Q8NHM5  KDM2B_HUMAN

Gene name: KDM2B   Description: Lysine-specific demethylase 2B

Length: 1336    GTS: 1.005e-06   GTS percentile: 0.225     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 576      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGPQMGGSAEDHPPRKRHAAEKQKKKTVIYTKCFEFESATQRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQLYQGDFVHAMEGKDFNYEYVQRE 100
BenignSAV:                       R                                                                                 
gnomAD_SAV:    LV  #K EP   Q L*  R P    NE  T   Y  ## VI  SV        Q  W    #          E C    R N   T V        I   
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111122532314223113235521353433234402003121331022424643344842
SS_PSIPRED:                                    EE                        HHHH     EEHHHHHH        EEE  HHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:                          H       EEEE                        HHHH      EHHHHH         EEEE  HH  HHHHHH 
SS_PSSPRED:                       HHHHHH     EEE                                  EEHHHHHH        EEE  HHH HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D D                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDD                                                
MODRES_P:                                                              S                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALRVPLIFREKDGLGIKMPDPDFTVRDVKLLVGSRRLVDVMDVNTQKGTEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVKRPTVVDLVDWVD 200
gnomAD_SAV:      G   V Q     E     SN    EIR                   MG       H   M   R H                N   #  M   M  M 
Conservation:  6841755712136895247332545364424697682598557489854897646725966654159377596679999897862363983434346746
SS_PSIPRED:         EEEE               HHHHHHHH    EEEEEE       EEEHHHHHHHH   HHH   EEEEEEEEE   HHHHH     HHHH  HHH
SS_SPIDER3:         EEEE       E       HHHHHHHH    EEEEEE       EEEHHHHHHHH   HH     EEEEEEEEE   HHHHE     HH   HHH
SS_PSSPRED:    H    EEEE               HHHHHHHH   EEEEEEE          HHHHHHHHH         EEEEEEE   HHHHHHH          HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NMWPQHLKEKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGTSVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIEL 300
gnomAD_SAV:     T      Q  SDTM    KT  L       I M                   I Q            #  V   K       N      H  Q   #  
Conservation:  3366326523735344232554666646465363344357454568776655343341654454442015644452653546432334533401554424
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHH HHHHHHHHH     EEEEEEE    EEEEEE      EEEEEEEE  EEEEE   HHHHHHHHHHHH        HH EE EEEEEEE
SS_SPIDER3:    H   HH  H  HHHHHHHH     EEEEEEEEE    EEEEEEE     EEEEEEEE  EEEE    HHHHHHHHHHHH      EE   HEEEEEEEEE
SS_PSSPRED:    H       HHHHHHHHHHHHH   HHHEEEEEE     EEEEEE    EEEEEEEEE  EEEEE   HHHHHHHHHHHH               EEEEEE
DO_DISOPRED3:            D DDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                             T                   K                                         
METAL:                                                  H D                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KQGYTFFIPSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCVTQRSHLTQEYQRESMLIDAPRKPSID 400
gnomAD_SAV:                   I N#  A    R L     M V  W  G    M  P R      C V        M      F  # KH    T T  R      
Conservation:  1452453484674456455345555585485546544661633566664531333286334454564575325342145342213232111111111111
SS_PSIPRED:        EEEE    EEEEEE   EEEEE  HHHH  HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    E   EEEE   E EEEE    EEEE         HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:        EEEEE     EEEE   EEEE  EEE    HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                       DDDD  D   DD    
METAL:                      H                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDEEGEGRDRAPKPPTDGSTSPTSTPSEDQEALGKKPKAPALRFLKRTLSNESEESVKSTTLAVDYPKTPTGSPAT 500
gnomAD_SAV:    S  LN  P    GS    SRK KK #KA K#   S#NL SGA   S# P  #H  V R   E R PLL  TS FD L KI     M I H# #LPVFLT#
Conservation:  1111211110221011111111111110011111021000111012111111112113412240102111111212631111221031312221111110
SS_PSIPRED:          HHHHHHHH      HHHH                             HHHH      HHHHH HH      HHHH                   
SS_SPIDER3:          HHHHHHHH    HHHHHHHHH                        H HHH       HHHHHHHHH     H                      
SS_PSSPRED:             HHHHHHH    HHH                                        HHHHHHH                              
DO_DISOPRED3:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                               S  S               T   S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVSAKWTHLTEFELKGLKALVEKLESLPENKKCVPEGIEDPQALLEGVKNVLKEHADDDPSLAITGVPVVTWPKKTPKNRAVGRPKGKLGPASAVKLAAN 600
gnomAD_SAV:    QI     R  G  R       Q     L    Y  K      T    M      QT  A#  S     A         D V         S   A   T 
Conservation:  1010121157257317720742465355225444726415414741235134233224223442571765145331011111142312213101111220
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH      HH                             HHHHH    
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHH HHHHHHH                                        HHHH  
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHH H             HHHH   HHHHHH                                              
DO_DISOPRED3:      D                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD           DD         DDDDDDDDDD   DDDDDDDDD   D          DDDD   DDDDDDDDDDDDDDD   DDDD    D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCL 700
gnomAD_SAV:    QPM#                Q   #     R        E      VV   V        L  L #K#  K M#K   #            D V      
Conservation:  5213336555466526266241456164583644456886444445334454483886674824845422322201211111138787529438485184
SS_PSIPRED:                    HHH              HHH        EEEHHHH         EEEE               HH   HH  HHHHH       
SS_SPIDER3:                 E  HH H         HH HHH         EEE HH         EEEEE          HHH  HHHHHH H  HH H       
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHH                        HHHHHHHH      EEEE             HHH HHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDD D                DDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDBDD             BDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD                                                                         DD                       
METAL:                     C  C  C    C  C  C               C    C          C  C                      C  C    H  C 
ZN_FING:            ARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCI      TAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCL

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQKRGPGFKYASNLPGSLLKEQKMNRDNKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL 800
gnomAD_SAV:          A#  N       R         R   H        S            #  E E   GNW  K  DE WHGL  QL   L# S  C  Y  M  
Conservation:  1112327354255663844637212221132013111122313213214311012311111000132222410210121211120112111214143124
SS_PSIPRED:           EE                                      HHH            HHH                                HHH
SS_SPIDER3:            E        E  HH                          HHHHH H       HHHHHHH                            HHH
SS_PSSPRED:                                                                                                     HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD    BDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
METAL:                           C  C                                                                              
ZN_FING:       KIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHA                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKKRKYEKPQELSGRKRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNAEDRMALANKPLRRFKQEPEDELPEA 900
gnomAD_SAV:    WT QNS#  L   EC*W  #FEMC # F# VLL S  V  # A   A #A L HEF SSEA E  #  #     V  GVV  S   Q   R  KEK AKV
Conservation:  2624312112211102211111111111111111111111111111521111111111111111111111111111111110111101111211130001
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHH                                HH   HHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHH            
SS_SPIDER3:    HHHHH                                     HHHH   HHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   H              
SS_PSSPRED:    HH                                                HHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRKRRLPNKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGICERPHRFSKG 1000
gnomAD_SAV:    SR AGK GR C  F     R  R ADLV E M T C  QLFR R  G Q   D SY L KM   M SK K   ML AD D K SNQSL    P#YP TRR
Conservation:  1111142311012131232412211013111102111211111232224111111110120421312433341114211203256313110010210111
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHHHH      HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                 
SS_SPIDER3:                              HHHHHHHHHHHH     HHH HHH HHHHHHHHH                                        
SS_PSSPRED:                                HHHHHHHHHH             HHH  HHH                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                        S                       S   S                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNGTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDDGAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKR 1100
BenignSAV:                     H                                                                                   
gnomAD_SAV:      S# Q PQR M S  H LSS   Q LLFM  L       Y   RR#   A EL L  #  G I D    # IL HFNDR   M  # SGS      N Q
Conservation:  0000011111100011111121012311101332112111111111111111111462131211225439535814513258527928765834543874
SS_PSIPRED:         HHHHH                             EEEE                       HHHHHHHH    HHHHHHHHHH HHHHHHH    
SS_SPIDER3:         HHH                                 EE                       HHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHH     
SS_PSSPRED:                                                                      HHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD DDDDDDDDDDDDDD                                         
MODRES_P:                       S            S                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LWTRIDLNHCKSITPLMLSGIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLDVQWVEGLKDAQMRDLLSPPTD 1200
gnomAD_SAV:      IC N   Y  V A L   V #   I VN G  S   Q    F SQ LE Q  AV      #    G   YL  QI              W    L  H
Conservation:  7831544322134534463675655822768675335547624733545665281559636243447332259285367544335435273555434342
SS_PSIPRED:       EEE        HHHHHHHHH    EEE       HHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHH        EEEE        HHHHHH      
SS_SPIDER3:       EEEEE      HHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHHH       EEE EHE     HHHHHH      
SS_PSSPRED:       EEE        HHHHHHHHH     EE       HHHHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHHH        EEEEE       HHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHIDL 1300
gnomAD_SAV:        HT  Q N Q  M  G   P      MWFM H I        RS   I    VSV S      Q   AK S    SN  NR   S  C    RY   
Conservation:  3541113445374332273858765362575532343436226454362143634235844263244136223152442245413505345323421565
SS_PSIPRED:            HHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHH         HH     HHHHHHHHH          EEE        HHHHHHHHH     EEE 
SS_SPIDER3:              HHEEEEEEEE      HHHHHHHHHH                HHHHHHHHH          EEE    HH HHHHHHHHHH    EEEE 
SS_PSSPRED:             HHH    EEEE      HHHHHHHHHH H              HHHHHHHH           EEE       HHHHHHHHHHH    EEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DD D                                                                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                                                                             

                       10        20        30      
AA:            RYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS 1336
gnomAD_SAV:       Q  ARA          MR  #    G    R  
Conservation:  536326431454065656623224140333542421
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHH          HHHHHHH  
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHH         HHHHHHH   
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                      DD    DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                      DDDD
DO_IUPRED2A: