Q8NHX9  TPC2_HUMAN

Gene name: TPCN2   Description: Two pore calcium channel protein 2

Length: 752    GTS: 3.605e-06   GTS percentile: 0.961     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 427      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEPQAESEPLLGGARGGGGDWPAGLTTYRSIQVGPGAAARWDLCIDQAVVFIEDAIQYRSINHRVDASSMWLYRRYYSNVCQRTLSFTIFLILFLAFIE 100
BenignSAV:                                                                                     I  W                
gnomAD_SAV:         V  D        C                  A S    V  G*V FL Q G R H V  Q HV L   **Q  L I *L VG S  FV       
Conservation:  5222022222200000020000022222222220020102002324144355354543896638456216316663778125842733364348287839
STMI:                                                                                              MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                                          HHHHHH HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HH                               HHH H   HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                                           HHHH    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:   D        DD D                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPSSLTSTADVRYRAAPWEPPCGLTESVEVLCLLVFAADLSVKGYLFGWAHFQKNLWLLGYLVVLVVSLVDWTVSLSLVCHEPLRIRRLLRPFFLLQNSS 200
gnomAD_SAV:     S   I MV  # HTV R LS #  KC K       V YFFLN   VR      I    #  L VMLC M  IM   FM #  PQFLW FCTLL P    
Conservation:  1868441669472510243667745533623553361364337455564144223387336224512742762463420715146498348867757696
STMI:          MMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_SPIDER3:       HH     H           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHEHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                D     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMKKTLKCIRWSLPEMASVGLLLAIHLCLFTMFGMLLFAGGKQDDGQDRERLTYFQNLPESLTSLLVLLTTANNPDVMIPAYSKNRAYAIFFIVFTVIGS 300
gnomAD_SAV:    V N     NC L LA V#DR   TV   V  V   R  TD  R    E D  S  R P GY   F MP  KV  AN L #V    QVC V  LG  L ER
Conservation:  5656368664353433254164523553475427464722312301132752167224415444785776645475574557515824448843634495
STMI:          MMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII          MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H        HHHHHHHHHHHHH      EEEE      HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                               DDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFLMNLLTAIIYSQFRGYLMKSLQTSLFRRRLGTRAAFEVLSSMVGEGGAFPQAVGVKPQNLLQVLQKVQLDSSHKQAMMEKVRSYGSVLLSAEEFQKLF 400
BenignSAV:                                                                                R                        
gnomAD_SAV:     L  K   V      WVHM    * L  Q W   #G VG   YVMAK  D SHGA        R       G FQR  V  N G#CD  P    #     
Conservation:  5457786797696477779516352352644364446535621101101100111171211432651463520135156222312111204221264135
STMI:          MMMMMMMMMM                                                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E    H   HHE      HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NELDRSVVKEHPPRPEYQSPFLQSAQFLFGHYYFDYLGNLIALANLVSICVFLVLDADVLPAERDDFILGILNCVFIVYYLLEMLLKVFALGLRGYLSYP 500
BenignSAV:                                                                                        L                
gnomAD_SAV:    D PEG LD  QLLK QCH LL  IT I  S  CVEC   V T    L V   V    G   T C N   E   #I  LDC  KLV NF   SP*AC    
Conservation:  3544520336364082825117514802356133243953453353256543752544312135533255336127435842842474352822474431
STMI:                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HHHHHHH        HH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH  H
SS_SPIDER3:    HHH                HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH   H
SS_PSSPRED:    HHHHH              HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SNVFDGLLTVVLLVLEISTLAVYRLPHPGWRPEMVGLLSLWDMTRMLNMLIVFRFLRIIPSMKLMAVVASTVLGLVQNMRAFGGILVVVYYVFAIIGINL 600
BenignSAV:                                                                    P                                    
gnomAD_SAV:    RSM HR   AF    D PA    *  PL   L I A  PV  L CI      LC  C    L Q# MM   I     KVCV SRMP  F CL  VV  SS
Conservation:  4835884572276244422231633511121310032348853355373554365654642433342434633353344335473545356356428204
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                             DDDBDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FRGVIVALPGNSSLAPANGSAPCGSFEQLEYWANNFDDFAAALVTLWNLMVVNNWQVFLDAYRRYSGPWSKIYFVLWWLVSSVIWVNLFLALILENFLHK 700
BenignSAV:                                                                                     L                   
gnomAD_SAV:    # DIN VFR S    STS LV S  LG PQ  T   N  # G  A   SLM   C L  G  WHC# SR    L  L QLLPIF  SM     PADL   
Conservation:  5343412122212211130411363423534836355444354448344655566443342315333344235532575363534335345444631346
STMI:          M                                  IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:        EE                   HHHH HHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEE                   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHH HHHHH HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:       EEE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                N      N                                                                                  

                       10        20        30        40        50  
AA:            WDPRSHLQPLAGTPEATYQMTVELLFRDILEEPGEDELTERLSQHPHLWLCR 752
BenignSAV:                                      E                  
gnomAD_SAV:     #LLN   H   #AGV     MG   S   Q  R   FR      Q     S
Conservation:  5632110122131121012132243451222471334411161133241422
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:       HH        HHHHHHHHHHHH H        HHHHHHHH         
SS_PSSPRED:      HHH        HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:      D  DDDDDDDD  DD    DDDDDBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBB
DO_SPOTD:         DDDDDD DD                   D        DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: