Q8NDV3  SMC1B_HUMAN

Gene name: SMC1B   Description: Structural maintenance of chromosomes protein 1B

Length: 1235    GTS: 1.276e-06   GTS percentile: 0.344     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 496      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKNIQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRG 100
gnomAD_SAV:    V R K  I  S  L   GR    LW  IY V L     A I  T     A  M   K     GV   V V N#         M      K* ALV   Q 
Conservation:  5202213133454333512244442252532232325444423623544444222447323245435435325141261512250133215216151414
SS_PSIPRED:       EEEEEEE        EEE       EEE      HHHHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHH          EEEEEEEEE     EEEEEEEEE 
SS_SPIDER3:      EEEEEEEEE      EEEE       EEE        HHHHHHHHHH HHHHH  H HHHHHHH          EEEEEEEEE     EEEEEEEEE 
SS_PSSPRED:      EEEEEE          EEE       EEE      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEEEEEE    EEEEEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDD                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                      GPNGSGKS                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GCSEFRFNDNLVSRSVYIAELEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEEDAQFNFNKKKNIAAERRQAK 200
gnomAD_SAV:        LP #  F RCCI #T*  #M VT RG K  F    #  V LT     I           F   C     T    K     S      VT  C E R
Conservation:  1243413421153320721363344422453353465535524545355665355615427144215812553152383566592755863453635342
SS_PSIPRED:      EEEEE  EE  HHHHHHHHHH         EEEE HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEE  EEE HHHHHHHHHH         EEE   HHHHHH   HHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EEEE      HHHHHHHHHHH  EEE  EEEEE HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                               D DD   D                                  D  DD DDD DD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNTKLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK 300
gnomAD_SAV:    S T   GH H        KNT   V  IFR   N L  S  S #M #E     G  F#Y       E KR       *EI R   L G  S   S   V 
Conservation:  1531674476182234001224428338746511411310161023013200410200072136218522823272361347433114115431432675
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD D                                       D     D   D  DDDDDD D      DD                          D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                          D        DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D DDD      DDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILHKKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQ 400
gnomAD_SAV:    G    F   RRVHA    KTNIK   F  GG #  QQ GM N  DSR R      K  V E Q        PHCF   Q H     SA   E    E DK
Conservation:  4753547214634123123231340111342322422053035214430564323330102212338322842272285414343463216314542442
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:     D      DD DDDDDD DDD DD DDDDDD DD                DDDDBBBBBDDDDDDDDDD                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDD   DDDDDD    DDDDDDDDDDDDD                                                              DDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KTDEERLAFEKRRHGEVQGNLKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEFNEELNLIRSELQNAGIDTHEGKRQQKR 500
BenignSAV:                                                                             V                           
gnomAD_SAV:     IN DT S    SQ D       MN  V       Q         VYY    I      MV T    P         Y  G V     V NN RIH  R 
Conservation:  4430353252256216242144310135541124346634621251145242112430711332031062144415720211444593451473455245
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:              DD D   D  DD  D  D   D          D  D  DD  D  DDD DD D                    DDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                             DD           
DO_IUPRED2A:           DDDDD      DDDDD                                   DDD                         D DDDD DD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGRFITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT 600
gnomAD_SAV:    V# V # NK       E   H  L  D  *  # SR   Q  A SAAD   I    VQL  Q#       FTVG       S G   F  Y IAT   RA
Conservation:  2723425344472245977258559668675666666643552886846345734860448246266649855867262644638644363452486632
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH EEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EE HHH       HHHH     EEEEEEEE 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       EEHHH      HHHHHHHHHH      EEEE  HHHHHHHHHHHHH     EEE  HHH     H HHH      EEEEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE  HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHH   EEEEEEEEE
DO_DISOPRED3:    DD                                                                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLKYKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQ 700
gnomAD_SAV:        P    EYM      S  V   # T FR   T Q    N    F F M    LGE  #  T CN  #       *R   #   S T I CRG H   
Conservation:  1222545754747554658564475514752421824574657648146948877543730562284544400541241142154425361267726944
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHHH       EEEE  EEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHH       EEEEE  EEE     EE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHHH    EEEEEEE  EEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDBDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                     K                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQTLIQGTQTRLKYSQNELEMIKKKHLVAFYQEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHFCEEIGVENIREFENKHVKRQ 800
BenignSAV:                                                              Q                                          
gnomAD_SAV:              QF CA   P L     F   H   Y           RY      N  Q *           I  G   P      M  TH    E   W 
Conservation:  4145349225747752365504245162121152643364428322320341113003112421341234325506712782389525863671334525
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                                                        BBBBBDDDDD D               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   D   
MODRES_A:                  K                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEIDQKRYFYKKMLTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKETIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA 900
gnomAD_SAV:      M R         SQ    V C CR       N              # Q            H  T  H      HFA  CT K I   VKG W     
Conservation:  3625245444434133724558631233251111200431230322103103252711260053512122224430111232140113123530231311
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                   DDDD                                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DD D             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAESTQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLR 1000
gnomAD_SAV:      GAM     D #NT   QK* Q D D    N   RVTQ   ##W    T#   TR D D   E V NCG  #V K A GF  D   V H   V     M
Conservation:  1253112274522135424843441588497267534426052192655634252115211211412444583142477406012330201426320230
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH   HHH  HHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H    HHH    HHHHHHHH        H    HHHHHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH         HHH           HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_IUPRED2A:                                                                  D                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLLQQVASQEDILLKTAAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSISIDQIYKKLCRNNSAQAFLSPENPE 1100
BenignSAV:            A                                         M                                                  
gnomAD_SAV:       K      #M VR      QT    N  K  L  A     TG   V M    LK  R  TCN C  S  Y  M VVK   Q  K  GV  L T     
Conservation:  0512120103025023158656714451143355432154643432154132236124434632383175543332551677266462697725253345
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE  E    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E        
DO_DISOPRED3:                                                                                               D  D  D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                  D    
MODRES_A:                                      K                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALALLFAVHSFRPAPFFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADALIGIY 1200
gnomAD_SAV:            H   V   Q   T  F   Q   V           HS         V  P I     L  HT    E L   T           VNV  SV 
Conservation:  5657384343623665533345235443433546554574342372643544534244533342573232422301115222243422323433253543
SS_PSIPRED:          EEEEEE        HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE  HHHHHH    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHEEEEE
SS_SPIDER3:     HHH  EEEEEE        HHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEHHHH   H  HHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHHHHH HHEEEEE
SS_PSSPRED:          EEEEEE              HHHHHHHHHHHHHHHH      EEE HHHHH     HHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHE  
DO_DISOPRED3:  D  D            D DDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30     
AA:            PEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR 1235
BenignSAV:                                T       
gnomAD_SAV:    A NN SRL Q  N    P  N  #  NT  L G C
Conservation:  31012011321231222023101101000111111
SS_PSIPRED:           EEEEEEEE HH                 
SS_SPIDER3:           EEEEEEE   H                 
SS_PSSPRED:           EEEEEEE                     
DO_DISOPRED3:                      DDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                        DDDDDDDDDDDDDD