Q8WVT3  TPC12_HUMAN

Gene name: TRAPPC12   Description: Trafficking protein particle complex subunit 12

Length: 735    GTS: 2.508e-06   GTS percentile: 0.809     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 466      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEDAGGGEETPAPEAPHPPQLAPPEEQGLLFQEETIDLGGDEFGSEENETASEGSSPLADKLNEHMMESVLISDSPNSEGDAGDLGRVRDEAEPGGEGDP 100
gnomAD_SAV:    V  S SS#QI VAV LNT#* TL #  EFP R  INNI E K    # K T ##W LPT E S QITDN  NFEAS  Q NPSH    QA P        
Conservation:  5410121011000110001022211112122356589753335255333324434133256737569976368876366633554423332123031010
SS_PSIPRED:                            HH        EE                                                                
SS_SPIDER3:                                                                 H HHH                    H             
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GPEPAGTPSPSGEADGDCAPEDAAPSSGGAPRQDAAREVPGSEAARPEQEPPVAEPVPVCTIFSQRAPPASGDGFEPQMVKSPSFGGASEASARTPPQVV 200
gnomAD_SAV:     L LV I   T KDE N S K S   NR  Q     C#  C  VTHR** L  GV       L HP     R   D P#M      DT  GA SIL RLE
Conservation:  0103111210112110101112011110211221011000110000000112225357699885421221234465564588875412112215115434
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S                                                                          S                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QPSPSLSTFFGDTAASHSLASDFFDSFTTSAFISVSNPGAGSPAPASPPPLAVPGTEGRPEPVAMRGPQAAAPPASPEPFAHIQAVFAGSDDPFATALSM 300
gnomAD_SAV:      RT PCR  RE#TT QFFP     #SA YS  Y   H#  PLVST   LF#LSR KEH# SM V RL  PVS  PLD S#   V      #L T SVGV
Conservation:  6768686389362122344746988898344759669958323122114423321110111222112122122212325654565592646969756853
SS_PSIPRED:                        HHH  HH                                                    HHHHHHH              
SS_SPIDER3:                                                                                   HHHHHHH        HH    
SS_PSSPRED:                                                                                     HHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD       D             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD              DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEMDRRNDAWLPGEATRGVLRAVATQQRGAVFVDKENLTMPGLRFDNIQGDAVKDLMLRFLGEKAAAKRQVLNADSVEQSFVGLKQLISCRNWRAAVDLC 400
BenignSAV:     G                                                                                                   
gnomAD_SAV:    G  N#SSY# I #   C#IVWD V *#HS  #  EK  P    T ESTK       IFC  DK TTGN *G   E    P A *        *   M   
Conservation:  8635783978686329523824456642423335333559999799967798977774866974652784763626846541984595235555444553
SS_PSIPRED:     HHHHHH      HHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHH HHHHHHH           HHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHH        HHHHHHHHHH                            HHHHHHHH   HHHHHH     H H     HHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHH             HHH                            HHHHHHHHHH  HHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          D      D                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDD                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GRLLTAHGQGYGKSGLLTSHTTDSLQLWFVRLALLVKLGLFQNAEMEFEPFGNLDQPDLYYEYYPHVYPGRRGSMVPFSMRILHAELQQYLGNPQESLDR 500
gnomAD_SAV:    RC   T S*S S  E P   M        I  VV   M    STD   *A R       * K  TPLC  C    A  LTLV RT    C ES   #   
Conservation:  4365566856445355344843433367646555745746557753736377456596766665724777567745667653667653767346755777
SS_PSIPRED:    HHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH             EE               HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH  H          E                 H EEEEEEHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH          EE                HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHKVKTVCSKILANLEQGLAEDGGMSSVTQEGRQASIRLWRSRLGRVMYSMANCLLLMKDYVLAVEAYHSVIKYYPEQEPQLLSGIGRISLQIGDIKTAE 600
BenignSAV:                                                                          L                              
gnomAD_SAV:        M   G        # G  SS  #MIR  G#VCV#    CR Q I  I        YC V M VCNL   HHSG K   V S SW    L# #  G 
Conservation:  9814533812641584274688632142436543333176346645335535566535655468733534433425342255554478559957664365
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
DO_DISOPRED3:                        DDDDDDDDDDD                                                                   
DO_SPOTD:                         DDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_IUPRED2A:                          D D                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KYFQDVEKVTQKLDGLQGKIMVLMNSAFLHLGQNNFAEAHRFFTEILRMDPRNAVANNNAAVCLLYLGKLKDSLRQLEAMVQQDPRHYLHESVLFNLTTM 700
PathogenicSAV:                           V                                                                         
gnomAD_SAV:         A EI    G  RDE  AS   V   RR S VV S S    V    S  TLT SDTVLR       N   W#   #ARR ASR* PGTMF  V  R
Conservation:  3553366312212121001314445578638666453685238136643482646436656555554636646434543433217122256557767646
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:           DDDD DDD                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30     
AA:            YELESSRSMQKKQALLEAVAGKEGDSFNTQCLKLA 735
gnomAD_SAV:    *#    Q V     QP  ITSQD  GL I* FEVT
Conservation:  44664658266873995646144564553363432
SS_PSIPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHH       HHHH  
SS_SPIDER3:    HHH     HHHHHHHHHHHH         HEHE  
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                     
DO_SPOTD:                                         
DO_IUPRED2A: