Q8TEU7  RPGF6_HUMAN

Gene name: RAPGEF6   Description: Rap guanine nucleotide exchange factor 6

Length: 1601    GTS: 1.54e-06   GTS percentile: 0.466     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 725      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFG 100
gnomAD_SAV:       # GA   #      S   SQ  S V  C   V    D       V   G #   #G   #     M  SY    V     M   #   L    E   
Conservation:  2222222222011000122222233323212232231322234324312212451213232336522213335332323211123212132232232214
SS_PSIPRED:          HHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHHHEEEEEE   EEEEE       EEEEEE EEEEE  EEE          
SS_SPIDER3:          HHHHHHH        HHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHH E EEEEEE  EEEE       EEEEEE  EEEEE  EEE          
SS_PSSPRED:          HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHHEEEEEE EEEEE  EE           
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:   DD DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
MODRES_P:        S                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSG 200
gnomAD_SAV:        Y            L  GE    G  #IK    K QK  WNLSS   C   A  M   #C C #  F   Y S   #  M  L  T   Y F#  F 
Conservation:  2332214225321112366522324321325313164866562365216544543522322110068487365565732646424633845465447576
SS_PSIPRED:         EEEEE    EEEEE       HHHH            EE               HHHHH   HH             EEE         EE    
SS_SPIDER3:        EEEEEE   EEEEEEE      HHH              EE       EE                            EEE         E     
SS_PSSPRED:         EEEEE    EEEEE     HHHHH     HHH                                                               
DO_DISOPRED3:                            DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD      DDDDDD    DDDDDDDD  DDDD
DO_IUPRED2A:                              DDDD                           D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV 300
gnomAD_SAV:       F   C  M N  E A   H    LI   N K   G THQR# S A N  Q  V   S N   G  GR      H   C  T V   #KF T     L
Conservation:  6777786766775726648856867345652277545664354525358848667888742474858596967767767774666648863992663868
SS_PSIPRED:       HHHHHHHEE                    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHHEE
SS_SPIDER3:         HHHHEHH                     HHHHHH HH      HHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                      HHHHHHHH      HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD D DD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  D                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD                              
NP_BIND:                                                                                      AFANMTMSVRRELCSVMIFEV

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVH 400
gnomAD_SAV:    I   E#V I   R      A         RSN RA KVSL      S A    HV   AK            E  H      A    Y       V   R
Conservation:  6745556652334674385876694786152454183768659895266546745192556846989675656569659996995977797979799995
SS_PSIPRED:    HHH  EEEEE       EEEEEEEEEEEE     EEEEEE                EEEEE     EEEE  HHHHHHHHHHHHHHEEEEE   EEEEEE
SS_SPIDER3:    HHHH  EEE   E   EEEEEEEEEEEEE     EEEEEE                EEEEE    EEEE   HHHHHHHHHHHH   EEEEE   EEEEE
SS_PSSPRED:    HHH   EEE        EEEEEEEEEEEE     EEEE                   EEEE     EEE   HHHHHHHHHHHHH          EEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                     DD            D  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                D      
NP_BIND:       VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMV 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLE 500
gnomAD_SAV:     RW  EQN A   R LV     H L   #*KNAVM       LV    A   #    WM  S G RM      M # I    H   S       V QLP 
Conservation:  9997999799599979667835674377597676777656666965578851346249057647711334776765769899999969996532862998
SS_PSIPRED:    EEEE        EEEEE   HHHHHHHHHHH       HHH EEEEEE     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HH     HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE        E   E    HHHHHHHHHH         EEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EE            EE    HHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:      D   DDD                                                                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN 600
BenignSAV:                                                                          A                       P      
gnomAD_SAV:    K   K Q S   S  Q  S       N   I      C# R #  F   G   L     EI  C  T  A   C  RV       L #N     I    #
Conservation:  4873187146919798998697698962833342622973350816169374554596418603659263888588645979996885622189176644
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEE       EEEEEE     HHHHH      EEEEE  EE  HHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE     E EEEEEE    HHHH    E  EEEEE  EEHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EE        EEEEEEE               EEEEE       HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                         D DD  DD                                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      DDD DDDD  D                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQ 700
gnomAD_SAV:         FIL  D S     HL A  D C  #R HN  G R  C#   R  V SK AL   #      S  A    RM   V T *LGV    V  YR  R 
Conservation:  6448445689977656573142035534358367835563664855444353543227522792856752567877567746843556676222633434
SS_PSIPRED:       EEEEEE  HHHHHHHHH HHHH                                               HHHHHHHHHH                  
SS_SPIDER3:        EEEEEE HHHHHHHHH HHHHH                                              HHHHHHHHH                   
SS_PSSPRED:        EEEEEE HHHHHHHHHHHHH                                                    HHHHHH                  
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSV 800
gnomAD_SAV:            K  SK    V  FS AP*   SNIVPR  CV G  S LA  G I     L L   CVV  RG   EGA     RK S  S Y AH   K   
Conservation:  4886846865434442234545558868688968432334553333224779777675776667565467577676616432764512357477999977
SS_PSIPRED:                                 HHHH                  EEEEEE    EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEE
SS_SPIDER3:                                 HHHH                  EEEEEE   EEEEEEEE    HHHHHHHHHHH         EEEEEEEE
SS_PSSPRED:                                                      EEEEEEE    EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD                                                                   
DO_IUPRED2A:      DD                     DDDDD    DD DDD  D                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL 900
gnomAD_SAV:     # S   # K T       V T  H      H K A*    A V  DV E       R   T M     K    F H # LI  LN VL     P I D 
Conservation:  7399969967997975997779996668898785798898864698784776462585985493648884867356534668696246674331121139
SS_PSIPRED:         EEE    HHHHHHHHHHHHH  EEEE             HHH       EE    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH         HH
SS_SPIDER3:        EEE E   HHHHHHHHHH      EE            HHHHHH       H    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         HHH
SS_PSSPRED:         E      HHHHHHHHHHHH   EEE                              HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH        HHH
DO_DISOPRED3:        DDDDD  D  DDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNIL 1000
gnomAD_SAV:     T   T              K H  R*     Y  N  H  L RN LSAV  VR  FS               T  K    V       F  T     T 
Conservation:  7198436949999864964192533864636956694664967767669794797976765659774799777599697616976457999775799447
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH    HHHHH HH HH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                    D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKK 1100
gnomAD_SAV:      H # L V   #  AN  V  V K      N   S        T  HEI *  C  T R    QH  PN   A   I  I E T R  THH C    RE
Conservation:  6345476979995755777479676995627799699777996769776757676464995577637887896376449635333487748989797898
SS_PSIPRED:    HH            EE     HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHH         HHH    HHH
SS_SPIDER3:    H          E   EHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH        HHHHH      HHHHH      HHH
SS_PSSPRED:    HH             EEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH              HHHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:                                                               D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                 DDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKD 1200
gnomAD_SAV:           T    H     YLK       KT   CG    A PE  I  SPG       A V   V  #E# WRE#  LNH  R   IH Y V T R  E 
Conservation:  9984569697979863141242596237139445954234328313457128226398311822101131225321624657445333453136632276
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                                                                  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH                                                                   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD  D                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  D                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAV 1300
gnomAD_SAV:    A ##AG S  G A     N    A GSV  VP  R  RL    V A TV AFTS#   HS       D C W NTM SR    LATT *N QSF# D   
Conservation:  1224213848122123501142127833522462456522774245364111121232524544446434553445644827422212133310111000
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD             D    DDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PESTGALEKTEHASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPI 1400
BenignSAV:                                                         V                                               
gnomAD_SAV:    R  S  F     T     YC R SR AVWN C  E S I L L   DMF  YV V  # GD#  C L   GFR    C RD  G  SF   GR R     
Conservation:  2222221310100101031141315211142202110132341314422253212324557558765646345344623311524413213322200221
SS_PSIPRED:         HHH                                             EEHH                            HH             
SS_SPIDER3:                                     E                  EEEEE        E                                  
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D DD DDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDD                                       DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDR 1500
BenignSAV:                                                        R                                                
gnomAD_SAV:     AA AA   SCFYC T   I   S   R  NI  F N  AGMC  KC    *    N  P         V #ES  E    N   #S   RI  R   N 
Conservation:  2321121111211211010010102110141312323322400524465454521210212011212111011313133433325433222222214434
SS_PSIPRED:                                                      EEE                                EEEEEEE        
SS_SPIDER3:                                                     EEEE                          EE     EEEEEE        
SS_PSSPRED:                                                                                          EEEEE         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                           DD  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKLGDVTDADSEADENEQVSA 1600
BenignSAV:                                                               E                                         
gnomAD_SAV:        L ISS    MF V  EK  P#LP  #  N V RG N #R  HPG  S#   CSF#V I L M   T  RDM*  R IV Y IN#  KVY   #  V
Conservation:  4426867656725433232122212024774532433332211111222210110101110010100111100010010201100111000122110100
SS_PSIPRED:                   HHH              HHHHHHHHH                                                 HH        
SS_SPIDER3:              E    HHH             HHHHHHHHHH                                                     H     
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHH                                                          
DO_DISOPRED3:                            DDDD  DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D      D   DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                
AA:            V 1601
gnomAD_SAV:    L
Conservation:  1
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:  D
DO_SPOTD:      D
DO_IUPRED2A:   D