337523334222134243623
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVAAGISVAAAFLLPWSMLPDVIDDFHLKQPHFHGTEPIFFSFYVFFTKFASGVSLGISTLSLDFAGYQTRGCSQPERVKFTLNMLVTMAPIVLILLGLL 500
PathogenicSAV:               H                                                                                     
gnomAD_SAV:       G          H         E    R R  A        C                     SR  SCV L AQS R      M    M        
Conservation:  4225625452526567779975674834132011628669676769827455643463845472645813316183006124744643328324522862
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E       HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40   
AA:            LFKMYPIDEERRRQNKKALQALRDEASSSGCSETDSTELASIL 543
gnomAD_SAV:      #   T  AMWW    SR   KY     #     C   #   
Conservation:  6512443241132121104202211011120101111211112
STMI:          M                                          
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                    DDD