Q8WTR4  GDPD5_HUMAN

Gene name: GDPD5   Description: Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5

Length: 605    GTS: 1.61e-06   GTS percentile: 0.496     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 299      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVRHQPLQYYEPQLCLSCLTGIYGCRWKRYQRSHDDTTPWERLWFLLLTFTFGLTLTWLYFWWEVHNDYDEFNWYLYNRMGYWSDWPVPILVTTAAAFAY 100
gnomAD_SAV:     # R     CK H   F VM##   H  CSE   N  IL  H      I   S MF    L * IY  # *      IH     N* IL   IR    T 
Conservation:  0000000000000000011011010110101000002011221321242122222112131211202311133211400130812353334222322337
STMI:                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                   HHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                  EEEEE  EEEE E           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH   E   HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHH      EE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   EE   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBB B                              DD D                                                        DDDD
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                    C  C      C                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAGLLVLALCHIAVGQQMNLHWLHKIGLVVILASTVVAMSAVAQLWEDEWEVLLISLQGTAPFLHVGAVAAVTMLSWIVAGQFARAERTSSQVTILCTFF 200
gnomAD_SAV:    VSVF F   Y           C   VR MI M  ML SVLVMVHP   K* G  T#Q   V           PV    M  RLPCT Q   R  V  N  
Conservation:  2224435433522121341441254334232322122221241014112503303243223933532251234334434301211110111312322242
STMI:          MMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVVFALYLAPLTISSPCIMEKKDLGPKPALIGHRGAPMLAPEHTLMSFRKALEQKLYGLQADITISLDGVPFLMHDTTLRRTTNVEEEFPELARRPASML 300
gnomAD_SAV:     M         NVF   V G    S     #  #R   VPT  M V  Q V K  P R  D F VN  SMT   P    WH  HMK # L  VHK T L 
Conservation:  2422244328312043652201162148042555857324785524751333103304553761350713676759017188876012242110002204
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                                                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHH         EEE          HHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE     EEEEE                     HHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HH          EEE            HHHHHHHHHH    EEEEEEEEE    EEEEE                H    HHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH                 EE           HHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEE    EEEE                          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDDDD            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NWTTLQRLNAGQWFLKTDPFWTASSLSPSDHREAQNQSICSLAELLELAKGNATLLLNLRDPPREHPYRSSFINVTLEAVLHSGFPQHQVMWLPSRQRPL 400
gnomAD_SAV:      A    FDT          R#       N K T K    I       VRSST M    H LLQ    L    SMSP  M Q S  *       T    V
Conservation:  1511621867918732038601311520151014126262370339134103115453510230154120133115514621514131373841201600
SS_PSIPRED:     HHHHHH                    HHHHHHH       HHHHHHHH    EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHH     HHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHH                     HHHHHHH       HHHHHHHH    EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHH     EHE    HHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHH                  HHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEEEE          HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            DDD   D D                                                                  
CARBOHYD:      N                                  N               N                     N                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRKVAPGFQQTSGSKEAVASLRRGHIQRLNLRYTQVSRQELRDYASWNLSVNLYTVNAPWLFSLLWCAGVPSVTSDNSHALSQVPSPLWIMPPDEYCLMW 500
BenignSAV:                                                                                    T                    
gnomAD_SAV:     Q G  S     R     GT W S T## # H  #  # V   CV  S  M   #D SL I     YV FQ I      T   M CLF  LSL # YFI 
Conservation:  7201242425311010211110111200434262131002410311054244433652475653367235155564321162131171324220040124
STMI:                                                                                                          MMMM
SS_PSIPRED:    HHHH          HHHHHHHHH    EEE  HHH  HHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHHHHHH   EEEE  HHHHH     EE   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      EE    HHHHHHHHH    EEEE HHH  HHHHHHHHH   EEEEE    HHHHHHHHH    EEEE   HHHH     EEE   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH           HHHHHHHHHH   EE        HHHHHHHHHH  EEEEEEE  HHHHHHHHHH    EE   HHHHHH          HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      D D                                                                                              
CARBOHYD:                                                     N                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTADLVSFTLIVGIFVLQKWRLGGIRSYNPEQIMLSAAVRRTSRDVSIMKEKLIFSEISDGVEVSDVLSVCSDNSYDTYANSTATPVGPRGGGSHTKTLI 600
gnomAD_SAV:     STE    NVVM   LFR CH D TQ H      #R TMHW  W I V   Q     V NSL   N   I     C A     V     Q   NY    K
Conservation:  2234225222422341225241111000101000001000001100000000110000010000000000000000000000000000000000000000
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH           HHHHEEEEEE          EE                               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH                EEEEE       E    E                           E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH            HHHHHHH           EEE                          EE  
DO_DISOPRED3:                                     D      D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                    DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DISULFID:                                                                            C                             

                    
AA:            ERSGR 605
gnomAD_SAV:     Q  C
Conservation:  00000
SS_PSIPRED:         
SS_SPIDER3:         
SS_PSSPRED:         
DO_DISOPRED3:  DDDDD
DO_SPOTD:      DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD