Q8WWI5  CTL1_HUMAN

Gene name: SLC44A1   Description: Choline transporter-like protein 1

Length: 657    GTS: 1.479e-06   GTS percentile: 0.439     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 263      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGCCSSASSAAQSSKREWKPLEDRSCTDIPWLLLFILFCIGMGFICGFSIATGAAARLVSGYDSYGNICGQKNTKLEAIPNSGMDHTQRKYVFFLDPCNL 100
gnomAD_SAV:           T    N  Q    Q  C Y  TS  Q  M   T   Y     V    T   M   N  E     I IE  T   T    S W C#   NL S 
Conservation:  2222222222220003343643252477226534613641762252444223542156226355464356336123112027624330333455644613
STMI:                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH                               EEEEE    H
SS_SPIDER3:       E                HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHEE        E                     EEEEE     H
SS_PSSPRED:                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                  D                    
LIPID:          G                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLINRKIKSVALCVAACPRQELKTLSDVQKFAEINGSALCSYNLKPSEYTTSPKSSVLCPKLPVPASAPIPFFHRCAPVNISCYAKFAEALITFVSDNSV 200
gnomAD_SAV:       TW  E AVVY  T ST  RR RNN R L KT        S  S          AF  #   TV  SL#   H    K# Y  E  K P A  G S I
Conservation:  3211032142378841971136133145306400356086162311116201112103883587338344546477392222874163133333635231
SS_PSIPRED:    HHH       EEHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH                                               HHHHHHHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:    HH       EEEEHE   HHHH HHHHHHHHHHH   EEE                                H         HHHHHHHHHHHHH   HH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                                             HHHHHHHHHHHHHHH   HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHRLISGVMTSKEIILGLCLLSLVLSMILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVLWWLYAKQRRSPKETVTPEQLQIAEDNLRALLIYAISATVFT 300
gnomAD_SAV:            IN    V     V    AI #         I M N M   #HS   SPS    M    GS S   LI  E  RVQ   GV F    L AAI 
Conservation:  4343546533254253684365556633443354563156525432344364433444578463321011221011011201123022553363246334
STMI:                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VILFLIMLVMRKRVALTIALFHVAGKVFIHLPLLVFQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGSPVQNEQGFVEFKISGPLQYMWWYHVVGLIWISEFIL 400
gnomAD_SAV:       # M    H C S       ITV   LY #     S  SS V I    S* V F S  A  G#I H R    LR        #L  A D   V    I
Conservation:  4454234333634323342663543423122736236744652263357327325653674351411310514261202222343467347659654856
STMI:          MMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E     EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ACQQMTVAGAVVTYYFTRDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMYIHSQLKGKENACARCVLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNA 500
gnomAD_SAV:      R    VV     C I V K W SIS  V  Y  VH    M G    VV S  ML#   L   R       V   Y  E    G        D  T SV
Conservation:  5774445555452366475421460155536311522595994578665533444983362243217324341256223436065325423360265535
STMI:          M                                                                                                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHEE          HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHEEEEEEE         HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YTATAINSTNFCTSAKDAFVILVENALRVATINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQQDYTVWVLPLIIVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLC 600
gnomAD_SAV:    FA      A         L F      Q  AVI   Y VS      MA TI  T T V S   N #     P VAF V  V T  L  T  T   L    
Conservation:  5343344452442532541043233302112322263533645433543363536453555333422934765544364443654686455344433649
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             
SS_PSIPRED:      HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH      HHHHHHHHHHHH HHHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50       
AA:            FAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAMKEAGKGGVADSRELKPMASGASSA 657
BenignSAV:                                                A             
gnomAD_SAV:    SGT         R   C     I      G          IT F    LL LR   T
Conservation:  464414355851344655331421331143410000000000120322322222222
SS_PSIPRED:    HHH                HHHHHHHHHHHHHHHHH                     
SS_SPIDER3:    HHH                HHHHHHHHHHHHHHHH          E E         
SS_PSSPRED:    HHHHH          EE  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH          
DO_DISOPRED3:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                            
MODRES_P:                                                         S