Q8NCS7  CTL5_HUMAN

Gene name: SLC44A5   Description: Choline transporter-like protein 5

Length: 719    GTS: 1.478e-06   GTS percentile: 0.438     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 317      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNDTEKPADTPSEEEDFGDPRTYDPDFKGPVANRSCTDVLCCMIFLLCIIGYIVLGLVAWVHGDPRRAAYPTDSQGHFCGQKGTPNENKTILFYFNLLRC 100
gnomAD_SAV:     Y  K Q# N   # G  NSG HH G  R         I  RT    Y    #      # R     SV  AEN SRS   #  LS I      YK  C 
Conservation:  1111111111111111110100121031222111124422222421213213213213562366543434543516135511420411321445343316
STMI:                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                         
SS_PSIPRED:                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            EEEEEEEEE 
SS_SPIDER3:                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                E           EEEEEEEEE  
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBB                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
CARBOHYD:                                                                                             N            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSPSVLLNLQCPTTQICVSKCPEKFLTYVEMQLLYTKDKSYWEDYRQFCKTTAKPVKSLTQLLLDDDCPTAIFPSKPFLQRCFPDFSTKNGTLTIGSKMM 200
gnomAD_SAV:        M P   Y   R# A      CS        F  ER     *H L   A  H EA   F#     SKE             A CA          #I
Conservation:  2122223131645254762296102123000000100100001122139211000010202330122761322442332456461100011030513020
SS_PSIPRED:      HHHHHH      EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH        HHHHHH            HHHHHH         EEEE  EEE
SS_SPIDER3:        EEEEEE   EEEEEE       EEEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH       HHHHH      HHH    HHHHH          EEEEEEEEE
SS_PSSPRED:        EEEEEE    EEEE    HHHHHHHHHHHHEE    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH            HHHHHH         EEEEEEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                               N          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQDGNGGTRSVVELGIAANGINKLLDAKSLGLKVFEDYARTWYWILIGLTIAMVLSWIFLILLRFIAGCLFWVFMIGVIGIIGYGIWHCYQQYTNLQERP 300
gnomAD_SAV:        K V T  A VR TS # S   YT LVE  AL  CE S     LS M    F    F F        YCI    MM  TV R     *      KSR
Conservation:  2012020112313310431130013314142355257431440464245235433732553667425134442332344132446323830450051000
STMI:                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    EE     EEEEEEHHHHH HHHHHH HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EE     EEEEEEHHHHH  HHHHHHHHH   HEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    EE      EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSVLTIYDIGIQTNISMYFELQQTWFTFMIILCIIEVIVILMLIFLRNRIRVAIILLKEGSKAIGYVPSTLVYPALTFILLSICICYWVVTAVFLATSGV 400
gnomAD_SAV:        A C NR    T T      ICL   MTI TTGL   HV LS   Q L TTF#      TV NIL  F CRV  CFV   Y     M  AL VIL A
Conservation:  2302240334532432363124557323342422262243334335414402341543745655334225436832862652464274323534867750
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:      EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:      EEEEEEE EEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE     EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:      EEEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                   N                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVYKVIAPGGHCIHENQTCDPEIFNTTEIAKACPGALCNFAFYGGKSLYHQYIPTFHVYNLFVFLWLINFVIALGQCALAGAFATYYWAMKKPDDIPRYP 500
gnomAD_SAV:     IH   P EE *VR     V     A  VT  F     T T       CY C LAV     LA       IT   R T D   S  *  IRT  Y A*  
Conservation:  4373412110090012029161011011100171020817118321403422311773253436694398336655556686955799611851456126
STMI:                                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:     EEEEEE             HHH  HHHHHHH       EEEE    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H
SS_SPIDER3:     EEEEE     E        HHH  HHHHHHH    E  EEEE    EH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:     EEEEE     EE       HHH  HHHHHHH  HHHHHHHH    HHHHH    EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFTAFGRAIRYHTGSLAFGSLIIALIQMFKIVLEYLDHRLKRTQNTLSKFLQCCLRCCFWCLENAIKFLNRNAYIMIAIYGRNFCRSAKDAFNLLMRNVL 600
gnomAD_SAV:    I  V  Q  Q  S         L  L LSTTIPD  E C  C EK  CE    YV F       T#R V   T     L     R# ENG YH  T    
Conservation:  5126513433563643564454651342243234542142311140124541163245353342253334233344474582355144225307233433
STMI:                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE H   H HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVAVTDEVTYFVLFLGKLLVAGSIGVLAFLFFTQRLPVIAQGPASLNYYWVPLLTVIFGSYLIAHGFFSVYAMCVETIFICFCEDLERNDGSTEKPYFVT 700
gnomAD_SAV:    EI      A L   V     V  VSI T  #  #G      A     C     V  #            IC T  Q  L  #      IN  I NT  I 
Conservation:  5734473552345245645635237335545662331011002107753649445113453344255444523653544564324542438611433332
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEE 
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH             EE  
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   EE     EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                               DDD        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        2
AA:            PNLHGILIKKQLVPQKQKE 719
gnomAD_SAV:    L  Y M  R   A  #  K
Conservation:  1042122011111110111
SS_PSIPRED:      HHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:           BBBBBBBBBB
DO_SPOTD:               DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: