Q8WXA9  SREK1_HUMAN

Gene name: SREK1   Description: Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1

Length: 508    GTS: 6.737e-07   GTS percentile: 0.094     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 212      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNIATLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAG 100
gnomAD_SAV:     K P        M   #    F  T  G   L      TS  IH      TV   M     G    M S  S     M     V   T        W T 
Conservation:  5479699599997957254335446734974394337464444553565533333333333333333333396769555979677753553333333333
SS_PSIPRED:                                            HHHH             HHHHHHHH EEE          HHHHHHHHHHH   EEEEE  
SS_SPIDER3:                            E         H   HHHHH              HHHHHHHH EEEE         HHHHHHHHHHH  E EEEEEE
SS_PSSPRED:                                            HHH               HHHHHHHH EEE         HHHHHHHHHHH  EEEEEE  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:          D  D                                    DDD DD DDDD             D                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKS 200
gnomAD_SAV:     D              S   #         RG L      S           HS   A Q    Q #D        V   TR  S G #SQ C  AC   
Conservation:  3335933333333333333333333333333333397994755755593775755597799797776997779979977534432644339324355627
SS_PSIPRED:           EEEEEE     HHHHHHH   EE     EE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        
SS_SPIDER3:          EEEEEEE  H HHHHHHHH    E                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
SS_PSSPRED:           EEEEEE    HHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                     DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DD DDD           D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                            S            S                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSHSRDKRKDTREKIKEKERVKEKDREKEREREKEREKEKERGKNKD 300
gnomAD_SAV:      T  F    R LH     GF    C TR E H    L   C Q    W    H R W       *#M   K       G   #KG QH   E PD   #
Conservation:  6567374444779333377695579395355647979935779494776797739436666442447333333333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:                                                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:                                                                      HHH HHHH      HHHHHHHHHHH H       
SS_PSSPRED:                                HHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDKEREKDREKDKEKDREREREKEHEKDRDKEKEKEQDKEKEREKDRSKEIDEKRKKDKKSRTPPRSYNASRRSRSSSRERRRRRSRSSSRSPRTSKTIK 400
gnomAD_SAV:    W     EYW   N#  T#  W R    #Q R   E      DG R#  TDT    R      ASL G #VLQIFH     SH T N     L G      
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333744546664474379967339776666767275677277427
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHH               
SS_SPIDER3:        H            HHHHHH H       H       H                                                           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                    T                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKSSRSPSPRSRNKKDKKREKERDHISERRERERSTSMRKSSNDRDGKEKLEKNSTSLKEKEHNKEPDSSVSKEVDDKDAPRTEENKIQHNGNCQLNEEN 500
gnomAD_SAV:     T#PI  Y      R   I     R      * C PFV  NYD  NW    KN R  F D  YSE # ARL T  G  # ST  KK  RDH S HPS   
Conservation:  7739779799364665674263353233335463537356133647354627523324655542462321124333432126204203730544233263
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHH                                                 HHHHHH         HH
SS_SPIDER3:                               HHHHH                 HH                                                 
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH       HHHHH     HHHHH                    HHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       
AA:            LSTKTEAV 508
gnomAD_SAV:     CIT    
Conservation:  21131523
SS_PSIPRED:    HHHHHH  
SS_SPIDER3:            
SS_PSSPRED:            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD