Q8NHS4  CLHC1_HUMAN

Gene name: CLHC1   Description: Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1

Length: 586    GTS: 1.745e-06   GTS percentile: 0.557     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 354      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSVHQIRKHAVLPPIICRSDKEFLESVQRYIITETERLGCSEEGPADEYYIIYRNVFDKVIEHITAYKSILTSIKKEYDAFIETIKKDRRTTFCLHGKLK 100
gnomAD_SAV:    I A HL         L# GE G   IL  *L    G R   G   SN*CC VHQK  H ITQ   VS  F I VE   N  #*IRN GQ    F N   E
Conservation:  5000121100012211111421431231134005221513222532543425321452456322325515822451465125124532212320333334
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                        HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLAAEPTALVYYRKRTIQLEAKMRIIESNSSKIQSQIDHIKQCRAEYDTKEVKYCTFSKDPSKPIPGMTLQESMNLDALTKYMKHLEDKYAEIKQAMLIK 200
BenignSAV:                                                                                  V                      
gnomAD_SAV:    C   D S VI*C   IL   TNV   DG  WM H H VRS *G  K G# QET FP #  #   L V   *K  H GVP   T Y#K     L PVVM  
Conservation:  3222131441232343134214311432252144133131310201010231111100113112367532246244429114411631310243012112
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH               HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH H H HH                 HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH                HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                 D                                    
DO_SPOTD:                                                               DDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                                                      D                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVPAQRKADLDEEMIVLLKRRDVAENLNKKLQFCHQRLQIISQALSSWVKSDMSSPFQDFVEQIQKTKYLQGDQGIVEELMEDDPRRAKEAEIMLHYIER 300
gnomAD_SAV:      LT  NVG   DIV  *RWQ  G   DR  R  YE       PFIL    GI   V N L   #R N  LS     KQ V #E H#  KGK LR#C# S
Conservation:  4561334105414400231255051026118232314321401241061121100323130113011101041012011122235122323114212323
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHH HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH          HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDD                    
DO_SPOTD:                                                                            DD                            
DO_IUPRED2A:                                                                                   DD                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FNELISLGEYEKAACYAANSPRRILRNIGTMNTFKAVGKIRGKPLPLLLFFEALFITSHAFPCPVDAALTLEGIKCGLSEKRLDLVTNWVTQERLTFSEE 400
PathogenicSAV:                                                                                  Q                  
gnomAD_SAV:    L   MLR  *A P   V K T S  QKV      RV    T  S L FI  * R  ## G AFLA#VT  M  M  * L  WI SG SC  K  P     
Conservation:  5035411234326612443473455261244126224101131126472652553153131213213046333414462121336622464326523471
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHH         HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH       HH
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH HHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH       HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH      HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGDVICDYGEQDTYNKAKCLALAQIVYSECGLHKKAILCLCKQGQTHRVMEYIQQLKDFTTDDLLQLLMSCPQVELIQCLTKELNEKQPSLSFGLAILHL 500
BenignSAV:                              I                                                                          
gnomAD_SAV:    VV   S FA EHA K TTS    * I G F   N  V SF  #R*SYS  DH  P  G AING  LVF # AHL F  F SEQ  D *  F LV  V R 
Conservation:  3763512542121101216567832460262113624555623533114322412110421262314500242117411831110423313523132114
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            FSADMKKVGIKLLQEINKGGIDAVESLMINDSFCSIEKWQEVANICSQNGFDKLSNDITSILRSQAAVTEISEEDDAVNLMEHVFW 586
BenignSAV:       V                                                Y                                  
gnomAD_SAV:     FV IR  DV PF G S CA NSADT   SY VF#T      E RW    VV S    M V *   # IDV D  ATGT   R   
Conservation:  31112101442443231114222331354171033240511452161102301732161246214254101421232114446552
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH        HHHH HHH    
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHH      
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDD       
DO_IUPRED2A: