Q8TB22  SPT20_HUMAN

Gene name: SPATA20   Description: Spermatogenesis-associated protein 20

Length: 786    GTS: 3.278e-06   GTS percentile: 0.935     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 488      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLGARAWLGRVLLLPRAGAGLAASRRGSSSRDKDRSATVSSSVPMPAGGKGSHPSSTPQRVPNRLIHEKSPYLLQHAYNPVDWYPWGQEAFDKARKENKP 100
BenignSAV:                                                                                            E            
gnomAD_SAV:       VPD S       CT     E   DI# Q RGQNTM # LGRV P         I#   LSHP RK L CF    CDLM   # RE   N      E#
Conservation:  2111211011021111121222222222222110121322211266454111223211221385821545668567644884866975698466426574
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                              
SS_PSIPRED:        HH   HH           HHH                                               HH             HHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:              H                                                     H H    HHHH            HHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:        HHHHH                                                             HHHH             HHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFLSVGYSTCHWCHMMEEESFQNEEIGRLLSEDFVSVKVDREERPDVDKVYMTFVQATSSGGGWPMNVWLTPNLQPFVGGTYFPPEDGLTRVGFRTVLLR 200
gnomAD_SAV:      #   SC  #   V  K F RD  T H  #    G  IHG VP     # VM M V  GSR G ISM   # F    RV C     S  QDD # A  S
Conservation:  6788696669999959738695525562576448767779999699795579476754545998986887694759649999996353236487466925
SS_PSIPRED:    EEEEE        HH  HH    HHHHHHHHHH EEEEE       HHHHHHHHHHHHH      EEEEE      EEEEE            HHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE      HHHH H      HHHHHHHH   EE E        HHHHHHHHHHHHH      EEEEE     EEEEEEEE          HHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEE            HHH   HHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHH         EEE       EEE            HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IREQWKQNKNTLLENSQRVTTALLARSEISVGDRQLPPSAATVNNRCFQQLDEGYDEEYGGFAEAPKFPTPVILSFLFSYWLSHRLTQDGSRAQQMALHT 300
gnomAD_SAV:    LQ #  R  YI PG   CI   V  P   GM HH RL   S M SCGL   #KD NVG SA T D    ML   N  SFS    Q  #H  QTH      
Conservation:  5234932552283346255434821241413133215522225213853882235766699832398993896429643593133143382476475586
SS_PSIPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHH  HHH            HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:              D                      DD                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKMMANGGIRDHVGQGFHRYSTDRQWHVPHFEKMLYDQAQLAVAYSQAFQLSGDEFYSDVAKGILQYVARSLSHRSGGFYSAEDADSPPERGQRPKEGAY 400
gnomAD_SAV:     RT    DNW  #    #C    C *RISQ  RV#C  TR T   #             MT R    M W   LL R    T  G LSAVW RW E* TS
Conservation:  7766849985997468777987933946978988979879933353196757852465334246847435363423978488686882622303448876
SS_PSIPRED:    HHHHH              EE             HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                            E
SS_SPIDER3:    HHHHHH    H         E             H  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE                E
SS_PSSPRED:    HHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                            E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDD DD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVWTVKEVQQLLPEPVLGATEPLTSGQLLMKHYGLTEAGNISPSQDPKGELQGQNVLTVRYSLELTAARFGLDVEAVRTLLNSGLEKLFQARKHRPKPHL 500
BenignSAV:                                                                                       T                 
gnomAD_SAV:    CE M R  *H# LGS     KL I D   TR  S # TV S   K  N GQR   G N#W L     S#   YMQTLWSSR#TR  N    L  WHQL  
Conservation:  5483228532484425254232251756534877456198633169532773657794453536575545652221521371144136213521752844
SS_PSIPRED:    EE  HHHHHHH             HHHHHHHHH                     EEEEE   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    E   HHHHHH             HHHHHHHHH                  E   EEEEE   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    EE  HHHHHHH             HHHHHHHHH                      EEE    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                   D                      DDDDDDDDDDD D                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSKMLAAWNGLMVSGYAVTGAVLGQDRLINYATNGAKFLKRHMFDVASGRLMRTCYTGPGGTVEHSNPPCWGFLEDYAFVVRGLLDLYEASQESAWLEWA 600
gnomAD_SAV:         #   S RML C  I    S NS V# #IDD  # QWL CNE   H  Q    SRVV   RGI     #      M G   N CG  LG VS   S
Conservation:  7365444558755676834944731324412922481974268452235354746726131364522343198969965574685886875322167377
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE               EE HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHEE     EEEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE                EEHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                             D                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRLQDTQDKLFWDSQGGGYFCSEAELGAGLPLRLKDDQDGAEPSANSVSAHNLLRLHGFTGHKDWMDKCVCLLTAFSERMRRVPVALPEMVRALSAQQQT 700
BenignSAV:             R                                                                                           
gnomAD_SAV:     # HY  GR   NF  D#  RN V PET P  C   N    D#GTS MLD   PW    M  R * HNWM   NT AQH HH L    V# CT L   RN
Conservation:  5386117715779238268835441532255535646786589558745627958552344215513542266577546613585487675443332524
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH                                 HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH E      EE   H                 E  HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                       D   DDD D                                                       
MODRES_P:                                                      S                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            LKQIVICGDRQAKDTKALVQCVHSVYIPNKVLILADGDPSSFLSRQLPFLSTLRRLEDQATAYVCENQACSVPITDPCELRKLLHP 786
gnomAD_SAV:       VMT   C  N   V G YI F  VLD    V#    LT P C     R  *W   *T# C RKK         TRD *  QYL
Conservation:  36566669222236712852543335273646422442133432224535233122232444434233454474423247424812
SS_PSIPRED:      EEEEE     HHHHHHHHHHHHH     EEEEE    HHHHHHH HHHH        EEEEEEE          HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:      EEEEE     HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE    HHHHHH    H          EEEEEE  EE      HHHHHHH   
SS_PSSPRED:      EEEEE     HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHH HHHH        EEEEEE           HHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                            
DO_IUPRED2A: