Q8WVM7  STAG1_HUMAN

Gene name: STAG1   Description: Cohesin subunit SA-1

Length: 1258    GTS: 2.837e-07   GTS percentile: 0.009     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 11      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 339      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRIEAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQS 100
gnomAD_SAV:     L      SE  S  SIVY  G N    A  R    # C  W  CAS   QR  R#         E DG KT  RR  K  E       M  M R VI  
Conservation:  7311111111200002222221122210000222000123312221024343011121101001021103213511122402223386545314323232
SS_PSIPRED:                                                              HHH                         HHHHHH      HH
SS_SPIDER3:                                 H                                                      E HHHHHH     HHH
SS_PSSPRED:                                                                                          HHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              
MODRES_P:                             S                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMM 200
PathogenicSAV:                                                         K                                           
gnomAD_SAV:    M      P   E  VT V  V         Q        QS   S                 S I#  S    ## S         Q     RT   H  
Conservation:  5535564354147615686864856365565536525644322405534556646664365885324831987971658663255664874546484666
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     E  HHHH   HHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H     HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH    EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                    DD       DD DD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY 300
PathogenicSAV:              R G   R                                                                                
gnomAD_SAV:      I                       V           K                  TT    S                      T   V         
Conservation:  6666989589579379998999966969846866562677454346466764475352125633264736437448431522463653355564365265
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHEEE H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDD                                   
DO_SPOTD:                                                            DDDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:                                                       DDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLI 400
PathogenicSAV:                                 Q                 W                     Q   C      H                
gnomAD_SAV:      #V    TV         T              A   V  M             T   S# V                       D       Q LIV 
Conservation:  6845677953758833356335632585645776488576866479966762455475114542167599646865663653575525533453474343
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWE 500
PathogenicSAV:                                                                              P                      
gnomAD_SAV:    FY T   V I       Q        L    R    R  L TR          K    C#    FK                     S            
Conservation:  3243442852576415555984456958369847734444211114225112323430213313453560944344452533757765753311396584
SS_PSIPRED:    HH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH    H  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH  HHH  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDD                                         
DO_IUPRED2A:                                                    DDDDDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD 600
gnomAD_SAV:     TR      SLK       C     M  # SIVHE           ISR       G I     K  S R FV#  V  T    VVV          C  
Conservation:  2533484222010332433255238586454444564545993685336634626666393573253841632368188496416236635894462775
SS_PSIPRED:    HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           E   HHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHH    HHHHHHHH HHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDD   D             DDDDDDDDDDDDDDDD DD                                        
DO_SPOTD:                                                DDDDDDDDDDDDDDDDD                                         
DO_IUPRED2A:              DDD  DD                         DDDDDDD   DDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTS 700
gnomAD_SAV:                 E     V #I   QI   I  P    CG  R     #R   G  Q H       Q I    #   QE A  V  V S  P      T
Conservation:  7626343142557437734431541374513897366426126435312423383153355454332272236234634422243223234153845454
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FHNAHDLTKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLM 800
gnomAD_SAV:       T G     VS S  S   #RT    VA  V M          I       V C   D       M# # S L  H   SI SSLRQ V   F  F  
Conservation:  7668987539454123336912524331552443336458366367927433252011732220844144072348115514021163656935889386
SS_PSIPRED:    HHHH       HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH        HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH       HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                             S                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY 900
gnomAD_SAV:    #     V  S D  H  L          I N   E     E        A      D             T        S          #      S  
Conservation:  6477411143350311515165019735641962387923333411333211246303332653552666254586542764503544567394437366
SS_PSIPRED:    HHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH    HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH HHH   H
SS_SPIDER3:    HHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    H
SS_PSSPRED:    HHHH                  HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_SPOTD:                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                          
DO_IUPRED2A:                                              DDDDDDDDDDDDDDD                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPN 1000
PathogenicSAV:                                                                               R                     
gnomAD_SAV:    D            MA                   I V #S              M  H            *   G               PR    L   
Conservation:  6888695556383366435455744784366333222240225233226245766966768889696465865564666476684832221021114413
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH  H    HHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                      BDDDDDDDDDD                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAFLEVLSEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLN 1100
gnomAD_SAV:         I            R  I         K #T T G I                              N            R  QID   M      
Conservation:  4287134557835855386745517733522339231344193563185489523276721731542103111322123122211542133320221631
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                                               
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                                                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH                                                 
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                        D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                   S  S                           S       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED 1200
BenignSAV:                                    H                                                                    
gnomAD_SAV:     S  V        VA  A A  Q SIQ ## H P ADY      E VNTL I MP    L     SQ   I V  #  K VM     AP           
Conservation:  1132211241021133423221422353232343221343333266222233644661345433312341011111212112211055324266724234
SS_PSIPRED:                                                                 HHHH                    HH          HHH
SS_SPIDER3:                         H                                         HH                                 H 
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDD DDD DDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        
AA:            VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF 1258
gnomAD_SAV:         Q    NT       T         Q  SG         T V K ET     V 
Conservation:  1222434424211832684433577575643110211000012211112222212213
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHH                                 HHHH          
SS_SPIDER3:    H         H                     H          HH             
SS_PSSPRED:         HHHHH                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD