Q8TCG5  CPT1C_HUMAN

Gene name: CPT1C   Description: Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform

Length: 803    GTS: 2.205e-06   GTS percentile: 0.724     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 422      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEAHQAVGFRPSLTSDGAEVELSAPVLQEIYLSGLRSWKRHLSRFWNDFLTGVFPASPLSWLFLFSAIQLAWFLQLDPSLGLMEKIKELLPDWGGQHHG 100
PathogenicSAV:                                     C                                                               
BenignSAV:                                                                                                     H   
gnomAD_SAV:       EN TMAL       #G  K     QK LFF  ## G #DV   R G  AS L   H      VNV  FT VF Q     VTK  Q     R  R   
Conservation:  5444334333122223241212230133233333331342323131422332342744424323422332230301253426340142103211100101
STMI:                                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         
SS_PSIPRED:           EEE  EE    EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH        HH
SS_SPIDER3:        H       EEE   EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH         H
SS_PSSPRED:     HHHHHHH           EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHH        HH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRGVLAAALFASCLWGALIFTLHVALRLLLSYHGWLLEPHGAMSSPTKTWLALVRIFSGRHPMLFSYQRSLPRQPVPSVQDTVRKYLESVRPILSDEDFD 200
gnomAD_SAV:    FQ A V #     F*RV      M   P PF ##     RR        *M  L#V   C LI #R H#F    ##RP R  #H *  L WAV  N*#LN
Conservation:  0202342234442462233222612861674464842115412400452620233333312624433423352344713124304552542353111240
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHH     HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H         HHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHH   H  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH         HHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                               D                   DDDDDDDDDDDD                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WTAVLAQEFLRLQASLLQWYLRLKSWWASNYVSDWWEEFVYLRSRNPLMVNSNYYMMDFLYVTPTPLQAARAGNAVHALLLYRHRLNRQEIPPTLLMGMR 300
BenignSAV:                                             H                                                          H
gnomAD_SAV:    RIV   R      V V R  R   FR TAT     *    HPS *HL # K       VP    MT    CT   I      HYH  L*  LL S #* C
Conservation:  1210540262002522663381565443287555664344453582653457556237442205411534646423452435531614333161120003
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH     EE EE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH      EEE    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        E    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLCSAQYEKIFNTTRIPGVQKDYIRHLHDSQHVAVFHRGRFFRMGTHSRNSLLSPRALEQQFQRILDDPSPACPHEEHLAALTAAPRGTWAQVRTSLKTQ 400
gnomAD_SAV:     F C P K M   RQ   IP Y  H R N # #TI  W *  CV  P Q   I   T  H LE  MG # L#  DK    VV # A  M   MW   N R
Conservation:  4243141223544353410113040410222343323153342412401223606334506431662313121225113144454171294229013411
SS_PSIPRED:    EE HHHHHHHH            EEE     EEEEEE  EEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH             EEE     HHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH            EEE      EEEEEE  EEEEEEEEE  EE  HHHHHHHHHHHH            EEEEE     HHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHH           EEE      EEEEEE  EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      DD      DDDD                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAEALEAVEGAAFFVSLDAEPAGLTREDPAASLDAYAHALLAGRGHDRWFDKSFTLIVFSNGKLGLSVEHSWADCPISGHMWEFTLATECFQLGYSTDGH 500
gnomAD_SAV:          V   T     PE  LT I S NL VL                R        I   R    NLG     R     L   S  I    MD  I S 
Conservation:  6215832643554333541211220112110353044535535152456443233231424511624154445537422343413432603153711266
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHEEEEEE            HHHHHHHHHHHHH            EEEEEE   EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHEEEEEEE           HHHHHHHHHHHH      EE     EEEEE     EEEE E      HHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHEEEEE           HHHHHHHHHHHHH            EEEEE     EEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                              D                                                                        
ACT_SITE:                                                                           H                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CKGHPDPTLPQPQRLQWDLPDQIHSSISLALRGAKILSENVDCHVVPFSLFGKSFIRRCHLSSDSFIQIALQLAHFRDRGQFCLTYESAMTRLFLEGRTE 600
PathogenicSAV:                                                    V                                                
gnomAD_SAV:     NRYLNSI #R RL   HR    R  VYP   E EN F  GY R I  F   R   #H     G   K T    Y WNGC     D L#VS#     QM 
Conservation:  6171121052070550724313311140044016006614453223160087621352132535465744687735433206587555456545456365
SS_PSIPRED:                EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH              HHH     
SS_SPIDER3:                EE EE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE     HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH            EEH    EE
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH    EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDDDDDD   DDDD                                                                                     
BINDING:                                                                                            Y S          T 
REGION:                                                           GKSFIRRCHLSSD                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVRSCTREACNFVRAMEDKEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVDRHLFALYIVSRFLHLQSPFLTQVHSEQWQLSTSQIPVQQMHLFDVHNYP 700
BenignSAV:                                           T                                                     M       
gnomAD_SAV:    MAQ  S  T   I T  NEKNM L   T  CM      G P   # R    HR LV   M QI Q *L   A   W KR     R A    YM    DCS
Conservation:  4634441452145133111001011320553173238714451533718477655474435444221556724524335144454341331153321136
SS_PSIPRED:    EE    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                                     
SS_SPIDER3:    EE    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH               EEE          HE       
SS_PSSPRED:    EE   HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DYVSSGGGFGPADDHGYGVSYIFMGDGMITFHISSKKSSTKTDSHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQHFKRRFRGSGKENSRHRCGFLSRQTGASKASMTS 800
BenignSAV:                          N                                                                           V  
gnomAD_SAV:    VC  #   LV G  YR  I  NLV E V       R   A M   S      E#  EM    HV H   H#  RL #D          C        VI 
Conservation:  1243277855742438344341224311324554331521142301330130143032014300111111111111111111111111111010101111
SS_PSIPRED:          EEEE      EEEEEEE     EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH                            
SS_SPIDER3:         EEE   E     EEEEEE    EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH                             
SS_PSSPRED:           EEE       EEEEE      EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH                             
DO_DISOPRED3:                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                          D DDDD                          DDDD   DDDDDDDDD          DD 

                  
AA:            TDF 803
gnomAD_SAV:    I  
Conservation:  111
SS_PSIPRED:       
SS_SPIDER3:       
SS_PSSPRED:       
DO_DISOPRED3:  DDD
DO_SPOTD:      DDD
DO_IUPRED2A: