Q8NG48  LINES_HUMAN

Gene name: LINS1   Description: Protein Lines homolog 1

Length: 757    GTS: 1.359e-06   GTS percentile: 0.383     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 436      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKVFCEVLEELYKKVLLGATLENDSHDYIFYLNPAVSDQDCSTATSLEWANTCGIQGRHQPISVGVAPIAVAPVCLKTNSQMSGSREVMLLQLTVIKVMT 100
BenignSAV:                                 V                                                                       
gnomAD_SAV:        YK   #    #  R A    #   S        H  G A I F  TSP     GYR V F   S# IVL  S ST    S GKIV #* IMV  L 
Conservation:  2101101512251033131151021113301502131111010001100100011011123221112113010000000000000073143256542232
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH           EEEEE              HHH                   EE   HHH        HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHH            EEEEE               HHH                  E               HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH          EEEEE                                    EE              HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD                        
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRILSVKTEFHAKEQYRDVIKILLESAKVDSKLICMFQNSDKLLSHMAAQCLALLLYFQLREKITLSNSWIAFCQKNLSEYSESNKAIYCLWTLTAIIKE 200
BenignSAV:                                            T                                                            
gnomAD_SAV:     Q     IK P *  H      V   DE NCN   I H TE    Y#TT  R        IGEM FIT  V   HE V   F RSITV F  SFI V   
Conservation:  1131301220122013013311752201322264023110634446453443412523341112032016101412362122121132055344414352
SS_PSIPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFKDSCSQKTEILKQFLTHFDTIFEVFYNSLFSQHFENCRDTSKIVNILMCFLDLLELLIASRIHLKLHFTCQRILFLKPSCMLEVITWPIQAFVKRKVI 300
BenignSAV:                                            W                                                            
gnomAD_SAV:         F    Q      IR  SVS A     #CHR    PYS  M   V #SP  F   VTC V VRVR A**    S  C KVKISA  VE#S  K#  
Conservation:  3432001131424215521651251144114521010000000111224223466573725352011213245442222230370221222223456425
SS_PSIPRED:    HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H       HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HEHHEH HHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH     HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFLKKCLLCKVGEDLCRGSVPALMPPDHHVAVDMLALANAVLQAVNSGLLKTLSVYEKHSFFGGDEVQPECELITSPDHVILRAASLVIMKSLEIKFQNY 400
PathogenicSAV:             K                                                                                       
BenignSAV:                                   V                                                                     
gnomAD_SAV:       R S#    S    H#  S  LL ER IV  # T S    ESM L F  I   S  L CS SYK HL    TI TGR M *TT# LVLNFV  #Y*  
Conservation:  5556525714257510021112100210020182226412582251134621413023122865100132010001270435763583447546332321
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHHH               HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   HHEE             HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH  EE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                DDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSASEVKVDLQRFMSELLTFLKPHLQPSLQLHNPCKWLSRVFIEQDDDMLEAAKASLGIYLTLTRGCEATESLTQGKEMWDHHTHENGYNPHCIFLFFLK 500
BenignSAV:          M                                                                 T                            
gnomAD_SAV:     L  AM #   S T   V#      RL  K  SL R*  W      N I D  RSL DSC I S  Y  A T   ER* G Q IY  AC LY T S   E
Conservation:  1111312213112401641652111211210042915632483779876386643251464220101011011002031320137225257694734462
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHH      HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                             DDD                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                D                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NIGFDSTVLLDFLISSETCFLEYFVRYLKLLQKDWDNFFTICNNFDATESKYDISICGCVPSLVQDQSSNQTIPHRLTAPHSHRDVCARHSWASDAPSEP 600
BenignSAV:                                             V                                                           
gnomAD_SAV:     TR   I VH IF  L     *CL  C R P*  *N L #V # #GTP    AV  F   S VFH      A S C  S   R V  TWR#   NT C  
Conservation:  4428834477779763989886756389737113510620461021011001010100021210222111011001111001000001102011001100
SS_PSIPRED:    HH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH         EEEEE                              HH           
SS_SPIDER3:    H    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH         EEEEEE                           HH            
SS_PSSPRED:    HH    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH          EEE                                            
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                        DDDDDDD                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKAVMSKGAHTMCASSLSSPRASQSLVDYDSSDDSDVESTEQCLANSKQTSLHQQATKEIQDAAGTSRDKKEFSLEPPSRPLVLKEFDTAFSFDCEVAPN 700
BenignSAV:         V                                   D                                      S                    
gnomAD_SAV:        V RRTY #YVF VFPLWV *R  # N CN#  #   D W  #TE A V E VA  ME # RRI N N LNFGSSLS P       # FLG  I A#
Conservation:  0000001010100100111101112663633542521310111321012112113001123000000010000002000011011001011100101110
SS_PSIPRED:    HHHH                                   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH                                    
SS_SPIDER3:               E                            H H        H HHHHHHHHHH                     H               
SS_PSSPRED:                                             HHH        HHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                            D DDDDD       DD DD   DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                        
MODRES_P:                                        S                                                                 

                       10        20        30        40        50       
AA:            DVVSEVGIFYRIVKCFQELQDAICRLQKKNLFPYNPTALLKLLKYIEVISNKTMNTL 757
BenignSAV:       I                                                      
gnomAD_SAV:     AIF LR   I A S RD    V HW   TI  C   VF    RF KM     #S F
Conservation:  100100022043218713631360463141445655248567610410110001211
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                     DDDDDD
DO_SPOTD:                                                           DDDD
DO_IUPRED2A: