Q8TDD1  DDX54_HUMAN

Gene name: DDX54   Description: ATP-dependent RNA helicase DDX54

Length: 881    GTS: 1.897e-06   GTS percentile: 0.617     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 554      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAADKGPAAGPRSRAAMAQWRKKKGLRKRRGAASQARGSDSEDGEFEIQAEDDARARKLGPGRPLPTFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQS 100
PathogenicSAV:                    R                                                                                
gnomAD_SAV:      TYRS GGV Q L  # LR      WE Q P FES CT  DN          V T R RL  H  #L  L   L   R  W I#C * ##EE C S PF
Conservation:  1110102111101111111111111101100000000000100000101001000101111111111111212132151223244425243152112623
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH                      HHHHHHHHH        HHH
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHH         H                 HHHHHHHH                     H HHHHHHH          HHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHH                        HHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD   
MOTIF:                                                                                                        GGFQS
MODRES_P:                                       S    S S                                 S                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTIPVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFERLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLKFTKELGKFTGLKTALI 200
gnomAD_SAV:    V  TCS  ND      #   S      L      EM    Q          VSILKW   P # IV CT  HLLIQ    RI R S   #   V Q  P 
Conservation:  4574244344422245226576524467335254533525357574555635845457222031122436553988875384324332554432432244
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH        EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHH       HHHH   HHHH   EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                              ARTGSGKT                                                     
MOTIF:         MGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQR                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLVHVAVEMSLKLQSVEYVVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIR 300
PathogenicSAV:                S                                                                     M              
gnomAD_SAV:     V # LKY*  VV KS N    M R#FGL SM V     N   M  V GHWR     T R   V TH  RS #ML   TM     EG  W D M SM  Q
Conservation:  3863334372237314665645777885531334442522464465899866654652344344322431056454575634124224421352373354
SS_PSIPRED:    E    HHHHHHHHHH   EEEE HHHHHHHHHH       EEEEEEE HHHHHH   HHHHHHHHHH       EEEE    HHHHHHHH      EEEE
SS_SPIDER3:    E    HHHHHHHHH    EEEE   HHHHHHHH    HHHEEEEEEEE     H   HHHHHHHHH       EEEEEE   HHHHHHHH      EEEE
SS_PSSPRED:    E    HHHHHHHHHH   EEEE  HHHHHHHHH EE   EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   HHHHHHHHHH    EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                       DEAD                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDVDTKLNEQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAAR 400
gnomAD_SAV:     YM    KQ V   S  MW NI  SM   M  SMM#A  LNAL   A  RT#C A  QM  QE  T M     LRTC  S S  M      V  I   TQ
Conservation:  6433434331424242132121533341254112011133434832652233352336121341432576465735833563292333324866786888
SS_PSIPRED:    E           EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH    HH EEEEE  HHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHHHHHHHHHHH    EEEEEE HHH 
SS_SPIDER3:    EE       HE EEEEEEEHH HHHHHHHHHHHH      EEEEE     HHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHH      EEEEE  HH 
SS_PSSPRED:    EE       HHHEEEEEE    HHHHHHHHHHH       EEEEE   HHHHHHHHHHHHH   EEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLDIPLLDNVINYSFPAKGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVDGMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLE 500
gnomAD_SAV:     M VL  GSI     LT  RF   CM P S   *G  TC F V V        Y    C V FTQ   KL    #L R   WM  N L KD RD      
Conservation:  9798237438595449222536788665447584282645543226232424611111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:             EEE        HHHH           EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             EEE         EEEEEE E E     EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH    EE                E    HHHHHHHH HHHHHHH
SS_PSSPRED:             EEEE        EEE            EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH                     EEE         HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                         DDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                             DD D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEMDLVGLGLHPLFSSRFEEEELQRLRLVDSIKNYRSRATIFEINASSRDLCSQVMRAKRQKDRKA 600
BenignSAV:                                                                          H                              
gnomAD_SAV:     P   #V  HIT  #*#RC C CL#  L #VE  T I P   DP     L#L  #   W      L   L QT M K YS NQ   G  TC# W   H  
Conservation:  1111111111111522422242441111111111111111111111111111111111111114353254233134733233311111111233123121
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH         HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH     EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH         HHH     HHHHHHHHHHHHHH       EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH     EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDD                                                  DD D DDDD   DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     D            DDDDDDD  DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IARFQQGQQGRQEQQEGPVGPAPSRPALQEKQPEKEEEEEAGESVEDIFSEVVGRKRQRSGPNRGAKRRREEARQRDQEFYIPYRPKDFDSERGLSISGE 700
PathogenicSAV:           Q                                                                                         
BenignSAV:                                                                                                 Q       
gnomAD_SAV:      C    R#WQ   P D  S  SGC          D   AVE #  G    FL W Q QPR TG DR W  KVW Q#KKL T CQ E L N QA RVTR 
Conservation:  4113111111111111111111111111111111111111111111224111111111111111111111110012111111111132011011111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH           HHH     HHHHHHHHH HHHHHHH               HHHHHHHHHH HH               EE    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH             HHH   HHHHHHH    HHHHHHHH             HHHHHHHHH   H             E  E E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHH   HHHHHHHH                HHHHHHHH                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      D  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                 S                                                   S S  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGAFEQQAAGAVLDLMGDEAQNLTRGRQQLKWDRKKKRFVGQSGQEDKKKIKTESGRYISSSYKRDLYQKWKQKQKIDDRDSDEEGASDRRGPERRGGKR 800
BenignSAV:                A                                                                                        
gnomAD_SAV:    RE#      STL    R    KPP  Q *        Q A    RKG QM   G #  FGN C  N H   N      YH # KK T  Q#   P V  Q
Conservation:  1112313224212331341221412120125233343363121223323411143422113113231233313321111111111111113211123112
SS_PSIPRED:      HHHHHHHH EE      HHHHHH   HHH  HHHH            EEE         HHH HHHHHHHHHH                         
SS_SPIDER3:      HHHHHH           HHHH H        H HH  EE         EE     EE H H   HHHHHHHHH                         
SS_PSSPRED:       HHHHHH   EE     HHHHHHHHHHH   HHH                          HHHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                                DBBBBDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                       S     S            

                       10        20        30        40        50        60        70        80 
AA:            DRGQGASRPHAPGTPAGRVRPELKTKQQILKQRRRAQKLHFLQRGGLKQLSARNRRRVQELQQGAFGRGARSKKGKMRKRM 881
BenignSAV:                         L                                                            
gnomAD_SAV:    ECS D TQ  T  S#V ##HL F   H     QHQS   YL  H V   IY H HCHIL  * VS SQ TCF  DE#Q KL
Conservation:  111111201111111111112113120343415321231311214323121122311311122211111111144422221
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
SS_SPIDER3:                        HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     H   HHHHHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD