Q8NA58  PNDC1_HUMAN

Gene name: PNLDC1   Description: Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1

Length: 520    GTS: 1.751e-06   GTS percentile: 0.559     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 264      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFCTRGLLFFAFLAGLDIEFTGLRSNLSGPQQISLFDLPSEWYLKTRQSVQQFTVCQIGLSVFSAIEGEANKYIAHSCNFYLFPTTFGILDSEFSFQASS 100
gnomAD_SAV:    IL ALRR S #  V V VQ#A  C  P WT   G        C    R# R       RS    ST    D  MTYF D CF  AK    G     #V R
Conservation:  1110061011111115936565633122110235556472479082524441843275966371220112135223345544452433118255345456
SS_PSIPRED:       HHHHHHH  EEEEE                     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHEEEEEEE      EEEEEEEEEEEE         EEEEEHHH
SS_SPIDER3:        HHHHH   EEEEEEEE                  HHHHHHHHHHHHH    HHEEEEEEEEEE    EEEEEEEEEEEE          EEEEHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHH  EEEEEEE                   HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEEE        E EEEEEEEE         EEEEEHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                         D E                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VQFLNQYGFNYNKFLKNGIPYMNEEQEKKIRHDILTGNWRVRSSPDKDQIKVVIDEVTRWLELAKEGDWMTLPGITGFQAFEVQLVLRQALPNIWTVLKD 200
gnomAD_SAV:     R     # D  E   H# L TSK  K   KRN   R *I H  L E    M  EAGMW  G T   N L  S           M    P  DF M V V
Conservation:  5154223444544432145665432452143213314212114112411421432135214012132223181332535211113352333224551112
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHH       HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH    EEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHH      HHHE       HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGVVVKKVSKQHRWYLQNTSCDRESCWKENILLSARGFSVFFQMLVKAQKPLVGHNMMMDLLHLHEKFFRPLPESYDQFKQNIHSLFPVLIDTKSVTKDI 300
gnomAD_SAV:    D #I E     RCL        *  #   KV   TG   II E  MTT  L  EN VITNV Y   R  T   * HH   *KF   L F VVA      V
Conservation:  1353627541238111122113220143313524638632452344352665696864354445526652287122145512210535344643333211
SS_PSIPRED:      EEEEEEEHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   EEEHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEEEE   HHHH H   HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   EE HHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   EEEE       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                    D                                        
SITE:                                                                                                       K      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WKEMNFPRVSNLSEVYEVLNSDLNPTKNSGPEIVHASRCEKYVETKCPHEAAYDAFLCGSVLLKVAHLLLQKIYHIDPVPESSFPQYLDVLAPYVNQVNL 400
gnomAD_SAV:      Q SLSSALT LD #D   N F            P  Y RC   E R   T    F E   F     I    C  # MLV   S    MP S M   KF
Conservation:  1411133033272444215312223201111131221140364112136565677654734433233443111111011011254225136234385755
SS_PSIPRED:    HHH        HHHHHHHHHH           EE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:    HHH        HHHHHHHHH H          EEE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:    HHHH       HHHHHHHHHH           EE              HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                DD                                                                     
METAL:                                                              D                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRAGVPKINFSGPDYPSIRPPILILSVKRWPGVSEQQVYHKFQNLCKFDVRRLTRSQFLLLTNKFKDARNILKEYRDHPTLCISLYRYWRHSPNVNCLLQ 500
gnomAD_SAV:     *VRI EMI      SG *      #I K*L   KL   R       S I#* #        S    VW V RGDWH L P# C  CH #   KIS    
Conservation:  5642532544352503113353343143142223313331342125264332321245653534411111153254156051421222611120112011
STMI:                                                                                                        MMMMMM
SS_PSIPRED:    HH    EEE            EEEEEE       HHHHHHHHHH  EEEEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEE           HHHH
SS_SPIDER3:    HH    EEE            EEEEEE       HHHHHHHH    EEEEEEEE  EEEEEE  HHHHHHHHHHH     EEEEE  HHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    H     EEE            EEEEEE       HHHHHHHHHH   EEEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHHH    EEEEEE HHH      EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20
AA:            VCGIVTAWALLAFILGRSGT 520
gnomAD_SAV:     S VM T  I V       A
Conservation:  11111012111111111111
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:    DD  D  DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                       DDD
DO_IUPRED2A: