Q8TDI8  TMC1_HUMAN

Gene name: TMC1   Description: Transmembrane channel-like protein 1

Length: 760    GTS: 2.253e-06   GTS percentile: 0.738     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 11      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 353      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSPKKVQIKVEEKEDETEESSSEEEEEVEDKLPRRESLRPKRKRTRDVINEDDPEPEPEDEETRKAREKERRRRLKRGAEEEEIDEEELERLKAELDEKR 100
BenignSAV:                                                                                     K                   
gnomAD_SAV:      TRNIRV  QK Q K KVT #G G KA     *         Q IEILSG  S      KK  ETTG  #    R  VKK    D       V   G  
Conservation:  2222200100200000011010011000111111102222112100202211100011110012021121100100011111032324220333244445
SS_PSIPRED:                          HHHHHHHHH   HH                         HHHHH HHHHHH      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                          HHHHHHHHH                              H HHHHHHHHHHHH     H    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                            HHHHHHH                                HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDD D         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QIIATVKCKPWKMEKKIEVLKEAKKFVSENEGALGKGKGKRWFAFKMMMAKKWAKFLRDFENFKAACVPWENKIKAIESQFGSSVASYFLFLRWMYGVNM 200
PathogenicSAV:                                                                             T                       
BenignSAV:                                             W                                                           
gnomAD_SAV:       P I    # I   T*  R  NQI GV     R     W     V  T  *# L HV     P  I *    N V N LS  A#   H   CICR ST
Conservation:  5252245244726134400544451753248835754564345445444166428636673756346689927884565475475555749698678484
STMI:                                                                                                             M
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:    DDDDDD                 DDDDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDD D                DD  DDDDDDDDDDDD                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLFILTFSLIMLPEYLWGLPYGSLPRKTVPRAEEASAANFGVLYDFNGLAQYSVLFYGYYDNKRTIGWMNFRLPLSYFLVGIMCIGYSFLVVLKAMTKNI 300
PathogenicSAV:                         L                                                                           
gnomAD_SAV:     P    IR V  SQ* C ST#   LS  I   K SL  S D   NLS      I  CSH A  Q V     T L YC      F E G      G S# V
Conservation:  5453545465535636582559645996876255136365568253364356834878764324466263577975875676424589644856366282
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH                        EEE    EEEEEEEEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  HHHHHHHH                        EEEE    EEEEEEEEEEEE    E      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHH  HHH   EEE   EEEEEEEEEEEE        EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                             DDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDDGGGDDNTFNFSWKVFTSWDYLIGNPETADNKFNSITMNFKEAITEEKAAQVEENVHLIRFLRFLANFFVFLTLGGSGYLIFWAVKRSQEFAQQDPDT 400
BenignSAV:                K                           T                S                                           
gnomAD_SAV:    SEYRS  E A S      A  YC  SI D TG    Y  V    T A   T     SI M K   SR   LM    #R #N      R* E  S  N GS
Conservation:  2224245422727575476797697975867766534555367856368463134675683668643693443349469888975585576163115022
STMI:                                                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:                   EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H
SS_SPIDER3:                EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH    H
SS_PSSPRED:               EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGWWEKNEMNMVMSLLGMFCPTLFDLFAELEDYHPLIALKWLLGRIFALLLGNLYVFILALMDEINNKIEEEKLVKANITLWEANMIKAYNASFSENSTG 500
PathogenicSAV:                  K Y                                                                                
BenignSAV:               I                                                                          T              
gnomAD_SAV:      C D   T IL   V VS   W#N LTK  # P  LT  *   H    FV   CILLF  TH    RV * N        R TSTS V YVL      R
Conservation:  3684647654265469534584495344158348664564658365689447866586696365731641181055281614222311348160224221
STMI:                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPFFVHPADVPRGPCWETMVGQEFVRLTVSDVLTTYVTILIGDFLRACFVRFCNYCWCWDLEYGYPSYTEFDISGNVLALIFNQGMIWMGSFFAPSLPGI 600
PathogenicSAV:           L   R                                                        #   K                        
gnomAD_SAV:    ##         Q  F*  V VE LL   DP I    II  TEE      L  FY  C *V K     CAK        T S  K   *T#    L     
Conservation:  3220327664489699972883875765566435442475346624643664384889999745366635574545665656565556585866869465
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH              HHHHHHHHHH  HHHHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H H        EEEE HHHHHHHH HHHHHHHHHHH HHHHH
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH              HHHHHEE    HHHHHHH  HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NILRLHTSMYFQCWAVMCCNVPEARVFKASRSNNFYLGMLLLILFLSTMPVLYMIVSLPPSFDCGPFSGKNRMFEVIGETLEHDFPSWMAKILRQLSNPG 700
PathogenicSAV:                                               P      V                                              
gnomAD_SAV:       *P    C  W  GT  S AK T   V   S# * D        PSIS FC  M H S      YR R G  GDT  A K N S RTV M  H   T 
Conservation:  8548833688484886646668646677585554964565455865644643635644488669895655045446615642255614333432344897
STMI:                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                            M
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH H HHHEEEE      EEE      HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE             HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60
AA:            LVIAVILVMVLAIYYLNATAKGQKAANLDLKKKMKMQALENKMRNKKMAAARAAAAAGRQ 760
BenignSAV:                                                               C 
gnomAD_SAV:    QI G  S I  S *F S     #  VK   RN K        I*KR TV  *   V DH 
Conservation:  664434867264467733453332135256567431313543321201211112222002
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: